MUC1 variantide tuvastamine patsientidel, kellel on kliiniliselt diagnoositud autosomaalne domineeriv tubulointerstitsiaalne neeruhaigus

Sissejuhatus

Autosomaalne domineeriv tubulointerstitsiaalne neeruhaigus (ADTKD) -MUC1 on peamiselt põhjustatud kaadrinihke mutatsioonidest, mis on tingitud ühe aluse sisestamisest MUC1 muutuva arvu tandemkorduse (VNTR) piirkonda. Variantide leviala keerukuse tõttu on identifitseerimine lühilugemisjärjestajate (SRS) abil keeruline. Kuigi hiljutised uuringud on näidanud pika lugemisega sekveneerijate (LRS) kasulikkust, jääb MUC1 variantide levimus kliiniliselt kahtlustatava ADTKD-ga patsientidel teadmata. Meie eesmärk oli selgitada seda levimust ning ADTKD-MUC1 geneetilisi omadusi ja kliinilisi ilminguid Jaapani populatsioonis, kasutades SRS-i ja LRS-i.

meetodid

Jaanuarist 2015 kuni detsembrini 2019 viidi geneetiline analüüs SRS-i abil läbi 48 patsiendil, kellel oli kliiniliselt kahtlustatav ADTKD. Negatiivsete SRS-tulemustega patsientidel viidi läbi täiendavad analüüsid, kasutades LRS-i.

Tulemused

Lühilugemise sekveneerimise tulemused näitasid MUC1 variante ühel patsiendil, kellel oli tsütosiini sisestus VNTR piirkonna teises kordusüksuses; sügavamaid VNTR piirkondi aga SRS lugeda ei suutnud. Seetõttu viisime läbi 39 juhtumi kaualoetud järjestusanalüüsi ja tuvastasime 8 patsiendil MUC1 VNTR variandid (kokku 9 patsienti sõltumatutest perekondadest). Kui kaasata perekonnast mõjutatud patsiendid (n ¼ 31), oli lõppstaadiumis neeruhaiguse (ESKD) kujunemise keskmine vanus 45 aastat (95 protsenti CI: 40–40 aastat).

Järeldus

Jaapanis oli MUC1 variantide avastamise määr kliiniliselt kahtlustatava ADTKD-ga patsientidel 18,8 protsenti. Rohkem kui 20 protsendil negatiivsete SRS-i tulemustega patsientidest tuvastas LRS MUC1 variandid.

Märksõnad

ADTKD; ADTKD-MUC1; kaua loetud järjestus; MCKD; NGS; SMRT sekveneerimine.

Hankimiseks klõpsake siinCistanche eelised

ADTKD on rühm pärilikke neeruhaigusi, mida iseloomustab progresseeruv tubulointerstitsiaalne fibroos ja tubulaarne atroofia, mis põhjustab ESKD-d. ADTKD võib jagada alamtüüpideks, mis põhinevad aluseks olevatel põhjuslikel geneetilistel defektidel, sealhulgas UMOD, MUC1, REN, HNF1B ja SEC61A1 kõrvalekalded. Arvestades ADTKD ühiste ühendavate omaduste mittespetsiifilisust, sealhulgas uriini setete ebanormaalsust ja kerget kuni negatiivset proteinuuriat, eeldatakse, et ADTKD on väga aladiagnoositud.

MUC1 on transmembraanne glükoproteiin, mis ekspresseerub tugevalt Henle ahela paksu tõusva jäseme apikaalses membraanis, distaalsetes keerdunud tuubulites ja kogumiskanalites. ADTKD-MUC1 kõige levinum geneetiline põhjus on kaadrinihke variant, mis on põhjustatud ühe aluse sisestamisest MUC1 (OMIM 158340; 1q22) VNTR polümorfismi eksonis 2.5. See mutatsioon lõpetab MUC1 valgu sünteesi pärast VNTR piirkonda ja loob uue lühendatud valgu (MUC1fs), millel puudub C-terminaalne domeen (joonis 1a). Seejärel koguneb MUC1fs tsütoplasmas ebanormaalse rakusisese valgu transpordi tõttu. VNTR piirkonnas on märkimisväärne indiviididevaheline varieeruvus, kuna see koosneb 60-nukleotiidühikutest, mis korduvad 20 kuni 125 korda, kusjuures igal alleelil on korduvad kordused (joonis 1b). Seetõttu on geenivariantide tuvastamine SRS-ide abil olnud variandi leviala keerukuse tõttu keeruline.

Varasemates uuringutes on põhjuslike variantide tuvastamiseks kasutatud alternatiivseid meetodeid, sealhulgas massispektromeetriat ja sondi pikendamist, nagu öeldud; need meetodid on aga tehniliselt nõudlikud. Hiljutised uuringud on leidnud LRS-ide kasulikkuse, mis kasutavad MUC1 VNTR variantide tuvastamiseks ühe molekuli reaalajas (SMRT) sekveneerimismeetodit. Sellegipoolest ei ole Jaapani elanikkonnas MUC1 VNTR variante veel iseloomustatud. Lisaks jääb MUC1 variantide levimus kliiniliselt kahtlustatava ADTKD-ga patsientidel teadmata. Seetõttu oli selle uuringu eesmärk selgitada seda levimust, sealhulgas ADTKD-MUC1 geneetilisi omadusi ja kliinilisi ilminguid Jaapani populatsioonis. Siin diagnoosisime 48 kliiniliselt kahtlustatava ADTKD juhtumi hulgas 9 ADTKD-MUC1 patsienti, kellel tuvastati VNTR variandid kas SRS-i (n ¼ 1) või LRS-i (n ¼ 8) abil.

meetodid

1. Osalejad

Ajavahemikus 2015. aasta jaanuarist kuni 2019. aasta detsembrini teostasime geenianalüüsi 48 patsiendil, kellel oli kliiniliselt kahtlustatav ADTKD. Osalejatel oli teadmata põhjustel neerufunktsiooni häire koos kergete kuni negatiivsete urineerimishäiretega. Patsientidel diagnoositi kliiniliselt ADTKD, kui neil oli positiivne perekonna anamneesis krooniline neeruhaigus ja/või hüperurikeemia või kui neerubiopsia patoloogilised leiud näitasid medullaarset tsüstilise neeruhaigust (eelnev termin ADTKD-MUC1 ja ADTKD-UMOD jaoks), tubulointerstitsiaalset nefriit või krooniline interstitsiaalne kahjustus. Välistasime neeru väärarengute ja/või ekstrarenaalsete sümptomitega patsiendid. DNA proove analüüsiti esmalt SRS-i abil. Seejärel viidi läbi täiendavad uuringud negatiivsete SRS-i tulemustega (n ¼ 39) patsientidel, kasutades LRS-i. Kõik proovid ja kliiniline teave saadi Jaapani suunamishaiglatest. Geneetilised analüüsid viidi läbi pärast patsientide ja / või nende eestkostjate kirjaliku teadliku nõusoleku saamist, kui patsient oli alaealine. Selle uuringu kiitis heaks Kobe ülikooli meditsiinikooli institutsionaalne ülevaatenõukogu (kinnitusnumber 301).

2. Lühikese lugemise järjestus

Genomic DNA was extracted from peripheral blood leukocytes using the QuickGene Mini 80 system (Wako Pure Chemical Industries, Ltd., Tokyo, Japan). For targeted sequencing using an SRS, samples were prepared using HaloPlex (Agilent Technologies, Santa Clara, CA) according to the manufacturer's instructions. Paired-end sequencing was performed on the MiSeq platform (Illumina, San Diego, CA). HaloPlex was used for targeted sequencing of 128 genes (version 2, Supplementary Table S1), 172 genes (version 4, Supplementary Table S2), 159 genes (version 5, Supplementary Table S3), 164 genes (version 6, Supplementary Table S4), 181 genes (version 7, Supplementary Table S5), and 183 genes (version 8, Supplementary Table S6) associated with congenital anomalies of the kidney and urinary tract, cystic kidneys, ADTKD, and nephronophthisis. The HaloPlex version used for each patient is found in Supplementary Table S7. Reads were aligned to the reference human genome (GRCh37/Hg19) using SureCall 4.0, which is a desktop application combining algorithms for end-to-end next-generation sequencing data analysis from alignment to categorization of mutations (Agilent Technologies). We excluded called variants with minor allele frequencies >1 protsent avalikult kättesaadavates inimeste variatsioonide andmebaasides, näiteks järgmistes: Human Genetic Variation Database (http://www.genome.med.kyoto-u.ac.jp/SnpDB/), gnomAD (https://gnomad.broadinstitute .org/) ja 1000 Genomes Project (1000G) andmebaasi (https://www. internationalgenome.org/data). Kandidaatvariandid valiti arvutusliku ennustustarkvara SIFT (https://sift.bii.astar.edu.sg/), PolyPhen-2 (http://genetics.bwh.harvard.edu/pph2/) abil. , Mutation Taster (http://www.mutationtaster.org/) ja CADD (https://cadd.gs.washington.edu/snv) ning klassifitseeriti seejärel patogeenseteks, tõenäoliselt patogeenseteks või ebaselgeteks. Ameerika Meditsiinigeneetika ja Genoomika Kolledži juhised.9

3. Raamatukogu ettevalmistamine ja pika lugemise järjestamine (SMRT sekveneerimine)

Amplikonid ühendati ekvimolaarsetes suhetes ja valmistati ette SMRTbelli järjestuste raamatukogude jaoks, kasutades SMRTbell Expressi malli ettevalmistamise komplekti 2.0 (Pacific Biosciences, Menlo Park, CA) vastavalt tootja juhistele. Seejärel konstrueeriti järjestuse matriits, ühendades järjestuse praimeri versiooni 2 ja DNA polümeraasi adapteritega järjestuse raamatukogu mõlemas otsas, ning matriit laaditi SMRT rakku. SMRT sekveneerimine viidi läbi, kasutades süsteemi PacBio Sequel II koos Sequel II järjestuskomplektiga 2.0. Järjestatud andmeid analüüsiti SMRT Link versiooniga 9.0.0 ja saadi väga täpsed konsensusjärjestused. Seejärel viidi järjestuste rühmitamine läbi analüüsitööriista "pbaa" abil, mis sobib korduvate järjestuste analüüsimiseks. SMRT sekveneerimise raamatukogu ettevalmistamise, sekveneerimise ja bioinformaatika analüüsid viis läbi Takara Bio (Kusatsu, Shiga, Jaapan). Nukleotiidjärjestus, lugemiste arv ja alleeli sagedus koostati iga patsiendi jaoks Exceli faili (andmeid ei avaldata). Iga tuvastatud järjestuse jaoks rekonstrueerisime järjestuse käsitsi iga 60 aluse järel rea kohta, nagu on kirjeldanud Kirby et al.5 (joonis 1b). Võimalike PCR-vigade tõttu keerulises VNTR-järjestuses tuvastati igal patsiendil mitu järjestust. Õiged järjestused tuvastati, võrreldes LRS-i tulemusi bioanalüsaatori abil saadud amplikonide elektroferogrammidega (täiendav tabel S8). Enamikul juhtudel määrati õigeks kaks suurimat lugemite arvuga järjestust. Mõnel juhul leiti siiski, et kolmanda või väiksema levinumate lugemiste arvuga järjestused olid õiged, kui nende suurused sobitati bioanalüsaatori tuvastatud elektroforeesi tippudega (SC449, SC511, SC534, SC560, SC566, SC593, SC616, ja SC639) pikkade alleelide PCR amplifikatsiooni ebaefektiivsuse tõttu, kui kahe alleeli VNTR piirkonna suurus oli oluliselt erinev.

Cistanche pulber ja Cistanche ekstrakt

Arutelu

Meie teadmiste kohaselt on see esimene aruanne MUC1 VNTR variantide geneetilisest analüüsist, mis tuvastati Jaapani kohordis SRS-i ja LRS-i kombinatsiooni abil. Tuvastasime MUC1 VNTR mutatsioonid 9 sõltumatust perekonnast pärit patsiendil. Lisaks oli MUC1 variantide tuvastamise määr kliiniliselt kahtlustatava ADTKD-ga patsientide seas 18,8 protsenti.

Variantide leviala keerukuse tõttu on MUC1 VNTR variantide tuvastamine rutiinse geneetilise analüüsi abil SRS-i abil keeruline ja tavaliselt on vaja muid meetodeid, nagu hetktõmmise meetod või massispektromeetria. Kahjuks on need meetodid tehniliselt nõudlikud ja neid teostatakse vaid vähestes laborites üle maailma.5,6 Wenzel et al.7 viisid läbi SMRT sekveneerimise ja kinnitasid kõik diagnoosid Euroopa osalejatel 9 perekonnast, kellel oli varem tuvastatud MUC1 VNTR variandid, kasutades hetktõmmise meetodit. Wang et al.8 näitasid ka SMRT sekveneerimise kasulikkust MUC1 VNTR mutatsioonide tuvastamiseks suures Hiina perekonnas. Sellegipoolest ei määranud need 2 uuringut nende uuringu ülesehituse tõttu MUC1 VNTR variantide tuvastamise määra kliiniliselt kahtlustatava ADTKD-ga patsientidel. Selles uuringus selgitasime, et MUC1 variantide diagnostiline määr kliiniliselt kahtlustatava ADTKD-ga patsientidel oli 18, 8 protsenti , mis võib hõlbustada täpsemaid tõenäosusi, eriti geneetilise nõustamise ajal.

Andmed ADTKD-MUC1 levimuse kohta on piiratud, kuigi varasemad uuringud on näidanud levimust 0,7 kuni 4 miljoni kohta USA-s ja Iirimaal.3,13 Inglismaal läbi viidud uuring näitas ADTKD hinnangulist levimust. -UMOD 9 miljoni kohta, mis viitab sellele, et ADTKD-UMOD on kõige sagedasem mittepolütsüstiline neeruhaigus.14 Meie uuringus olid 9 patsiendil MUC1 variandid, samas kui 6 patsiendil UMOD variandid, mis viitab sellele, et ADTKD-MUC1 võib olla üks levinumaid haiguse alatüüpe. ADTKD.

Vaatamata MUC1 VNTR piirkonna struktuurilisele keerukusele, suutis SRS tuvastada variante 3 patsiendil, kellel kõigil oli sama mutatsioon: tsütosiin, mis sisestati 7 järjestikusesse tsütosiini 60-nukleotiidi ühiku lõppu teises korduses VNTR. Eeldati, et MUC1 VNTR madalas osas (kuni VNTR kolmanda korduseni) olevad variandid on tuvastatavad, isegi kui DNA oli SRS-analüüsi proovi ettevalmistamise osana fragmenteeritud (100–200 aluspaari lugemise kohta). Yamamoto jt 15 tuvastasid veel ühe kaadrinihke mutatsiooni, mis paiknes enne MUC1 VNTR piirkonda, kasutades SRS-i (terve eksoomi järjestus). See mutatsioon tekitab ka ebanormaalselt kärbitud valgu samamoodi nagu VNTR-is paiknev mutatsioon.15 Need tulemused viitavad sellele, et SRS-analüüs võib olla kasulik VNTR-i madalasse piirkonda paigutatud variantide tuvastamiseks.

Meie uuringus oli seitsmel 9-st MUC1 VNTR variantidega patsiendist sama 60-nukleotiidühiku järjestus, mis sisaldas sisestatud tsütosiini (tabel 2). Varasemates uuringutes, kus viidi läbi kaualoetud MUC1 VNTR sekveneerimisgeneetiline analüüs, tuvastati sama variant 9 perekonnas Euroopa kohordis7 ja suures Hiina perekonnas.8 Lisaks on see mutatsioon tuvastatud hetktõmmise meetodil ja defineeritud kui "27dupC".12 Olinger et al.16 teatasid, et 27dupC variandi levimus oli 93,5 protsenti kahes ADTKD registris Euroopas ja Ameerika Ühendriikides. Nende leidude põhjal näitasid meie andmed, et 27dupC variant oli Jaapani kohordis kõige levinum MUC1 mutatsioon.

Cistanche toidulisandid

VNTR-i korduste arv on teatatud 20 kuni 253; aga meie uuringus oli VNTR korduste arv vahemikus 30 kuni 82, kusjuures 80 protsendil alleelidest oli 30 kuni 36 kordust. Eelmine uuring Euroopas teatas, et 30–36 kordusega alleelide protsent oli 39 protsenti, mis võib olla tingitud Jaapani elanikkonna etnilisest homogeensusest. Käesolevast uuringust selgus, et ADTKD-MUC1-ga patsientide keskmine vanus ESKD kujunemisel oli 45 aastat (95 protsenti CI: 40–50 aastat), kaasa arvatud perekondlikud haiged Jaapani kohordis (9 perekonda, n ¼ 31). Eelmises uuringus hinnati 147 isikut, sealhulgas MUC1 mutatsioonidega patsiente ja nende mõjutatud pereliikmeid, ning selgus, et keskmine vanus ESKD tekke ajal oli 44,9 15,4 aastat.17 Seevastu hiljutised uuringud, milles kasutati erinevaid kohorte, näitasid, et neerude elulemuse mediaanaeg 104 ADTKD-MUC1-ga patsienti olid 36-aastased (kvartiilsete vahemik: 30–46 aastat), mis võib olla seletatav haigete pereliikmete väljajätmisega, kes ei läbinud geneetilist analüüsi.16 Lisaks on patsientidel teatatud perekondlikest ja perekonnasisesest variatsioonist. MUC1 variantidega 8, 17, 18, kuigi modifitseerivate geenide või muude tegurite olemasolu jääb teadmata. Samal uuringuperioodil tuvastasime 19 patsiendil mutatsioonid ka ADTKD-d põhjustavas geenis HNF1B. Sellegipoolest jäeti registreerimisel meie uuringust välja kliiniliselt kahtlustatavate HNF1B mutatsioonidega patsiendid, kuna enamik neist patsientidest olid kliiniliselt eristatavad patsientidest, kellel oli ADTKD-MUC1, morfoloogiliste kõrvalekallete tõttu neerude kuseteede süsteemis ja/või autosoom-dominantse perekondliku ajaloo tõttu. Varajase algusega diabeet ja/või hüpomagneseemia, ning oleme selle patsientide populatsiooni kohta ka varem teatanud.19 Tõepoolest, neeruhaigus: globaalsete tulemuste parandamise konsensusaruanne ja hiljutine ADTKD ülevaade näitas, et mõiste ADTKD-HNF1B tuleks reserveerida ainult nendel juhtudel milline neeru tubulointerstitsiaalne fibroos on peamine ilming, sest ainult üksikutel juhtudel esineb ainult tubulointerstitsiaalne haigus.1,20 Arvatakse, et ADTKD-RENi spetsiifilisteks tunnusteks on lapseea aneemia, kerge hüpotensioon ja kerge hüperkaleemia. Sellest hoolimata teatas hiljutine rahvusvaheline kohortuuring 111 ADTKD-REN-iga patsiendi kliiniliste tunnuste kohta, et ligikaudu 70 protsenti patsientidest pöördus kroonilise neeruhaiguse või podagra tõttu meditsiiniasutustesse.21 Selle aruande kohaselt esines lapseea aneemiat 75,8 protsendil patsientidest. patsientidel, kuid selle raskusaste oli suhteliselt kerge; keskmine hemoglobiinitase oli vanuses 9,6, 10,1 ja 10,5 g/dl<10 years, 10 to <15 years, and 15 to <20 years, respectively.21 Although hypotension was not reported in the article, the severity of hyperkalemia was mild and the mean serum potassium level in patients who were not taking fludrocortisone was 4.8 mEq/l.21 Childhood anemia, hypotension, or hyperkalemia may often be overlooked, and they are not always specific to ADRKD-REN; thus, we did not exclude participants with these findings. ADTKD-SEC61A1 is much rare than other ADTKD subtypes, with 6 families reported as of date.22 Patients harboring SEC61A1 mutation present with specific features, such as intrauterine growth retardation, cleft palate, congenital anemia, neutropenia, and immunodeficiency.3,22 Although the clinical manifestations of ADTKD-REN have not been completely clarified owing to the small number of reported cases, patients presenting with these specific features can be clearly distinguished from those with ADTKD-MUC1.

Cistanche tubulosa

Hiljutised uuringud ADTKD-MUC1 molekulaarsete ja rakuliste mehhanismide kohta on näidanud, et see seisund on toksiline proteinopaatia, mis on põhjustatud valesti volditud MUC1 valgu rakusisene kuhjumisest.11,23 Dvela-Levitt et al.24 teatas väikese molekuli BRD4780 kasutamisest. Sekretsiooniraja ümbersuunamiseks lüsosoomidesse, mis näitas, et MUC1f-d elimineeriti sissetungivates hiirtes ja patsientide organoidides ning rõhutati BRD4780 terapeutilist potentsiaali. Seega võib MUC1 variantide täpne diagnoos olla tõhusate raviainete väljatöötamisel otsustava tähtsusega. Meie uuringul oli mitmeid piiranguid. Esiteks olid kõik meie uuringus osalejad jaapanlased ja meie valimi suurus oli lühikese uuringu kestuse tõttu väike. Arvestades selle uuringu retrospektiivset olemust, ei olnud meil võimalik saada ka pikisuunalist kliinilist teavet, näiteks neerude prognoosi. Teiseks täheldati ühe aluse insertsioone isegi ilma mutatsioonideta alleelides. Kõrge veamäära tõttu oli keeruline saavutada kvaliteetset kokkupanekut, et tuvastada ühe nukleotiidi variante või indeleid LRS-i abil. Kõigi erinevat tüüpi geneetiliste variatsioonide tuvastamiseks oli vaja kombineerida sekveneerimistehnoloogiaid, mis suurendab projektide maksumust ja keerukust. Seega töötas PacBio välja uue sekveneerimissüsteemi, mille nimeks oli ringkonsensusjärjestus. Ringikujuline konsensusjärjestus annab ülitäpsed lugemised 99,8-protsendilise täpsusega ja keskmise pikkusega 13,5 kilobaasi, mis vähendab järsult järjestamise veamäära.25 Seda sekveneerimismeetodit kasutati ka meie uuringus. Seega, arvestades järjestuse täpsuse paranemist, võib ühe aluse sisestusi põhjustada PCR viga. Kuigi KOD Hot Start DNA polümeraas on optimeeritud kõige raskemate sihtmärkide amplifitseerimiseks, võivad teised DNA polümeraasid, mille täpsus on KOD-st kõrgem (nt Phusion), kaasa aidata PCR veamäära vähendamisele.27 Viimased uuringud on leidnud amplifikatsioonivaba protokolli sihipäraseks rikastamiseks, kasutades korrapäraselt rühmitatud lühikesi palindroomseid kordusi/Cas9 süsteemi.28,29 See uus meetod annaks tõenäoliselt paremaid tulemusi. Kolmandaks ei ole me valideerinud alternatiivset meetodit, mis hõlbustaks diagnoosimist, näiteks neeruproovide või uriinist pärinevate rakkude immunovärvimist. Kirby jt, 5, kes esmakordselt teatasid ADTKD-MUC1 põhjuslikust mutatsioonist, viisid läbi MUC1 mutatsioonidega patsientide neeruproovide immunohistokeemilise analüüsi. Nad teatasid, et kuigi immuunvärvimine normaalsetes kontrollides andis tulemuseks mittespetsiifilise värvumise, ilmnes MUC1 mutatsioonidega patsientidel spetsiifiline intratsellulaarne värvumismuster Henle ahelas, distaalsetes tuubulites ja kogumiskanalites.5 Mutantse MUC1 valgu sarnaseid immunovärvimise analüüse on kirjeldatud. 11,13,18,30 Yamamoto et al.15 tuvastasid uriini eksosoomides mutantse MUC1 valgu. Kuigi ADTKD-MUC1 kliinilised ilmingud on mittespetsiifilised, võivad need mittegeneetilised analüüsid toetada kliinilist diagnoosi. Seega on vaja kontrollida nende mittegeneetiliste analüüside kasulikkust koos meie uuringu tulemustega. Kokkuvõttes näitab meie uuring, et kombineeritud geneetiline analüüs SRS-i ja LRS-iga on kasulik MUC1 VNTR variantide tuvastamiseks Jaapani kohordis ja et ADTKD-MUC1 levimus võib selles populatsioonis olla kõrge. Kombineeritud geneetiline analüüs SRS-i ja LRS-i abil parandab tõenäoliselt ADTKD-MUC1 diagnoosimise määra ja võib aidata kaasa optimaalsete ravimeetodite väljatöötamisele.

VIITED

1. Eckardt KU, Alper SL, Antignac C jt. Autosomaalne domineeriv tubulointerstitsiaalne neeruhaigus: diagnoosimine, klassifikatsioon ja juhtimine - KDIGO konsensusaruanne. Kidney Int. 2015;88:676–683. https://doi.org/10. 1038/ki.2015.28

2. Bolar NA, Golzio C, Zivná M et al. Heterosügootne funktsioonikaotus SEC61A1 mutatsioonid põhjustavad autosomaalselt domineerivat tubulo-interstitsiaalset ja glomerulotsüstilist neeruhaigust koos aneemiaga. Olen J Hum Genet. 2016;99:174–187. https://doi.org/ 10.1016/j.ajhg.2016.05.028

3. Devuyst O, Olinger E, Weber S jt. Autosoomne dominantne tubulointerstitsiaalne neeruhaigus. Nat Rev Dis krundid. 2019; 5: 60. https://doi.org/10.1038/s41572-019-0109-9

4. Patton S, Gendler SJ, Spicer AP. Piima, piimanäärme ja muude kudede epiteeli mutsiin, MUC1. Biochim Biophys Acta. 1995;1241:407–423. https://doi.org/10.1016/0304-4157 (95)00014-3

5. Kirby A, Gnirke A, Jaffe DB jt. I tüüpi medullaarset tsüstilise neeruhaigust põhjustavad mutatsioonid asuvad MUC1 suures VNTR-is, mis jäi massiliselt paralleelse sekveneerimisega vahele. Nat Genet. 2013;45: 299–303. https://doi.org/10.1038/ng.2543

6. Ekici AB, Hackenbeck T, Morinière V jt. Neerufibroos on autosoomsete domineerivate tubulointerstitsiaalsete neeruhaiguste ühine tunnus, mis on põhjustatud mutsiini 1 või uromoduliini mutatsioonidest. Kidney Int. 2014;86:589–599. https://doi.org/10.1038/ki. 2014.72

7. Wenzel A, Altmueller J, Ekici AB jt. Ühe molekuli reaalajas järjestamine ADTKD-MUC1-s võimaldab VNTR-i täielikku kokkupanekut ja põhjuslike mutatsioonide täpset positsioneerimist. Sci Rep. 2018;8:4170. https://doi.org/10.1038/s41598-018-22428-0

8. Wang GQ, Rui HL, Dong HR jt. SMRT sekveneerimine näitas, et Hiina perekonna järelanalüüsi abil on see tõhus meetod ADTKD-MUC1 diagnoosimiseks. Sci Rep. 2020;10:8616. https://doi.org/10.1038/s41598-020-65491-2

9. Richards S, Aziz N, Bale S jt. Järjestuste variantide tõlgendamise standardid ja juhised: Ameerika meditsiinigeneetika ja genoomika kolledži ja molekulaarpatoloogia assotsiatsiooni ühine konsensussoovitus. Genet Med. 2015;17:405–424. https://doi.org/10.1038/ gim.2015.30

10. Kanda Y. Vabalt kättesaadava lihtsalt kasutatava meditsiinistatistika tarkvara "EZR" uurimine. Luuüdi siirdamine. 2013;48:452–458. https://doi.org/10.1038/bmt.2012.244

11. Robinson JT, Thorvaldsdóttir H, Winckler W jt. Integreeriv genoomika vaataja. Nat Biotechnol. 2011;29:24–26. https://doi. org/10.1038/nbt.1754

12. Zivná M, Kidd K, P ristoupilová A jt. Mitteinvasiivne immunohistokeemiline diagnoos ja uudsed MUC1 mutatsioonid, mis põhjustavad autosomaalset domineerivat tubulointerstitsiaalset neeruhaigust [avaldatud parandus ilmub ajakirjas J Am Soc Nephrol. 2020; 31: 892]. J Am Soc Nephrol. 2018;29:2418–2431. https://doi.org/ 10.1681/ASN.2018020180

13. Cormican S, Connaughton DM, Kennedy C jt. Autosoomne dominantne tubulointerstitsiaalne neeruhaigus (ADTKD) Iirimaal. Ren Fail. 2019; 41:832–841. https://doi.org/10.1080/ 0886022X.2019.1655452

14. Gast C, Marinaki A, Arenas-Hernandez M, et al. Autosoomne dominantne tubulointerstitsiaalne neeruhaigus – UMOD on kõige sagedasem mittepolütsüstiline geneetiline neeruhaigus. BMC Nephrol. 2018;19:301. https://doi.org/10.1186/s12882-018- 1107-y

15. Yamamoto S, Kaimori JY, Yoshimura T jt. MUC1 uudse kaadrinihke mutatsiooniga ADTKD perekonna analüüs näitab mutantse MUC1 valgu iseloomulikke tunnuseid. Nephrol Dial siirdamine. 2017;32:2010–2017. https://doi.org/10. 1093/ndt/gfx083

16. Olinger E, Hofmann P, Kidd K jt. UMOD ja MUC1 mutatsioonidest tingitud autosomaalse domineeriva tubulointerstitsiaalse neeruhaiguse kliinilised ja geneetilised spektrid. Kidney Int. 2020;98:717–731. https://doi.org/10.1016/j.kint.2020.04.038

17. Bleyer AJ, Kmoch S, Antignac C jt. 1. tüüpi medullaarset tsüstilise neeruhaigust põhjustava MUC1 mutatsiooni varieeruv kliiniline esitus. Clin J Am Soc Nephrol. 2014; 9:527–535. https://doi.org/10.2215/CJN.06380613

18. Ayasreh N, Bullich G, Miquel R jt. Autosomaalne domineeriv tubulointerstitsiaalne neeruhaigus: ADTKD-UMOD ja ADTKD-MUC1 patsientide kliiniline pilt. Olen J Kidney Dis. 2018;72:411–418. https://doi.org/10.1053/j.ajkd.2018.03. 019

Eri Okada1,2 , Naoya Morisada1,3 , Tomoko Horinouchi1 , Hideki Fujii4 , Takayuki Tsuji5 , Masayoshi Miura6 , Hideyuki Katori7 , Masashi Kitagawa8 , Kunio Morozumi9 , Takanobu Toriyamau1, Yuki Nakamai101, Takanobu Toriyama1010 1, Atsushi Kondo1, Yuya Aoto1, Shinya Ishiko1, Rini Rossanti1, Nana Sakakibara1, Hiina Nagano1, Tomohiko Yamamura1, Shingo Ishimori1, Joichi Usui2, Kunihiro Yamagata2, Kazumoto Iijima13,14, Toshiyuki Imasawa15 ja Kandai Nozu