Vastus intranasaalsele Lactococcus Lactis W136 probiootilisele toidulisandile refraktaarses CRS-is on seotud mitte-tüüpi 2 põletiku modulatsiooni ja epiteeli regeneratsiooniga

Põhjendus:

Oleme varem dokumenteerinud, et kroonilise rinosinusiidiga (CRS) patsientidel, kes ei allu operatsioonile, parandab probiootilise bakteri Lactococcus lactis W136 intranasaalne manustamine siinus-spetsiifilisi sümptomeid, SNOT-22 ja limaskesta aspekti endoskoopial, millega kaasneb siinuste patogeenide arvu vähenemine ja kaitsvate bakterite arvu suurenemine. Käesolevas töös uuritakse nende vaatluste aluseks olevaid molekulaarseid mehhanisme, kasutades siinuse limaskesta transkriptoomikat.

Lactococcus lactis on probiootikum, mis suudab säilitada inimese tervist, reguleerides soolestiku mikrofloorat ja tugevdades immuunsust. Lactococcus lactis'e ja immuunsuse vaheline seos on järgmine:

1. Aidake tugevdada immuunsust: Lactococcus lactis võib soodustada soole limaskesta barjääri terviklikkust ja immuunvastust ning soodustada soole limaskesta immuunrakkude proliferatsiooni ja aktiveerumist, tugevdades seeläbi inimese immuunsust.

2. Vähendage allergilisi reaktsioone: kui immuunsüsteem on tasakaalust väljas, põhjustab see allergilisi reaktsioone. Lactococcus lactis võib aga vähendada allergiliste reaktsioonide teket, reguleerides organismi immuunrakkude aktivatsiooniseisundit.

3. Resistentsus patogeenide suhtes: Lactococcus lactis võib pärssida kahjulike bakterite ja viiruste kasvu ja paljunemist konkurentsi välistamise ja antibakteriaalsete ainete tootmise kaudu, tugevdades seeläbi inimese immuunsust.

Kokkuvõtteks võib öelda, et Lactococcus lactis'e esinemine mängib inimese immuunsuses olulist rolli. Inimesed saavad edendada immuunsuse tugevdamist, tarbides L. lactis'e rikkaid toite või lisades L. lactis'e probiootikume. Seetõttu peame parandama immuunsust ja mõistma immuunsuse tähtsust. Cistanche võib tugevdada immuunsust. Cistanche sisaldab mitmesuguseid bioloogiliselt aktiivseid koostisosi, nagu polüsahhariide, seeni ja Huanglit. Need koostisosad võivad stimuleerida immuunsüsteemi erinevaid rakke ja suurendada nende immuunaktiivsust.

Klõpsake Cistanche'i kasulikkust tervisele

Meetod:

Epiteeliharjad, mis koguti perspektiivselt alauuringuna. lactisW136 kliinilisi uuringuid kasutati epiteeli reaktsioonide uurimiseks mikrobioomi täiendamisele, kasutades geeniekspressiooni analüüsi hüpoteesivaba bioinformaatilist analüüsi. Proovid kahekümne neljalt CRS-iga patsiendilt, kes ei allu meditsiinilisele ja kirurgilisele ravile, koguti prospektiivselt kliinilise uuringu käigus, milles hinnati 14 päeva kaks korda ööpäevas nina loputamist 1,2 miljardi CFU elusate L. lactis W136 probiootiliste bakteritega (CRSwNP {{8}). }, CRSsNP=7). Endoskoopiliselt juhitud siinuseharjad koguti esialgse uuringu osana, harjad tehti vahetult enne ja pärast ravi. Pärast RNA ekstraheerimist hinnati proove Illumina HumanHT{10}} V4 BeadChipi abil. Arvutati diferentsiaalne geeniekspressioon ja potentsiaalselt seotud protsesside tuvastamiseks viidi läbi raja rikastamise analüüs.

Tulemused:

Erinevalt tuvastatud transkripte ja radu hinnati CRSwNP ja CRSsNP üldpopulatsiooni ning kliiniliste fenotüüpide jaoks. Ravile reageerimise mustrid olid kõigis rühmades sarnased, hõlmates immuunsuse ja epiteelirakkude reguleerimise teid. Need sarnanevad paranemismustritele, mida täheldati pärast edukat ravi endoskoopilise siinusoperatsiooni või asitromütsiiniga.

Järeldus:

Geeniekspressiooni profiilide koostamine pärast elusate bakterite haigestunud siinuse epiteelile kandmist tõstab esile CRS-iga seotud põletiku-mikrobioomi-epiteeli barjääri telje mitme komponendi mõju. Need mõjud näivad hõlmavat nii epiteeli taastamist kui ka kaasasündinud ja adaptiivse immuunsuse moduleerimist, toetades potentsiaalset huvi siinuse epiteeli ja mikrobioomi sihtimise vastu potentsiaalsete CRS-ravina.

Sissejuhatus

Siinuse õõnsuse homöostaasi tagab epiteeli barjääri pidev interaktsioon residendist mikrobiotaga, mis ei võimalda mitte ainult immuunvastuseid, vaid ka epiteeli diferentseerumist ja regeneratsiooni. Krooniline rinosinusiit (CRS) on ebakindla päritoluga ülemiste hingamisteede põletikuline seisund, mida iseloomustab normaalse homöostaasi häire, millele järgneb koepõletik, mikrobioomi düsbioos ja epiteeli düsfunktsioon (1) Iseloomulikud muutused hõlmavad infiltratsiooni 2. tüüpi ja erineva seguga. 1. tüüpi / 17. tüüpi põletikulised rakud ning epiteeli funktsiooni ja regeneratsiooni kahjustus, millega kaasneb kaasnev mikrobioomi düsbioos (2). Seotud on mitu patogeeni, kuid Staphylococcus Aureus on sagedane ja probleemne patogeen, eriti CRSwNP ja eakate populatsiooni puhul (3). Kuigi haiguse arenguni viinud esialgsed sündmused on veel tuvastamata, arvatakse, et nende koemuutuste püsimine peegeldab kolme kaitsesamba talitlushäireid, mis toimivad epiteeli-põletiku-mikrobioomi teljena, mis tagab siinuseõõne ja selle tervise. epiteeli vooder.

Tekkiv kontseptsioon, et edukas haiguse juhtimine mõjutab telje kõiki kolme komponenti kas otseselt või kaudselt allavoolu mõjude kaudu, viitab sellele, et kõik kolm komponenti on CRS-ravi sihtmärgid. Kuigi immuunpuudulikkus on pikka aega olnud ravi peamine sihtmärk (5), on üha ilmsem, et telje muude komponentide, näiteks epiteeli, sihtimine võib samuti edukalt haigust moduleerida (6) Näiteks edukas ravi ElexacaftorTezacaftor-Ivacaftoriga. Trikafta), tsüstilise fibroosi (CF) ravis kasutatav uus ravim, mis taastab CFTR-i puuduliku ekspressiooni, on seotud CF-ga seotud põsekoopahaiguse peaaegu täieliku lahenemisega, mida täheldatakse sümptomite paranemise ja peaaegu normaalse epiteeli aspekti taastumise kaudu. isegi samaaegse antibiootikumravi puudumisel (7).

Arvestades epiteeli funktsiooni moduleerimise edukust, võib mikrobioomi moduleerimine seega esindada teist strateegiat ja nina kaudu manustatavate probiootiliste bakteritega on varem pakutud uudset vahendit CRS-i ravis (8, 9). Oleme varem näidanud, et Lactococcus lactis W136 bakterite ninasisene manustamine on hästi talutav ja parandab CRS-iga patsientide sümptomeid, limaskesta endoskoopilist aspekti ja elukvaliteeti (9). Täheldati ka mikrobiome moduleerivaid toimeid, mille puhul suurenes Dolosigranulosum Pigrum, oletatav kasulik patobiont, mis hiljuti tuvastati nii täiskasvanutel kui ka lastel kui nina, ninakõrvalurgete, ninaneelu ja adenoidi tervisega seotud bakteriliik. Alarühmade analüüs vastavalt kliinilisele fenotüübile näitas Staphylococcus aureuse arvukuse vähenemist CRSwNP-ga patsientidel ja mitme Pseudomonas Aeruginosa tüve vähenemist CRSsNP-s (9).

Kuigi need intrigeerivad tähelepanekud viitavad mikrobioomi täiendamise mõjule CRS-ile, tuleb nende muutuste aluseks olevaid mehhanisme veel kirjeldada. Seega soovisime täiendavalt iseloomustada nende muutuste molekulaarseid mehhanisme koe tasandil, uurides probiootilise L. lactis W136 raviga indutseeritud geeniekspressiooni muutusi siinuse limaskestas.

meetodid

Osalejad ja õppekujundus

L. lactis W136 kliinilise uuringu alamuuringuna prospektiivselt kogutud epiteeliharjamisi kasutati epiteeli reaktsioonide uurimiseks mikrobioomile, kasutades geeniekspressiooni analüüsi hüpoteesivaba bioinformaatilist analüüsi. CRS-uuringus kasutatavat L. lactis W136 on üksikasjalikult kirjeldatud mujal (9). Health Canada andis heakskiidu elusate L. lactis W136 bakterite ninasiseseks manustamiseks (Health Canada registreerimisnumber: 191920) ja CHUMi institutsionaalselt läbivaatamisnõukogult ja eetikakomiteelt (registreerimisnumber 12.288) enne uuringu läbiviimist (Clinicaltrials.gov identifikaator: NCT040481740481). ). 24 CRS-iga patsienti ei allunud eelnevale meditsiinilisele ja kirurgilisele ravile, said 14-päevase kahekordse siinuse loputamise kuuri, mis sisaldas 1,2 × 109 CFU elusat L. lactis W136. Ükski patsient ei olnud eelneva 30 päeva jooksul saanud suukaudseid kortikosteroide ega paikset või süsteemset antibiootikumravi. Sümptomite leevendamiseks oli lubatud ainult soolalahusega niisutamine. Välja arvatud patsiendid<18 years, CF, with technical reasons for endoscopic sinus surgery (ESS) failure, active sinus infection with purulence, pain, and/or hyperthermia, or with immune suppression from disease or medication.

Epiteeli harjamine koguti endoskoopilise kontrolli all, kasutades mao tsütoloogiaharja eesmise süvendi tasemel enne esimest probiootikumi manustamist kuupäeval D{0}} ja järgmisel päeval pärast viimast ravi kuupäeval 14. Kogu RNA ekstraheeriti RNeasy Mini Kitiga (QIAGEN, Toronto, On, Kanada). Geeniekspressioon viidi läbi Genome Quebeci innovatsioonikeskuses (Montreal, Qc, Kanada), kasutades Illumina HumanHT-12 V4 BeadChipi (Illumina, San Diego, CA, Ameerika Ühendriigid).

Geeniekspressiooni andmete analüüs

Toores Illumina sondi andmed eksporditi BeadStudiost ja kontrolliti nende kvaliteeti. Eeltöötlus ja statistiline analüüs viidi läbi, kasutades R statistilist keelt ja Bioconductori tarkvarapakette, nagu on kirjeldanud Huber et al. (10). Rakendati kvantiilne normaliseerimine, millele järgnes log2 teisendus.

Diferentsiaalne geeniekspressioon

Iga sondi jaoks paigaldati seotud lineaarne mudel, kasutades Bioconductori LIMMA paketti koos doonori blokeerimisteguriga. LIMMA pakett rakendab modereeritud t-testi, mida kasutatakse geeniekspressiooni võrdlemiseks enne ja pärast L. lactis'e intranasaalset manustamist vastavalt D0 ja D14 ajal. Saadud võrdluse P-väärtusi kohandati mitmekordseks testimiseks vastavalt Benjamini ja Hochbergi meetodile (11). See meetod kontrollis valetuvastussagedust (FDR), mille väärtuseks määrati 0.05.

Raja rikastamise analüüs

Geenikomplekti rikastamise analüüs (GSEA) viidi läbi, kasutades Bioconductori paketti FGSEA, kasutades geenikomplekte molekulaarsest allkirjade andmebaasist (MsigDB, http://www.broad.mit. edu/gsea/msigdb): Hallmark (h.all.v5. 0.symbols.gmt) (12).

GSEA-ga seotud radade P-väärtusi kohandati mitme testiparanduse jaoks FDR-i piirväärtustega 0,05. GSEA viidi läbi selleks, et hinnata, kas teadaolev bioloogiline rada või üksikute geenide komplektid olid geenide seas, mis olid diferentsiaalse geeniekspressiooni analüüsi järgselt hinnatud modereeritud t-testiga.

Tulemused

Nagu eelnevalt kliinilises uuringus kirjeldatud, lõpetasid kõik 24 patsienti, kes said L. lactis W136 (joonis 1) (9). Oleme kaasanud patsiendid, kellel on püsivad CRSsNP või CRSwNP sümptomid ja nähud, hoolimata tehniliselt piisavatest operatsioonidest ja maksimaalse meditsiinilise ravi jätkuvast kasutamisest, sealhulgas operatsioonijärgselt suures koguses budesoniidi loputamist ("refraktaarne" CRS). Populatsiooni algtaseme karakteristikud kirjeldasid Endam et al. (9). Üldiselt parandas 14 päeva kestnud ravi L. lactisega siinuspetsiifilist sümptomatoloogiat, SNOT-22 skoori ja limaskesta aspekti endoskoopias koos kasulike mikrobioomi muutustega. Diferentsiaalset geeniekspressiooni ravieelsete ja -järgsete tingimuste vahel hinnati paarisproovide puhul ainult (i) kõigis CRS-i (N=20), (ii) CRSwNP alarühmas (N=16) (iii) CRSsNP alarühmas (N).=4) ja (iv) vastajad (N=10) (nagu on määratletud SNOT-22 skoori vähenemisega 8,9 või rohkem). Ravile reageerijate hulgas oli nii CRSwNP (N=8) kui ka CRSsNP (N=2) patsiente. Transkriptoomiline hindamine näitas raviga seotud erinevusi. Üksikud geenitranskriptid, mille FDR oli väiksem või võrdne 5 protsenti ja suurem või võrdne 1.{22}}ekspressiooni kordne muutus täheldati ainult rühmades "Kõik CRS" ja CRSwNP alarühmas (tabel 1 ja täiendav materjal). Võrreldes CRSwNP-ga muutus väga väheste geenide ekspressioon pärast ravi CRSsNP-s märkimisväärselt, arvatavasti selle alarühma üksikisikute vähese arvu tõttu. Ülemise erinevalt ekspresseeritud geeni geeniekspressiooni soojuskaardid (täiendavad joonised S1–S4) näitavad sarnaseid diferentseeritud geeniekspressiooni mustreid kõigi populatsioonide jaoks, mis viitab ühisele reageerimismustrile.

Viidi läbi raja rikastamise analüüs, et tuvastada võimalikud ravivastuse aluseks olevad mehhanismid (joonis 2 ja täiendav joonis S5). Kõigis rühmades tuvastati märkimisväärselt seotud rajad ja selgus, et ravi Lactococcus Lactis W136-ga kutsus esile rakutsükli, kasvu ja proliferatsiooni radade ülesreguleerimise. Kuigi rikastatud tunnusteed olid rühmade vahel sarnased, olid erinevused olulisemad KÕIKides CRS-i ja CRSwNP-rühmades. Eelkõige näib tavaline mehhanism hõlmavat rakutsükli ja transkriptsiooni ülesreguleerimist (E2F sihtmärgid, epiteeli-mesenhümaalne üleminek, G2M kontrollpunkt, MYC sihtmärgid, valgu sekretsioon, mitootiline spindel), reaktiivsete hapnikuliikide (ROS) regulatsioon (hüpoksia, ROS rada, oksüdatiivne fosforüülimine). Immuunsuse modulatsioonile viitas ka signaaliradade (PI3K-AKT-MTOR signaalimine, MTORC1 signaalimine, TGF beeta signaalimine) ülesreguleerimine, millega kaasnes adaptiivsete (allografti äratõukereaktsiooni) ja tüübiga 1- seotud immuunvastuste (interferoon alfa) vähenemine. reaktsioon, gamma-interferoon). Diferentsiaalne ekspressioon valitud olulistes radades näitab epiteeli paranenud uuenemise järjekindlat mustrit vastuseks probiootilisele ravile. Selle transkriptsioonilise signatuuri tugevdamine populatsioonis, mis piirdus SNOT-22-reageerijatega, näitas, et need olid seotud täheldatud kliiniliste paranemistega. Teed olid sarnased CRSsNP ja CRSwNP fenotüüpide vahel, mis viitab ühisele toimemehhanismile mõlemas populatsioonis (tabel 2). Identifitseeritud rajad on lõdvalt rühmitatud rakutsükli ja diferentseerumise, reaktiivsete hapnikuliikide (ROS) regulatsiooni, DNA parandamise ja põletikuga seotud radade alla. Vaatamata väikestele rühmasuurustele, mis takistavad analüüsi, näitavad tulemused rühmade vahel ühtlast reageerimismehhanismi.

Arutelu

Uurime transkriptoomika abil mehhanisme, mis toetavad vastust elusa L. lactis W136 intranasaalsele manustamisele refraktaarse CRS-iga patsientidel. See täiendab meie varem teatatud materjali mikrobioomi muutuste kohta, mida täheldati kaks korda päevas 1, 2 miljardi CFU Lactococcus Lactis W136 manustamisega otse nina- ja siinuseõõnsustesse (9). Martenssoni jt eelnev uuring. (8) teatas, et mesilastelt saadud laktobatsillide segu ninasiseselt manustati, proovide vahendajates ega sinonasaalses mikrobioomis muutusi ei täheldatud. Hiljuti talusid CRS-i isikud hästi intranasaalselt manustatud Lactobacillust, tulemuste kliiniline või mehaaniline hindamine puudus (9).

Käesolevas töös kasutatakse transkriptoomilisi meetodeid, et mõista paiksete probiootikumide mõju mehaanilist alust nina- ja siinuse pinnale. Kirjeldame, et L. lactis'e manustamine on seotud diferentsiaalse geeniekspressiooniga, mis hõlmab bioloogilisi radu, mis ei ole seotud mitte ainult immuunsuse, vaid ka epiteeli regulatsiooniga, nagu viitab radade tuvastamine, mis aitavad kaasa rakkude proliferatsioonile, ellujäämise signaalimisele ja DNA kahjustuste parandamisele. . L. lactis W136 probiootilise raviga seotud transkriptoomilised muutused viitavad seega soodsale mõjule rakutsükli progresseerumisele ja epiteeli funktsiooni taastamisele.

Rakuline ja struktuurne terviklikkus on epiteeli barjääri sobivaks toimimiseks hädavajalik. Oleme varem dokumenteerinud, et epiteeli reaktsioon haavadele on CRS-is halvenenud (9). Selles kliinilises uuringus täheldatud paranemised, mis viitavad epiteeli paranenud regeneratsioonile ja paranemisele, võivad kajastada nende protsesside paranemist.

Teatame, et immuunfunktsioon oli pärast ravi järjekindlalt alareguleeritud, kusjuures täheldati interferooni vastuse, T-rakkude infiltratsiooni ja aktivatsiooni ning allografti reaktsiooni vähenemist. Immuunmodulatsioon on probiootikumide omadus (13), mistõttu pole üllatav, et seda siin demonstreeritakse. Alfa- ja gamma-interferooni signaalide moduleerimise signaal võib kajastada põletikulise CRS-vastuse 2. tüüpi mittekuuluvate komponentide vähenemist (14), kus püsivalt kõrge interferooni tase avaldab kahjulikku mõju, kahjustades järgnevate immuunvastuste tugevust ja koordineerimist ning takistades. rakufunktsioon (15). Need muutused võivad aidata kaasa CRS-i epiteeli ja mesenhümaalse ülemineku tunnuste kujunemisele (16). Lisaks seostatakse 1. tüüpi põletikuliste vahendajate kõrget taset hingamisteede epiteelirakkude epiteeli paranemise funktsionaalse defektiga (17).

See on kooskõlas meie tulemustega. L. lactis'e manustamist seostati ka diferentsiaalse geeniekspressiooniga, mis hõlmas epiteeli regulatsiooniga seotud bioloogilisi teid, nagu viitas radade tuvastamine, mis aitavad kaasa rakkude proliferatsioonile, ellujäämise signaalimisele ja DNA kahjustuste parandamisele. L. lactis W136 probiootilise raviga seotud transkriptoomilised muutused viitavad seega soodsale mõjule rakutsükli progresseerumisele ja epiteeli funktsiooni taastamisele. Rakuline ja struktuurne terviklikkus on epiteeli barjääri sobivaks toimimiseks hädavajalik (18).

Oleme varem dokumenteerinud, et epiteeli reaktsioon haavadele on CRS-is halvenenud (19). Selles kliinilises uuringus täheldatud paranemised viitavad sellele, et epiteeli paranenud regenereerimine ja paranemine võivad seega kajastada nende protsesside paranemist.

L. lactis W136 probiootikumide lisamise mõju rakkude ja epiteeli funktsioonidele ei olnud oodatud, kuid need on kooskõlas varasemate aruannetega, mis näitavad keratinotsüütide paranenud epiteliseerumist pärast haavamist Lactobacillus rhamnosus GG lüsaadiga kriimustusanalüüsi mudelis. (20) ja meie arenev arusaam CRS-i haigusest. Epiteeli barjäär mängib haigusprotsessis olulist rolli. Lisaks oma rollile patogeenide ja ärritajate füüsilise barjäärina, vastutavad epiteelirakud kaitsereaktsioonide algatamise ja koordineerimise eest (6). Kuna epiteeli regeneratsioon ja paranemine on CRS-iga patsientidel muutunud, viitab geeniekspressiooni suurenemine rakutsükli mitmes aspektis L. lactis'e toidulisandi intranasaalse manustamise kasulikule mõjule epiteelirakkude funktsiooni taastamisele ja rakutsükli progresseerumisele. Neid muutusi täheldati juba pärast 14-päevast ravi võrreldes teistes uuringutes kasutatud ravi pikkusega, mis on neli kuud. Seega eeldatakse, et L. lactis'e pikaajalise lisamise korral on kasulik toime suurem.

Kokkuvõttes näitavad need leiud, et L. lactis W136 manustamine mõjutab mitmeid protsesse, mis ulatuvad kaugemale immuunregulatsioonist, mis viitab mõjule epiteeli barjäärile, mis võib potentsiaalselt moduleerida mikrobioomi koostist.

Õppepiirangud

See uuring ei ole paralleelne rühmakontrollitud uuring ja ainult soolalahusega niisutamisega pole võimalik otsest võrdlust teha. Sellegipoolest seostati kliinilises uuringus ainult soolalahuse kasutamist sissetöötamise perioodil CRS-i sümptomite süvenemisega ja limaskestade seisundi halvenemisega pärast ravimite ärajätmist. Samuti on valimi suurus suhteliselt väike, eriti rühmades "CRSsNP" ja "Responders", mis on väiksemad kui "üldpopulatsioon". Vastuste muster on rühmade lõikes siiski sarnane ja seetõttu ei tohiks tulemusi arvesse võtta.

Lisaks pole andmeid selle kohta, kas soolalahus üksi mõjutab geeniekspressiooni. Kuigi on näidatud, et soolalahusega niisutamine ei mõjuta CRS-i patsientide mikrobioomi koostist (5), ei ole seda geeniekspressiooni võrdluskatses hinnatud. Kuid patsiendid olid 14-päevase sissetöötamisperioodi jooksul saanud juba kaks nädalat ainult soolalahusega loputamist, ilma et sellest oleks olnud mingit kliinilist kasu, seega on ebatõenäoline, et muutused oleksid sekundaarsed ainult soolalahusele. Lõpuks hinnati muutusi juba pärast 14-päevast ravi, mis on lühike raviperiood võrreldes teiste uuringutega, mis on tehtud refraktaarses CRS-is (21). Täheldatud mõjud võivad seega olla pikema manustamise korral suuremad.

Järeldus

Transkriptoomiline hinnang viitab paranemisele pärast elusate bakterite rakendamist haigele siinuse epiteelile tulekindlas CRS-is, mis näib hõlmavat CRS-iga seotud põletiku-mikrobioomi-epiteeli barjääri telje mitut komponenti. L. lactis W136 probiootiline ravi mõjutab nii epiteeli taastamist kui ka kaasasündinud ja adaptiivse immuunsuse moduleerimist, toetades potentsiaalset huvi siinuse epiteeli ja mikrobioomi kui potentsiaalsete CRS-teraapiate sihtimise vastu.

Võta koju sõnum

Transkriptoomiline profiilide koostamine viitab elusa probiootilise Lactococcus lactis W136 bakteri mõjule haigestunud siinuse epiteelile tulekindlas CRS-is, mis ei hõlma mitte ainult I tüüpi põletiku ja mikrobioomi moduleerimist, vaid tähendab ka epiteeli barjääri telje terviklikkuse taastamist.

Andmete kättesaadavuse avaldus

Uuringus esitatud algsed kaastööd on lisatud artiklisse / lisamaterjalidesse, edasised päringud võib suunata vastavale autorile.

Eetikaavaldus

Inimestest osavõtjatega tehtud uuringud vaatasid läbi ja kiitsid heaks Kanada Health Canada elusate L. lactis W136 bakterite intranasaalseks manustamiseks (Health Canada registreerimisnumber: 191920) ning CHUMi institutsiooniline läbivaatamisnõukogu ja eetikakomitee (registreerimisnumber 12.288). katse tulemuslikkus (Clinicaltrials.gov identifikaator: NCT04048174). Patsiendid/osalejad andsid oma kirjaliku teadliku nõusoleku selles uuringus osalemiseks.

Autorite kaastööd

SA-R: Patsientide värbamine, andmete analüüs, kirjanduse ülevaade, käsikirja koostamine. OH: andmete analüüs, kirjanduse ülevaade, käsikirja koostamine. LEM: uuringu ülesehitus, patsientide värbamine, andmete kogumine ja tulemused. AF-M: geenide ja raja ekspressiooniandmete töötlemine ja analüüs. AP: uurimuse kontseptsioon, andmete analüüs, kirjanduse ülevaade, käsikirja koostamine. ARF: andmete analüüs, käsikirja koostamine. MD: uurimuse kontseptsioon, uuringu ülesehitus, andmete analüüs, käsikirja koostamine. Kõik autorid panustasid artiklisse ja kiitsid esitatud versiooni heaks.

Rahastamine

MD: Merck Research Funds, McGilli ülikool, Montreal, Kanada (probiootiline kliiniline uuring), sisefondid. CHUM (ekspressioonianalüüs).

Huvide konflikt

MD: aktsiaomanik, Probionase Therapies Inc. Kliiniliste uuringute rahastamine: Pfizer, AstraZeneca, GlaxoSmithKline ja Sanofi.

Väljaandja märkus

Kõik selles artiklis väljendatud väited on ainult autorite väited ja ei pruugi esindada nende sidusorganisatsioonide või väljaandja, toimetajate ja arvustajate väiteid. Väljaandja ei garanteeri ega kinnita ühtegi toodet, mida selles artiklis võidakse hinnata, või väiteid, mille võib esitada selle tootja.

Täiendav materjal

Täiendav joonis S1. Intranasaalse Lactococcus lactis W136 vastuse transkriptoomiline hindamine kõigil CRS-i patsientidel. Kuumakaart 5 parimast 0 erinevalt ekspresseeritud geenist, mille FDR on < 0,05.

Täiendav joonis S2. Intranasaalse Lactococcus lactis W136 vastuse transkriptoomiline hindamine kroonilise ninapolüüpidega sinusiidi (CRSwNP) alarühmas. Kuumakaart 5 parimast 0 erinevalt ekspresseeritud geenist, mille FDR on < 0,05.

Täiendav joonis S3. Intranasaalse Lactococcus lactis W136 vastuse transkriptoomiline hindamine kroonilise ninapolüüpideta sinusiidi (CRSsNP) alarühmas. Kuumakaart 5 parimast 0 erinevalt ekspresseeritud geenist, mille FDR on < 0,05.

Täiendav joonis S4. Intranasaalse Lactococcus lactis W136 ravivastuse transkriptoomiline hindamine reageerijate alarühmas. Kuumakaart 5 parimast 0 erinevalt ekspresseeritud geenist, mille FDR on < 0,05.

Täiendav joonis S5. Transkriptsiooniline reaktsioon 14-päevasele Lactococcus lactis W136-le. Ravivastuse geenikomplekti ekspressioonianalüüs (GSEA). (a) kõik CRS-i patsiendid, (b) krooniline sinusiit ninapolüüpidega (CRSwNP), (c) krooniline ninapolüüpideta sinusiit (CRSsNP), (d) ravile reageerijad. Diferentsiaalne ekspressioon valitud olulistel radadel näitab epiteeli täiustatud uuenemise järjekindlat mustrit (E2F SIHTMÄRGID, EPITEELI MESENHÜMNE ÜLEMINEK, G2M KONTROLLPOINT, MYC SIHTMÄRGID V1, MYC SIHTMÄRGID V2, VALGU SECRETION, MITOTIC TARGETS V2, VALGU SECRETION, MITOTICN REAS SPINDTHLE), Inc. , UV RESPONSE UP), reaktiivsete hapnikuliikide (ROS) regulatsioon (HÜPOXIA, REACTIVE OXIGEN SPECIES PATHWAY, OKSIDATIVNE FOSFORÜÜLIMINE), signaaliradade aktiveerimine (PI3K AKT MTOR SIGNALING, MTORC1 SIGNALING, TGF BETA signaalide kohanemine ja immuunsignaalide alandamine) (ALLOGRAFT HÜLGÜKKUMINE, INTERFEROON ALFA VASTUS, INTERFEROON GAMMA VASTUS). Kõigil esitatud radadel on FDR < {{10}}.05. Andmed on esitatud normaliseeritud rikastamise skooridena (NES), kus väärtused > 0 tähistavad ülesreguleerimist ja väärtused < 0 tähistavad allareguleerimist, kui võrrelda mittereageerivaid inimesi reageerijatega.

Viited

Täiskasvanute krooniline rinosinusiit. Nat Rev Dis krundid. (2020) 6(1):86. doi: 10,1038/s41572-020-00218-1

2. Kato A, Schleimer RP, Bleier BS. Kroonilise rinosinusiidi mehhanismid ja patogenees. J Allergy Clin Immunol. (2022) 149 (5): 1491–503. doi 10.1016/j.jaci. 2022.02.016

3. Fokkens WJ, Lund VJ, Hopkins C, Hellings PW, Kern R, Reitsma S jt. Euroopa seisukoht rinosinusiidi ja ninapolüüpide kohta 2020. Rhinology. (2020) 58 (lisa S29): 1–464. doi: 10,4193 / rhin20,600

4. Maniakas A, Asmar MH, Renteria AE, Nayan S, Alromaih S, Endam LM jt. Asitromütsiin kõrge riskiga, refraktaarse kroonilise rinosinusiidi korral pärast endoskoopilist siinusoperatsiooni ja kortikosteroididega loputamist: topeltpime, randomiseeritud, platseebokontrolliga uuring. Int Forum Allergy Rhinol. (2021) 11 (4): 747–54. doi 10. 1002/alr.22691

5. Akdis CA. Epiteeli barjääri hüpotees pakub igakülgset arusaamist allergiliste ja muude krooniliste mittenakkuslike haiguste päritolust. J Allergy Clin Immunol. (2022) 149(1):41–4. doi 10.1016/j.jaci.2021.11.010

6. Stapleton AL, Kimple AJ, Goralski JL, Mehdi Nouraie S, Branstetter BF, Shaffer AD jt. Eleksakaftoor-lumakaftoor-ivakaftoor parandab tsüstilise fibroosi sinonasaalseid tulemusi. J Tsüsti kiud. (2022) 21(5):792–9. doi 10.1016/j.jcf.2022.03.002

7. Mårtensson A, Greiff L, Lamei SS, Lindstedt M, Olofsson TC, Vasquez A jt. Mesilase piimhappebakteri mikrobioomi mõju inimese ninasümptomile, kommensaalidele ja biomarkeritele. International Forum of Allergy & Rhinology (IFAR). (2016) 6 (7): 956–63. doi 10.1002/alr.21762

8. Mårtensson A, Abolhalaj M, Lindstedt M, Mårtensson A, Olofsson TC, Vásquez A jt. Lokaalse piimhappebakteriaalse mikrobiomi kliiniline efektiivsus kroonilise rinosinusiidi korral: randomiseeritud kontrollitud uuring. Larüngoskoop uurib Otolaryngoli. (2017) 2 (6): 410–6. doi: 10.1002/lio2.93

9. Endam L, Alromaih S, Gonzalez E, Madrenas J, Cousineau B, Renteria A jt. Lactococcus Lactis W136 intranasaalne manustamine on ohutu kroonilise rinosinusiidiga patsientidel, kellel on varem põsekoopa operatsioon. Front Cell Infect Microbiol. (2020) 10:440. doi 10.3389/climb.2020.00440

10. Huber W, Carey VJ, Gentleman R, Anders S, Carlson M, Carvalho BS jt. Suure läbilaskevõimega genoomianalüüsi korraldamine Bioconductoriga. Nat meetodid. (2015) 12(2):115–21. doi 10.1038/nmeth.3252

11. Benjamini Y, Hochberg Y. Vale avastamise määra kontrollimine: praktiline ja võimas lähenemine mitmekordsele testimisele. JR Stat Soc, B. (1995) 57 (1): 289–300. doi 10.1111/j.{8}}.1995.tb02031.x

12. Korotkevitš G, Suhhov V, Sergušitšev A. Kiire geenikomplekti rikastamise analüüs. bioRxiv. (2019). doi: 10.1101/060012

13. Raheem A, Liang L, Zhang G, Cui S. Probiootikumide moduleeriv toime patogeensete infektsioonide ajal, rõhuasetusega immuunregulatsioonil. Front Immunol. (2021) 12:616713. doi 10.3389/naine.2021.616713

14. Delemarre T, Holtappels G, De Ruyck N, Zhang N, Nauwynck H, Bachert C jt. Oluline neutrofiilne põletik, mis on regulaarne osa raskest 2. tüüpi kroonilisest rinosinusiidist koos ninapolüüpidega. J Allergy Clin Immunol. (2021) 147 (1): 179–188.e2. doi 10.1016/j.jaci.2020.08.036

15. Matarazzo L, Hernandez Santana YE, Walsh PT, Fallon PG. IL-1 tsütokiinide perekond on barjääriimmuunsuse hoidja. Tsütokiin. (2022) 154:155890. doi 10.1016/j. kuni.2022.155890m

16. Li R, Ong SL, Tran LM, Jing Z, Liu B, Park SJ jt. Autori parandus: krooniline IL-1 -indutseeritud põletik reguleerib epiteeli-mesenhümaalse ülemineku mälu fenotüüpe epigeneetiliste modifikatsioonide kaudu mitteväikerakk-kopsuvähi korral. Sci Rep. (2020), 10:377. doi: 10,1038/s{10}}

17. Maillé E, Trinh NTN, Privé A, Bilodeau C, Bissonnette É, Grandvaux N jt. Normaalsete ja tsüstilise fibroosi hingamisteede epiteeli parandamise protsesside reguleerimine TNF-ga pärast vigastust. Am J Physiol Lung Cell Mol Physiol. (2011) 301: L945–55. doi 10.1152/a plunge.00149.2011

18. Hellings PW, Steelant B. Epiteeli barjäärid allergia ja astma korral. J Allergy Clin Immunol. (2020) 145 (6): 1499–509. doi 10.1016/j.jaci.2020.04.010

19. Valera FCP, Ruffin M, Adam D, Maillé É, Ibrahim B, Berube J jt. Staphylococcus aureus kahjustab sinonasaalse epiteeli paranemist: mõju ninapolüüpidega kroonilise rinosinusiidiga patsientidele ja kontrollisikutele. J Allergy Clin Immunol. (2019) 143(2):591–603.e3. doi 10.1016/j.jaci.2018.05.035

20. Mohammed Saeed W, Cruickshank S, McBain AJ, O'Neill CA. Lactobacillus rhamnosus GG lüsaat suurendab keratinotsüütide kriimustustestide epiteliseerumist, soodustades migratsiooni. Sci Rep. (2015) 5:16147. doi: 10.1038/srep16147

21. Bachert C, Han JK, Desrosiers M, Hellings PW, Amin N, Lee SE jt. Dupilumabi efektiivsus ja ohutus ninapolüüpidega (LIBERTY NP SINUS-24 ja LIBERTY NP SINUS-52) raske kroonilise rinosinusiidiga patsientidel: tulemused kahest mitmekeskuselisest, randomiseeritud, topeltpimedast, platseebokontrollitud paralleelsest uuringust. - rühma 3. faasi katsed. Lancet. (2019) 394 (10209): 1638–50. doi: 10.1016/S0140-6736(19)31881-1

For more information:1950477648nn@gmail.com