Üksikrakk ja immuunsus: immuunrakkude heterogeensuste parem mõistmine ühe raku sekveneerimisega

Dec 15, 2023

Immuunsuse õrna tasakaalu vahendavad sagedased läbirääkimised ja keerulised interaktsioonid erinevate rakutüüpide vahel. Immuunrakud on rakutüüpide ja aktiveerimisoleku poolest väga heterogeensed. Kudede ja hulgirakkude sekveneerimismeetodid koguvad segaproovide üldised signatuurid, kusjuures haruldaste, kuid funktsionaalselt oluliste rakutüüpide peened geenisignatuurid on kaetud rohkete rakupopulatsioonidega.

Cistanche deserticola-improve immunity

cistanche tubulosa - parandab immuunsüsteemi

Lisaks on traditsiooniliste meetoditega raske iseloomustada rakusisest ja rakkudevahelist sidet, mis kannab olulisi vihjeid immuunrakkude proliferatsiooni, diferentseerumise, küpsemise, migratsiooni ja ülemineku jaoks. Praeguse eriteemalise väljaande eesmärk oli keskenduda üherakuliste uuringute kiirele edenemisele nakkusliku immuunsuse, vähi immunoloogia, kaasasündinud immuunsuse ja immuunsüsteemi häirete kohta, nagu on näidatud joonisel 1.

Desert ginseng-Improve immunity (12)

Tistanche kasulikud omadused meestele - tugevdavad immuunsüsteemi

Üherakulisel sekveneerimisel on teaduslik mõju kliinilistele ja translatiivsetele avastustele. Viimase kümnendi jooksul on üherakuline RNA sekveneerimine (scRNA-seq) vallandanud tõelise revolutsiooni immunoloogilistes uuringutes. Üherakuliste molekulaarsete profiilide koostamise tööriistadena võimaldavad scRNA-seq tehnoloogiad paremini mõista üksikute immuunrakkudega seotud heterogeensust ja reaktsioone molekulaarsel tasemel füsioloogilistes ja patoloogilistes tingimustes.1 Üherakulised sekveneerimisel põhinevad uuringud on edukalt tuvastanud uusi. immuunrakkude alarühmad ja arengutrajektoorid.2 Nakkushaigused ja vähid kujutavad endast tõsist ohtu inimeste tervisele. Kuidas tõlkida meie arusaam immuunregulatsiooni molekulaarsest mehhanismist kliinilisteks ravimeetoditeks, on endiselt suur väljakutse.

Desert ginseng-Improve immunity (15)

cistanche taime suurendav immuunsüsteem

Cistanche Enhance Immunity toodete vaatamiseks klõpsake siin

【Küsi lisa】 E-post:cindy.xue@wecistanche.com / Whats App: 0086 18599088692 / Wechat: 18599088692

scRNA-seq tehnoloogiaga on saavutatud suured läbimurded. Näiteks avastati üherakulise eraldusvõimega erinevad immuunvastuse teed A-gripiviirusega nakatumise ja raske ägeda respiratoorse sündroomi koroonaviiruse-2 (SARS-CoV-2) vahel.3 SARS-CoV{{ 7}}Neutraliseerivad antikehad tuvastati COVID{10}} patsientide antigeeniga rikastatud B-rakkude scRNA-seq abil.4 Koostati süstemaatiliselt inimeste ristkudede immuunatlas ja arengu immuunatlas.5,6 scRNA-seq tehnoloogia on osutunud tõhusaks vahendiks kasvajakudedes immuunpõgenemise mehhanismide paljastamiseks.7

FIGURE 1 The topic of single cell and immunity is mainly focused on immune system disorders, infectious immunity, cancer immunity, inflammatory immunity, virus-associated immunity, and innate immunity. Schematic diagrams were created with BioRender.com.


JOONIS 1 Üksikraku ja immuunsuse teema keskendub peamiselt immuunsüsteemi häiretele, nakkuslikule immuunsusele, vähi immuunsusele, põletikulisele immuunsusele, viirusega seotud immuunsusele ja kaasasündinud immuunsusele. Skemaatilised diagrammid loodi saidiga BioRender.com.

Desert ginseng-Improve immunity (16)

cistanche tubulosa - parandab immuunsüsteemi

Üherakuliste analüütiliste tööriistade vallas on tehtud kiireid edusamme. Üherakuliste andmekogumite salvestamiseks ja analüüsimiseks töötati välja lai valik kõikehõlmavaid veebiandmebaase.8–13 Hädasti on vaja uuendada rohkem bioinformaatilisi tööriistu andmete integreerimiseks erinevatest tehnoloogiatest ja andmetüüpidest. Üks ülioluline ülesanne on standardida immuunrakkude annotatsioon ja kasutada ära kogu andmetüüpide spektrit. See võimaldab akadeemiliste ringkondade, tööstuse ja kliiniliste institutsioonide vahel andmeanalüüsi alal koostööd teha. Seega edendavad selle eriteemalise väljaande kooskõlastatud jõupingutused meie arusaamist immunoloogiauuringutest ja -teraapiatest.

Desert ginseng-Improve immunity (23)

cistanche tubulosa - parandab immuunsüsteemi

VIITED

1. Giladi A, Amit I. Üherakuline genoomika: hüppelaud tulevaste immunoloogiaavastuste jaoks. Kamber. 2018;172(1):14-21. https://doi.org/ 10.1016/j.cell.2017.11.011

2. Papalexi E, Satija R. Üherakuline RNA sekveneerimine immuunrakkude heterogeensuse uurimiseks. Nat Rev Immunol. 2018;18(1):35-45. https://doi.org/10.1038/nri.2017.76

3. Zhu L, Yang P, Zhao Y jt. Perifeersete mononukleaarsete rakkude üherakuline sekveneerimine paljastab COVID-19 ja gripipatsientide immuunvastuse erinevad maastikud. Immuunsus. 2020;53(3):685- 696. https://doi.org/10.1016/j.immuni.2020.07.009. e3.

4. Cao Y, Su B, Guo X jt. Tugevad neutraliseerivad antikehad SARS-CoV-2 vastu, mis tuvastati taastuvate patsientide B-rakkude suure läbilaskevõimega üherakulise sekveneerimisega. Kamber. 2020;182(1):73-84. https://doi.org/10.1016/j.cell.2020.05.025. e16.

5. Suo C, Dann E, Goh I jt. Inimese areneva immuunsüsteemi kaardistamine organite lõikes. Teadus. 2022;376(6597):eabo0510. https://doi.org/10.1126/science.abo0510

6. Domínguez Conde C, Xu C, Jarvis LB jt. Ristkudede immuunrakkude analüüs näitab inimestel koespetsiifilisi tunnuseid. Teadus. 2022;376(6594):eabl5197. https://doi.org/10.1126/science.abl5197

7. Zhang Y, Wang D, Peng M jt. Üherakuline RNA sekveneerimine vähiuuringutes. J Exp Clin Cancer Res. 2021;40 (1):81. https://doi. org/10.1186/s13046-021-01874-1

8. Chen D, Tan C, Ding P jt. VThunter: andmebaas viiruse sihtrakkude sõelumiseks loomariigis. Nucleic Acids Res. 2022;50(D1):D934-D942. https://doi.org/10.1093/nar/ gkab894

9. Chen Y, Zhang X, Peng X jt. KIIRUS: üherakuline üleliigiline atlas ökoloogia ja arengu ja haiguste evolutsiooni valguses. Nucleic Acids Res. https://doi.org/10.1093/nar/gkac930. Avaldatud veebis 28. oktoobril 2022: gkac930.

10. Han X, Wang R, Zhou Y jt. Hiirerakkude atlase kaardistamine microwell-Seq. Kamber. 2018;172(5):1091-1107. https://doi.org/10. 1016/j.cell.2018.02.001. e17.

11. Chen D, Sun J, Zhu J et al. Üherakuline atlas 11 mittemudelimetajale, roomajale ja linnule. Nat Commun. 2021;12(1):7083. https://doi.org/10.1038/s{10}}

12. Han X, Zhou Z, Fei L jt. Inimese rakumaastiku ehitamine üheraku tasemel. Loodus. 2020;581(7808):303-309. https:// doi.org/10.1038/s41586-020-2157-4

13. Ma P, Liu X, Xu Z jt. Geeniekspressiooni ja kromatiini ligipääsetavuse ühine profileerimine amphioxuse arengu ajal üherakulise eraldusvõimega. Cell Rep. 2022;39(12). https://doi.org/10. 1016/j.celrep.2022.110979

Ju gjithashtu mund të pëlqeni