Tsütokiini geenide seosed hommikuse ja õhtuse väsimuse enesehinnanguga onkoloogilistel patsientidel ja nende peres hooldajatelⅠ
Jun 07, 2022
tsütokiinid; geneetika; hommikulväsimus; õhtulväsimus; rinnavähk; kasvaja nekroosifaktor-alfa;interleukiin 4;cistanche ekstrakti pulber

Lisateabe saamiseks:wallence.suen@wecistanche.com
Väsimuson sagedane ja invaliidistav sümptommis esineb ligikaudu 80 protsendil kiiritusravi saavatest patsientidestja 24–30 protsendilvähihaigete perehooldajad (Swore Fletcher, Dodd, Schumacher jaMiaskowski, 2008). Kuigi autorid on teatanud kõrgest levimusest ja negatiivsestSelle sümptomi mõju üle 30 aasta on selle aluseks olevate mehhanismide kohta vähe teadaväsimus.Kuigi väsimuse etioloogia on kahtlemata mitmefaktoriline, kasvab tõendite hulkviitab sellele, et põletikulised rajad on selle sümptomi tekkes olulised(Barsevick, Frost, Zwinderman, Hall ja Halyard, 2010; Jager, Sleijfer ja van der Rijt, 2008;Reyes-Gibby jt, 2008; Schubert, Hong, Natarajan, Mills ja Dimsdale, 2007).
Tegelikult,mitmed uuringud on hinnanud seoseid seerumi tsütokiinitaseme ja väsimuse vahelesinemine või raskusaste. Kvantitatiivse ülevaate tulemused (Schubert et al., 2007)viitas positiivsele korrelatsioonile väsimuse ja ringleva põletikutaseme vahelmarkerid. Hinnatud 19 ringlevast põletikumarkerist aga ainult interleukiin(IL)-6, IL1-retseptor alfa (IL-1r ) ja neopteriin jäi lõppanalüüsides oluliseks.Need ebaselged leiud võivad olla tingitud mõõtmisega kaasnevatest väljakutsetestringlevad tsütokiinid ja tsütokiinitaseme ööpäevane varieeruvus (Gilbertson-White,Aouizerat ja Miaskowski, 2011).
Lisaks seerumi tsütokiinide uuringutele on mitmed uuringud dokumenteerinud seoseidtsütokiini geenide variatsioonide ja väsimuse vahel (Aouizerat et al., 2009; Bower, Ganz,Irwin, Arevalo ja Cole, 2011; Collado-Hidalgo, Bower, Ganz, Irwin ja Cole, 2008; Hong etal., 1995; Miaskowski jt, 2010; Reinertsen et al., 2011). Uuringus, milles osales 33 väsinud ja 14mitteväsinud rinnavähi ellujääjad, Collado-Hidalgo et al. (2008) leidis, et samasIL6oliei ole seotud väsimusega,IL1Bnäitas assotsiatsiooni. Meie poolt läbi viidud uuringusuurimisrühm (Miaskowski et al., 2010), onkoloogilised patsiendid (n= 288) ja omastehooldajad(n= 103), kes olid homosügootid tavalise alleeli suhtesIL6rs4719714 teatas kõrgematest tasemetesthommikune ja õhtune väsimus ja unehäired.
Lisaks selles samasproov, isikud, kes olid homosügootsed kasvaja nekroosifaktor-alfa ühise alleeli suhtes (TNFA)rs1800629 teatas kõrgemast hommikusest väsimusest ja unehäiretest(Aouizerat et al., 2009). Sama ühe nukleotiidi polümorfism (SNP) inTNFAolimis on seotud kurnatuse sümptomite ja kõrgema C-reaktiivse valgu tasemega patsientidelkroonilise väsimuse sündroom (Jeanmonod, von Kanel, Maly ja Fischer, 2004). Teises uuringusmilles teadlased võrdlesid väsinud (n= 11) ja mitteväsinud (n= 10) rinnavähkellujääjad, tuumafaktor kappa beeta(NFKB)transkriptsioonide hulgas näidati olevat suurenenudväsinud ellujääjad (Bower et al., 2011). Kuid ulatuslikus rinnavähi ellujäänute uuringusainult üks seitsmest SNP-st viies tsütokiini geenis (st C-reaktiivne valk[CRP]rs3091244)seostati väsimusega (Reinertsen et al., 2011).
Käesolevas artiklis laiendame neid leide ja hindame erinevusi mitmete poolt-japõletikuvastased tsütokiini geenid nende osalejate seas, kes olid klassifitseeritud omavateksmadal ja kõrge hommikuse ja õhtuse väsimuse tase.

OSTKE TSISTANŠET CFS-i kõvendamiseks
meetodid
Selle uuringu üksikasjad on avaldatud mujal (Aouizerat et al., 2009; Carney et al., 2011;Dhruva jt, 2012; Dunn et al., 2012; Miaskowski jt, 2010; Miaskowski jt, 2011). sisseLühidalt, patsiendid ja nende perehooldajad (FC-d) värvati kahest kiiritusravistosakonnad, mis asuvad terviklikus vähikeskuses ja kogukonnapõhises onkoloogiasprogrammi patsientide simulatsioonivisiidi ajal.Patsiendid said osaleda, kui nad olid 18-aastased või vanemad; oli kavas kätte saadaesmane või adjuvantne kiiritusravi ühe neljast vähidiagnoosist (st rinna-, eesnäärme-,kopsud või aju); oskasid lugeda, kirjutada ja mõista inglise keelt; andis kirjalikult teavitatudnõusolek; ja nende Karnofsky jõudlusstaatuse (KPS) skoor oli suurem või võrdne 60. Patsiendid olidvälja jäetud, kui neil oli metastaatiline haigus, rohkem kui üks vähidiagnoos või diagnoositud haigusunehäire. FC-d võisid osaleda, kui nad olid 18-aastased või sellega võrdsed; suutsidlugeda, kirjutada ja mõista inglise keelt; andis kirjaliku teadliku nõusoleku; oli KPS-i skoor Suurem või võrdne60; elasid koos patsiendiga ja tal ei olnud diagnoositud unehäireid.
Instrumendid
Kasutasime demograafilist küsimustikku, et saada teavet vanuse, soo, perekonnaseisu,haridus, etniline kuuluvus, tööalane staatus ja mitmete kaasuvate haiguste esineminetingimused. Vaatasime üle ka haiguslood, et leida teavet haiguste ja ravi kohta.Lee väsimusskaala (LFS), mida kasutasime käesolevas uuringus, koosneb 13 punktistmõeldud füüsilise väsimuse hindamiseks (KA Lee, Hicks ja Nino-Murcia, 1991). Täielik väsimusskoor arvutatakse 13 punkti keskmisena, kusjuures kõrgemad skoorid näitavad suuremat väsimusttõsidus. Osalejatel palutakse hinnata iga üksust selle põhjal, kuidas nad end "praegu" tunnevad30 minutit ärkamist (hommikune väsimus) ja enne magamaminekut (õhtune väsimus). LFSon väljakujunenud kehtivus ja usaldusväärsus. Käesolevas uuringus on Cronbachi alfad jaoksõhtune ja hommikune väsimus registreerimisel olid patsientidel {{0}},96 ja 0,95 ning 0,95 ja 0,96vastavalt FC-dele.
Uuringu kiitis heaks ülikooli inimuuringute komiteeCalifornia, San Francisco ja institutsiooniline ülevaatenõukogu teises kohas. Kutsusimepatsiente uuringus osalema ligikaudu 1 nädal enne kiirituse algustravi (st simulatsioonikülastus kiiritusravi mõõtmise ajal). KuiFC oli kohal, uurimisõde selgitas uuringuprotokolli nii patsiendile kui ka FC-le,abikõlblikkuse kindlaksmääramisel ja saanud kirjaliku teadliku nõusoleku. FC-d, kes kohal polnudnendega võeti telefoni teel ühendust, et selgitada välja nende osalemishuvi. Need FC-d on lõpetatudregistreerimisprotseduurid kodus. Osalejad täitsid LFS-i registreerumisel 4 nädalatpärast kiiritusravi alustamist, kiiritusravi lõpetamisel ja kell 4, 8, 12,ja 16 nädalat pärast kiiritusravi lõppu (st seitse hinnangut üle 6kuud).
Nagu varem teatatud (Dhruva et al., 2013), tuvastati kolm erinevat varjatud klassihommikune ja õhtune väsimus. Käesolevas dokumendis kirjeldatud kandidaatgeenianalüüside jaokskolmehommikused väsimustunnid jaotati kahte rühma (st väga madal [32,5 protsenti]versus madal ja kõrge [67,5 protsenti]), nagu ka kolm õhtust väsimuse klassi (st madal [11,1 protsenti]versus mõõdukas ja kõrge [88,9 protsenti]). Selle liigituse põhjendus on väga madalüldiselt võib eeldada hommikuse väsimuse ja õhtuse väsimuse madalat tasetelanikkonnast. See äärmusliku fenotüübi lähenemisviis on tõhus strateegia potentsiaali tuvastamisekskandidaatgeenid, mis on seotud sümptomite või kliiniliste seisunditega (Li, Lewinger, Gauderman,Murcray ja Conti, 2011).
Puuduvaid andmeid ei korrigeeritud. Seetõttu oli iga analüüsi kohortsõltub rühmade suurimast saadaolevatest andmetest. Ap-väärtus < 0,05 olipeetakse statistiliselt oluliseks.
Geeni valik -Põletikueelsed tsütokiinid soodustavad süsteemset põletikku jaNende hulka kuuluvad gamma-interferoon (IFN ), IFN retseptor 1 (IFN R1), IL-1R1, IL-2, IL-8, IL-17A,NFKB1, NFKB2 ja TNF- . Põletikuvastased tsütokiinid pärsivad pro-põletikulised tsütokiinid ja hõlmavad IL-1R2, IL-4, IL-10 ja IL-13. Pange tähele, IFN 1, IL-1 , ja IL{0}} omavad põletikuvastaseid ja põletikuvastaseid omadusi (Seruga, Zhang, Bernstein jaTannock, 2008).
Vere kogumine ja genotüpiseerimine -Genoomne desoksüribonukleiinhape (DNA) oliekstraheeritud arhiveeritud buffy coat'idest, kasutades PUREGene DNA isolatsioonisüsteemi(Invitrogen, Carlsbad, CA). 287 värvatud osalejast leiti DNA 253-stosalejad (st 168 patsienti ja 85 FC). Proovid genotüüpiti GoldenGate'i abilgenotüpiseerimise platvorm (Illumina, San Diego, CA) ja töödeldud GenomeStudio abil(Illumina, San Diego, CA).
Ühe nukleotiidi polümorfismi (SNP) valik –Valisime kombinatsiooniKirjanduses analüüside jaoks soovitatud SNP-de ja SNP-de märgistamine. SNP-de märgistamine olidpeab olema avalikult tavaline (st määratletud kui haruldase alleeli sagedus, mis on suurem või võrdne 0.05)andmebaasid. Tugevate geneetiliste seoste analüüside tagamiseks teostasime kvaliteetikontrollida SNP-de filtreerimist. SNP-d, mille kõnesagedus on < 95="" protsenti="" või="">p- väärtused< .001="" were="">Nagu on näidatud täiendavas tabelis 1
Statistilised analüüsid -Alleeli ja genotüübi sagedused määrati geeni järgilugedes. Hardy-Weinbergi tasakaalu hinnati hii ruudu või Fisheri täpsusegatestid. Ühenduse tasakaalustamatuse (LD; st D' jar2) arvutati alatesosalejate genotüübid Haploviewga
4.2. LD-põhine haplotüübi ploki määratlus põhinesD' usaldusvahemiku kohta (Gabriel et al., 2002)
mitme testimise jaoks ei tehtud kohandusi. Lisaks tuvastati aastal olulised SNP-dkahe muutujaga analüüse hinnati edasi, kasutades regressioonianalüüse, mis kontrollisidfenotüübiliste omaduste erinevused, populatsioonist tingitud potentsiaalne segaduskihistumine ja teiste SNP-de/haplotüüpide varieerumine samas geenis. Ainult needSNP-d, mis jäid oluliseks, lisati tulemuste lõplikku esitlusse.Seetõttu ei ole teatatud oluliste sõltumatute ühenduste põhjuseks tõenäoliselt ainultjuhus. Kõikide kvaliteedikontrolli kriteeriume läbivate SNP-de kohta teatatakse korrigeerimata seostesttäiendav tabel 1, et võimaldada hilisemaid võrdlusi ja metaanalüüse.
Tulemused
Osaleja omadused
Fenotüüpsed erinevused hommikuse väsimuse klasside vahel
Kandidaatide geenianalüüsid hommikuste väsimustundide jaoks
Viiest SNP-st, mis erinesid oluliselt kahe hommikuse väsimuse klasside vahel(täiendav tabel 1), jäid ühes geenis kaks seost oluliseksmitme muutujaga regressioonanalüüsid (stTNFArs1800629,TNFArs3093662). Mõlema SNP jaoksdomineeriv mudel sobib andmetega kõige paremini (mõlemadp = 0.006).

Kandidaatide geenide regressioonanalüüsid hommikuse väsimuse klasside jaoks
Fenotüüpsed erinevused õhtuse väsimuse klasside vahel
Kandidaatide geenianalüüsid õhtuse väsimuse klassi jaoks
Kandidaatide geenide regressioonanalüüsid õhtuse väsimuse klasside jaoks







