Mitmefaktoriline seroproiling lahkab olemasolevate inimeste koronaviiruste reaktsioonide panust SARS-CoV-2 immuunsusse (1. osa)

Lisateabe saamiseks võtke ühendustdavid.wan@wecistanche.com

SARS-CoV-2 määraminetibody Vastused in  kontekst albaania Eelnevalt-Olemasolevate Immuunsus etringlev inimese koroonaviirus(HCV)On Kriitiline sest mõistmine Kaitsev Immuunsus.Siinme Sooritada a mitmefaktoriline analüüs albaania SARS-CoV-2ja HCV antikeha Vastused inpandeemiaeelne(N= 825)ja SARS-CoV-2-Nakatunud Rahastajad(N= 389)kasutades a komme-Kavandatudmultipleks  ABCORA  Test.ANCORA,KuiKombineeritudkoosArvutuslikmodelleerimine, võimaldab täpset määratlust of  SARS-CoV-2serokonversioonjaennustusalbaaniaNeutralisatsiooni aktiivsus,ja Paljastab Intrigeeriv omavahel seotud seosed koos HCV Immuunsus.Konkreetselt,kõrgem HCV antikehade tase SARS-CoV-2-negatiivsetel doonoritel viitab sellele, et olemasolev HCoVImmuunsus Maikaitsma vastu SARS-CoV-2Omandamine.Sisse Need Nakatunud,KõrgemHCoV aktiivsusOnSeostatudkoosKõrgenenud  SARS-CoV-2Vastused,näitab riststimulatsiooni.EnamikTähtsam,HCV  ImmuunsusMaiMõju tõbi Raskust,naguPatsientidelkoos kõrge HCoV Reaktsioonivõime On vähem tõenäoline et nõudma Haiglaravi.Kollektiivselt,meie TulemusedSoovitanet HCV immuunsus võib soodustada SARS-CoV-2-spetsiifilise kiiret arengutImmuunsus,Seeläbi rõhutamine  tähtsus albaania Uurida rist-Kaitsev Vastused sestpõhjalik coronavirus Ennetamine.

antikehade respo jälgiminenseet  SARS-CoV-2OnKriitiline et DeÜhendusNe korrelaadid albaania Vaktsiin kaitseErinevusedvastuvõtlikkus infektsioonile ja diseaseseverity. pilt albaania  antikeha maastik et SARS-CoV-2 mis on seni arenenud is kompleks. antikeha vastus etSARS-CoV-2Onkiire ja käivitab tugeva IgM, IgA ja IgG Vastused1,2. Nii siduvad kui ka neutraliseerivad vastusedcrease koos tõbi Raskust ja näitama in osa Sõltuvus ondemograafiline Parameetrid selline nagu vanus ja sugu3–5. Jääb, kuidas... alati ebaselge, millised tegurid on sõltumatud drivErs albaania antikehareaktsioonid, kajastavad raskeid haigusi cmeie omad, või On segaduses pooltmuu Tegurid Sealhulgas Nakkus pikkus ja kaasnevad haigused.Kahanemine  IgG siduvja neutraliseerimineantikeha tiitridMai olemaeriti hääldadadinÜksikisikutekoosAsümptomaatilinevõi kerge Nakkus6–9.IgG Vastused et viljapea(S)glükoproteiin Maipüsige pikka aegar kui et nukleokapsiid proteiin(N)7,10,11 ja Võib inosa Läbima AfÜhendusnity Küpsemise post viirus Kliirens5.HoovusSeroLoogiline Analüüsid Peamiselt fookus on Mõõtmise Reaktsioonivõime N-le, oga glükoproteiini S1 alaühikule ja ACE2 retseptorit siduvale Domeeni(RBD)in S12,5,12–16.RBD antikehad ja retseptori siduv motiiv within  RBD Moodustavad  Peamine rühmalbaania neutraliseerimine Antikehade,Järgida poolt S1trimer speciÜhendusc,viljapeaN-Terminal Domeeni,ja viljapea S2neutraliseerimine Antikehade16–22. S1 ja  RBD  siduvkorrelaatkoosneutraliseerimineaktiivsusinmõlemad looduslikud ja vaktsiinist põhjustatud immuunvastused, mis annavad means to hinnang  Potentsiaali sest Neutralisatsiooni kus neutraliseerimineVõimsuse Ei saa olema otseselt hinnatud6,8,10. Arvestades kompleksiantikehadele reageerimise mustrid, possibilitiesetLüüa Dynamics albaania   SARS-CoV-2 vastus erinevates immunoglobuliinides(Ig) klassid ja SARS-CoV-2 antigeenid on vajalikud selleks, et teha kindlaks serokonversiooni ja sero-reversio tundlik avastaminenjaetKehtestadaseosed kaitsva, neutraliseeriva tegevusega pärast nakatumistja pärast vaktsineerimist.

Cistanche kohta lisateabe saamiseks klõpsake siin

Fig. 1Seroproiling SARS-CoV-2Vastused.a Hindamine albaania  multipleks SARS-CoV-2ABCORA2.0on  Märgitud Koolitus(N= 823)ja valideerimine(N = 635) kohordid (täiendav tabel 3). Pildil on MFI-signaalid, mis on normaliseeritud tühjadele helmeste juhtelementidele (MFI-FOE). Gray Kastid Näitavad Väärtused Eespool individuaalselt komplekt MFI-VAENLANE Lõigata-Off sest SARS-CoV-2konkreetne Vastused sest iga Antigeeni(nägema Täiendava Laud4).Boxplots esindama  järgmine:Keskpärane koos  Lähis liin,Ülemine ja Madalam kvartiilid koos  karp Piiridja 1,5x interquartile Vahemikud koos  Niitkristallid.b Soojuskaart Esindavad mõõdetud MFI-VAENLANE Väärtused ja  Tulemusi Ennustatud koos ABCORA2.0–2.3albaania Koolitus ja Valideerimine kohort Mõõtmised näidatud in(a).Negatiivne,Positiivne,ja Positiivne,Osaline Viitab et Edetabel vastavalt et ABCORA2.0nagu Määratud in Täiendava Laud5.c Tundlikkus ja Spetsiifilisus albaania ABCORA2Test Versioonid Põhineb on  Kombineeritud Koolitus ja Valideerimine kohort andmed Kujutatud in(a). Osakaal albaaniavalenegatiivne Proovid(Tundlikkus;roheline)ja proportsioon albaaniavalepositiivne Proovid(Spetsiifilisus;sinine)On Esindatud poolt  Vähendamine albaania100% (Välimine Ringi)per Segmendi.d Hindamine albaania ABCORA2.0 koos  Rahvuslik Instituut sest Bioloogilised Standardid ja Kontroll(NIBSC)Anti SARS-CoV-2Kontrollimine Paneel(20/B770)koosnevad SARS-CoV-2Positiivne(punane)ja Negatiivne(sinine)paneel Seerumi Proovid.Hall Kastid Näitavad Väärtused Eespool  ABCORA2.0MFI-VAENLANE Lõigata-Off sest SARS-CoV-2konkreetsed vastused sest isik Antigeeni-Ig Kombinatsioonid.Boxplots esindama  järgmine:Keskpärane koos  Lähis liin,Ülemine ja Madalam kvartiilid koos  kasti limiididja 1,5x interquartile Vahemikud koos  Niitkristallid.

InfektsioonidkoosRinglevainimkoronaviirused(HCV), alfakoronavirus(HCV-229E,HCV-NL63) ja beetasüdamik-Koroonaviirus(HCV-HKU1,HCV-OC43),On ühine jaAitavad kaasa Oluliselt et  Hooajaline Hingamisteede tõbi koorem in Inimestele23,24.  Vaatamata üldisele tagasihoidlikule järjestuse homoloogiale between SARS-CoV-2ja Ringleva HCOV-d,mitu Konserveerunud Piirkondade eksisteerima ja antikeha rist-Reaktsioonivõime Mai esinema25–27. Kuigi Jättis in  Diagnostikavalepositiivseteks tulemusteks seadmine28, ristreageeriv Antikehade Mai karu Bioloogilised asjakohasus, nagu on soovitatud SARS-CoV-2S2rist-neutraliseerimine  Antikehade29.Ebakindlus Jääb,kuid kas ristreageerivad HCV antikehad responsesMõjuevolutsioonalbaania  SARS-CoV-2speciÜhenduscImmuunsus. Positiivne Mõju poolt Pakkudes varajane madal AfÜhendusnity Mem-Ory Vastused et ehitama on ja küps nagu hästi nagu Negatiivne in- järgnevadencesIngantigeennepatt   põhimõte30   pooltSuurendada mittekaitsv rist-reaktiivsed antikehad de novo arvelt Vastused Võib olema Kavandatud.  Eriti tähelepanuväärne on see, et ristreageeriv HCoVT Helper rakk Vastused Olid näidatud et positiivselt mõju SARS-CoV-2 spetsiifiline immuunsus31. Seda arvesse võttes on Eelnevalt-Olemasolevate Immuunsus tähtaeg et Eelneva Nakkus koos HCOV-d taheMuutunudtähtis in Kliinilised Diagnoosi ja Strateegiad et rekordaNdEsitlebkompleksvastastikused sõltuvusedHCV  ja  SARS- CoV-2 vastused sIdepooltpoolOnVajaetÜhendusllseeteadmine Gap.

Siin me aruanne seroloogilise analüüsi väljatöötamise kohta, et VõimaldabmitmefaktorilineseroproÜhendusLingalbaania SARS-CoV-2 ja HCVVastused juures kõrge diagnostiline täpsus. Suure seroprofileerimineSAR-i kohortS-CoV-2Nakatunud ja nakatumata Üksikisikutetingimusel, etpeamised teadmised vastastikusest sõltuvusestEsalbaania HCV  jaSARS-CoV-2antikeha Vastused. Tulemused Rõhutada a Potentsiaali HCV-spetsiifikaadi kaitsev rollcVastusedin  SARS-CoV-2 Omandaminenagusamuti SARS-CoV-2 vastuse kujundamiselpeale Nakkus.

Results

Mitmefaktoriline   seroproÜhendusLing   DeÜhendusNes   SARS-CoV-2speciÜhenduscVastused. Tunnistades vajadust tervikliku SARS-C järeleoV-2 Seroloogiliste profileerimine, et selgitada SARS-CoV-2 keskseid küsimusiImmuunsus ja Oma vastastikused sõltuvused koos HCV Vastused,meLoodud a helmepõhine multipleksi immunoanalüüs spetsiifilise mõõtmiseks IgG,IgA ja Igm Vastused SARS-CoV-2 RBD, S1, S2 ja N (Täiendava Fig. 1). Test Kirjed kokku 12 SARS-CoV- 2spetsiifilised antikeha parameetrid (4 antigeeni 3 Ig klassis) kooskõrge diagnostiline täpsus (vt meetodid, Täiendav Joonised 1–3 ja lisatabelid 1, 2) ning sisaldavad lisakseS1 proteiin albaania HCV-HKU1et ekraan rist-Reaktiivne Antikehadekõrvuti SARS-CoV-2 vastused. Vastavalt testi ülesehitusele jälgida, et jälgidatibodies et Kaks koronaviirused,me Nimetada  Test AntiBoDy Koroonaviirus Test(ABCORA) 2.0.

Mõõtmisi ABCORA-s väljendatakse järgmiselt:Keskpärane Lures- teaduse intensiivsus (MFI) parandatud for Taust siduv(ümberpööratudtühi Helmed,VAENLANE).ToEristada  SARS-CoV-2-spetsiifiline cross-reac'isttive Antikehade,me DeÜhendusNed MFI-VAENLANE Künnised iga 12 SARS-CoV-2 antigeeni ja Ig klassi kombinatsiooni kohtasPõhineb on Plasma antikeha Reaktsioonivõime in Koolitus kohordid albaaniapandeemiaeelneterveRahastajad(Koolitus  Mina,N = 573), doonorid, kellel onhiljutine HCV Nakkus(Koolitus II,N= 75)ja Rahastajad koosConÜhendusrmed SARS-CoV-2 infektsioon (III koolitus, N = 175) (joonis.1a, Täiendava Tabel 3).  Positiivsed kõnekriteeriumid määratletiTeha kindlaks etinjuuresVähemaltKaksalbaania12 antigeenija  IgCombinatsioonid  künnis On Jõudnud(Täiendava Laud4).ÜhendusnalkünnisjaPositiivnekutsumaKriteeriumidLubatudsestDiferentseerimine albaania Osaline(ainus Igm ja IgA Vastused)et täisserokonversioon(Sealhulgas IgG Vastused).Sisse liitmine, KriteeriumidtähistabProovidkoosw k kReaktsioonivõimeja/võimääratlematareaktsioonivõime (Täiendav TabLe5).

Fig. 2Kvantifitseerimine albaania SARS-CoV-2konkreetne antikeha Vastused.a–c Jaotus albaania(a) 50%efektiivne Kontsentratsioonid(EÜ50;Väljendatud nagu vastastikune plasma Lahjendamine)ja (b)pindala all  Kõver Väärtused(AUC;Väljendatud nagu MFI)albaania tiitritud Plasma albaania SARS-CoV-2Positiivne Täiskasvanut(N= 72)MõõdetudABCORA 2.0. c Tiitritud SARS-CoV-2RBD ja S1Vastused Olid Kvantifitseeritud kasutades RBD-spetsiifiline Monoklonaalse antikeha CR3022 (Toodetud nagu IgG,IgA, ja Igm;Väljendatud nagu Ng/Ml)naguaVälise standard.Nägema Täiendava Fig. 7sest Täiendavaid Kvantifitseerimine koos  KES Rahvusvaheline Standard Anti- SARS-CoV-2Immunoglobuliin.d Spearman korrelatsioon maatriks, mis hindab ABCORA 2.0-põhiste kvantifitseerimislugemiste vahelist kokkulepet (EC50, AUC, RBDAb Standardiseeritud), alus MFI-VAENLANE Mõõdetud juures1/100Plasma Lahjendamine(Logi),Märgitud kokkuvõtvaltlogi MFI-VAENLANE Väärtused(1/100 lahjendamine) ja Roche Elecsys Anti-SARS-CoV-2 (S)Test Tulemused(U/Ml).Mitteoluline korrelatsioonid On Vasak tühi.Tasemed albaania Tähtsus On Hinnata poolt a Kaks-Kahepoolne katse on asümptootiline t Ühtlustamise albaania Spearman's Auaste korrelatsioon ja Parandatud poolt  Bonferroni Meetod sest Mitu Katsetamine(p < 0.05/780).="">Värv varjutamine tähistabkorrelatsioon Koefitsient.

Pre-Pandeemia Patsientidel koos Dokumenteeritud,hiljutine HCVNakkus(Koolitus II,N= 75;OC43 (N= 27),HKU1 (N= 17), NL63(N= 22), 229E(N= 9))koosneb isikutest, kellel on erinevadAluseks   Tugev   Haiguste   Sealhulgas  immuunpuudulikkusegaPatsientidel et Läbis Diagnostika Sõelumine sest HCV.HCV speciÜhendusc aktiivsus Tehti Üldine Madalam in see sündroomne rühm Aganäitas, nagu oodatudd,Rikastatud  HCoVReaktsioonivõimevastu infecting HCV(Täiendava Fig. 4).Tähtsam,me Täheldatud Ei ristreaktiivsuse näitamine SARS-CoV-2 antigeenidega, mis Mõjutada  ABCORA Näit(Fig.1a,b). Kõigi andmete arvestamine koolitus kohordid (I–III), ABCORA2.0Näitusel kõrge Tundlikkusja speciÜhenduslinn,Jõuda94.29% tundlikkus ja 99,07% spetsiifilisus (Fig.1c,Täiendava Tabel 3).

To võimaldada risttegevuse ja üksteisest sõltuvate LINNAD SARS-CoV-2 ja HCV antikehade vahelEs,me Registreeritudreaktsioonivõime HCV-H S1 üksuseleKU1in liitmine et  SARS- CoV-2Antigeenide(Fig.1a).Tänu et  kõrge Levimus albaania HCV antibodies ja  järgnev Puudub albaania Tõsi-Negatiivne Kontrolli,me komplektEiKünnisedethinnata HKU1 reaktsioonivõimet positiivseks/negatiivseks.Üldiselt oli SARS-CoV-2 ristreaktiivsus pre-pa-s madalndeemilineProovidVaatamataMärkimisväärne  HKU1aktiivsus(Fig. 1a). Korrelatsioon analüüs Näitas tagasihoidlik vastastikused sõltuvused SARS-CoV-2 jaHKU1 Plasma antikeha Reaktsioonivõime in SARS-CoV-2Positiivne ja pre-Pandeemia Rahastajad.   See hõlmas peamiselt IgM-i vastust, kusjuures isikud, kellel on hiljutine HCV-infektsioon, näitavadKõrgeimkorrelatsioon IgM-is HKU1 ja SARS-CoV-2 puhulAcefektiivsus(Täiendava Fig. 5).Need andmed Allakriipsutus et a madal on olemas ristreaktiivse tegevuse tase, mida tuleb austadad inTest disain, analüüs ja valideerimine.

VeriÜhenduscation albaania ABCORA2.0eraldi valideerimiskohortide kohtaEelnevalt-Pandeemia terve Täiskasvanut(N= 252), pandeemiaeelsed lapsed(N = 169) ja isikud, kellel on dokumenteeritud SARS-CoV-2 Nakkus(N= 214) (Fig.1a,b, lisatabel 3) kinnitatud The Kehtivus albaania  Valitud Test Kriteeriumid.Ühendades Koolitus jaSARS-CoV-2 p valideerimiskohordidositive Üksikisikute(N= 389)jaNegatiivneKontrolli (N = 825), ABCORA 2.0 saavutasTundlikkus albaania 94,60% ja spetsiifilisus 99. 16% (joonis.1c).

Pange tähele, kui analüüsite children ja Täiskasvanut in  Valideeriminekohort Eraldi,me täheldati veidi madalamat spetsiifilisust lapsed(98.82%)VõrreldesetTäiskasvanut(99.60%),TõstmineVõimalus et rist-Reaktiivne aktiivsus in lapsed Mai olema rohkemLevinud kui täiskasvanutel. Tõepoolest, pandeemiaeelsed lapsed näitasida suurem korrelatsioon IgM HKU1 ja SARS-CoV-2 vahel (täiendavJoonis 5c), rõhutades seda tõlgenduston albaania Igm SARS-CoV-2 tegevus võibolema kompleks.Arvutuslik Analüüsid Maksimeerida speciÜhenduslinn ja Tundlikkus albaania

SARS-CoV-2seroproÜhendusLing.To Täiendavaid SuurendadaspeciÜhenduslinn albaania  Näit,me järgmine Uurida kaks arvutusanalüüsi laiendust, logistiline regressioonimudel (ABCORA 2. 1) ja juhuslik fopuhkamamudel (ABCORA2.2).Mõlemad analüüs Strateegiad Olid Kehtestatudon  Identsed Koolitus dataset(Koolitus Mina–III)Kasutada sest häälestusalbaania  ABCORA2.0.Selle asemelalbaaniaSaamise12 isikKünnised(Üksperantigeeni ja Ig klass), arvutuslik mudelitel hinnatakse ainult tõenäosust, et proov on positIveandes composite tulemus Kogu kõik12Mõõtmised ja JooksiskIngSera PositiivnevõiNegatiivne(1,  0classiÜhenduscation).Sest logistiline regressioon  ABCORA2. 1,meRühmitatud  SARS-CoV-2 siduvad tegevused, millel on suur korrelatsioon (Supplementary Fig. 6a)ja lisatud  tähendama väärtus albaania Oma MFI-Vaenlased mudelis.  juhuslik mets Mudel ABCORA2.2lisatud kõik12 SARS-CoV-2 vastused mõõdeti ja liideti 1000classiÜhenduscation Puud.Sees  Kombineeritud Koolitus ja valideeriminekohordidalbaania  SARS-CoV-2PositiivneÜksikisikute(N= 389)ja negatiivne Kontrolli (N= 825),ABCORA2.2Saavutatud a SilmatorkavTundlikkusalbaania97.43%ja a speciÜhenduslinn albaania99.91%edestadesmõlemad ABCORA2.0ja2.1. Pange tähele, et ABCORA positiivne helistamine 2.2Tehti Domineerivad IgG vastustega (täiendav joonis 6b).

Me järgmine Uurida Kasinkorporeerimine albaania HKU1reaktiivsus  juhuslik mets Mudel Mai Täiendavaid parandama  kutsudes speciÜhenduslinn ja Tundlikkus.Tõepoolest,a mudel, mis sisaldas HKU1S1naguTäiendavaidmuutuja(ABCORA  2.3) suurenenud tundlikkus albaania 97,43% ABCORAs 2,2 kuni 98,20% (joonis.1c, Täiendav Tabel 3) ilma reducitaMine albaania  speciÜhenduslinn.A Tundlikkusristkinnitamine analüüs koos Randomiseeritud Koolitus ja Valideerimine komplektConÜhendusrmedJõudlustalbaania ABCORA  2.3 (Täiendav Tabel 6). OwiNg et Oma Kombineeritud kõrge Tundlikkus ja speciÜhenduslinn, seetõttu valisime ABCORA 2.3 reiting ülemaailmne SARS-CoV-2 serokonversioon.

Me järgmine veriÜhendusEd täpsus ABCORA 2.0 ja 2.3 inpositiivse ja negatiivse SARS-C määratlemineOv-2Immuunsüsteemiolek, mis kasutab  Rahvuslik  Instituutsest  Bioloogilised  Standardidja kontroll(NIBSC)Anti  SARS-CoV-2VeriÜhenduscation  Paneel(20/ B770)32. See verification paneel sest seroloogia analüüsid Sisaldab23 positiivne ja 14 negatiivne seerum samplesjaVõimaldabOtsestvõrdlus with muu katse Süsteemid32.Mõlemad ABCORA VersioonidNäitas100%Tundlikkus ja100%speciÜhenduslinn on kontrollimine Plasmapaneelja võrreldud soodsalt kaubandusliku analüüsiga Süsteemid  (Joonis.1d, lisatabel 7).  Ristviitele needVäliseveriÜhenduscationtulemusi, võrdlesime järgmisena Sensitiivsus albaania  ABCORA Katsed ja Kolm Kaubanduslik seroloogiakatse Süsteemid on a alamhulk albaania  SARS-CoV-2Positiivne Koolituskohort (kohort III, N = 171).  Analüüsid, mis on suunatudN  proteiin(Elecsys® Anti-SARS-CoV-2 (Roche Diagnostics GmbH)), theRBD Piirkond albaania  S proteiin(Elecsys®SARS-CoV-2 S analüüs (Roche Diagnostika Gmbh)),ja  S1alaühik (EUROIMMUNAnti-SARS-CoV-2Lisatud on ELISA (IgG)).  TulemusedconÜhendusrmedanalüüsonrahvusvaheline  NIBSC20/B770 Plasma paneel,ABCORA 2.0 ja ABCORA 2.3 näitavad, et kõrgeim tundlikkus testitud analüüside hulgas (täiendavy TVõimalik8).

Seega järeldame, et ABCORA2.0seroproÜhendusLingkombinatsioonis koos  ABCORA2.3DeÜhendusNesPositiivsuskoosKõrgeim speciÜhendusLinn ja tundlikkus. Individuaalne antigeeni vastus hindamine ABCORA 2.0 poolt määratleb se etapiroconversionolek Põhineb on isik IgM, IgA ja IgG piirväärtused jaSeeläbi Täiendab ja Maksimeerib Teave, mida saab saadud ABCOR pooltA2seroproÜhendusLing.

Fig.3Assotsiatsiooni albaania siduv ja Neutralisatsiooni aktiivsus in varajane ja hilja Nakkus.a50%Neutralisatsiooni tiitrid(NT50)tiitrid vastu Wuhan-Hu-1pseudotüüp in Patsientidel koos Teada Positiivne SARS-CoV-2RT-PCR kuupäev(N= 369).Patsientidel Olid kihistunud vastavalt et Aeg alatesesimene Diagnoosi et uurida varajane (vähem kui30Päevadrt-PCR-järgne,Lavendel)ja hilja(rohkem kui30Päevadrt-PCR-järgne,türkiis)Neutralisatsiooni Vastused. Erinevusvahel need Kaks Rühmad Tehti Hinnata koos a Lineaarne Segatud Mudel koos Aeg alates RT-PCR(Binaarne muutuja varajane/hilja)naguaFikseeritud mõju ja isik Nagu juhuslik mõju ja kasutades Satterthwaite Ühtlustamise sest a Kaks-Kahepoolne t-katse on  parameeter Seostatud koos Aeg alates RT-PCR.Boxplots esindama järgmine: Keskpärane koos  Lähis liin,Ülemine ja Madalam kvartiilid koos  karp Piiridja 1,5x interquartile Vahemikud koos  Niitkristallid.b Lineaarne regressioonianalüüs et MääratledaAssotsiatsiooni vahel Neutralisatsiooni(Vastastikune NT50)ja antikeha siduv(MFI-VAENLANE). Must Read Näitavad Lineaarne Regressiooni ennustused ja hall Varjutatud Valdkondades Vastavad et 95%Usaldust Intervallid.Tulemused Kujutada varajane(Lavendel),hilja(türkiis),ja täis kohort(must).n.s.tähistab mitteolulist Tulemused.Tasemed albaania Tähtsus On Hinnata poolt a Kaks-Kahepoolne katse on  asümptootiline t Ühtlustamise albaania Spearman's Auaste korrelatsioon, ja parandatud poolt  Bonferroni Meetod sest Mitu Katsetamine(p < 0.05/1200,="">nägema Täiendava Viigimarjad. 8b ja9).

Ennustavad  SARS-CoV-2Neutralisatsiooni  Põhineb  on  ANCORA

seroproÜhendusLing.Määramisel Neutralisatsiooni aktiivsus On Kriitiline etgabariidi protective Immuunsus.Kuigi Neutralisatsiooni Võib olema Otsemõõdetakse mitmesuguste autentsete viiruste või pseudovirudegas SARS-CoV-2neutraliseerimiskatsed5,22,33, kohaldades otsest sidumist võivõistlustestid neutraalsete surrogaatidenaMine aktiivsus Jääb hiGh huvi sest Diagnostika Eesmärkidel kus rakk-Põhineb analüüsidOn rohkem difÜhenduskultus et Rakendada33,34.Sisse Konkreetse,S1ja RBDbinding ja ÄSS2võistlus On Olnud näidatud et korrelaat hästi koos Neutralisatsiooni aktiivsus5,8,10,19,33–37. Neutraliseerimise uurimine ennustajad põhinevad ABCORA 2.0, me probed in aÜhendusesimene samm Capalinn albaania ABCORA et tuleta Kvantitatiivne S1ja RBD lugemised in a alamhulk SARS-CoV-2 positiivsetest patsientidest (N = 72). ANCORA2.0 leetridements albaania seeriaviisiliselt Lahjendatud Plasma Olid Läbi et tuleta50%efektiivsed kontsentratsioonid (EC50, väljendatunaProcol Plasma Lahjendamine)ja pindala all  Kõver Väärtused(AUCväljendatuna MFI-na) kõigi 12 SARS-CoV-2 parameetri kohta (joonis.2a,b). Minan liitmine,me quantiÜhendusEd SARS-CoV-2RBD ja S1VastusedVia  RBD speciÜhendusc mAb CR302238  (Fig.2c)ja  KESRahvusvaheline standard Anti-SARS-CoV-2 ImmunoglobulinNIBSC20/13632 (Täiendav joonis 7b, täiendavad andmed nr 1). Sest thOnmequantiÜhendusEdVastavatesantikehasisualbaaniaa Positiivnekontroll   SARS-CoV-2DoonoriBasseinlisatudinkõik ABCORA Mõõtmised ja Väljendatud  antikehade sisaldus individuaalne plasma samplesumbes see(Fig.2cTäiendava Fig. 7).Me siis sondeeritud milline ABCORA kvantitatiivnelugemised korrelatsioonis parim koos iga muu, alus Näit albaaniaABCORA 2.0 (MFI-FOE plasmalahjendusel 1/100) ja theKvantitatiivne Roche Elecsys S katse (U/ml) (Joonis.2c, Täiendav Joonis 7). In addition et  isik Antigeeni Parameetrid,me samuti kumulatiivseks ümberarvutamisekssponse Väärtused.Need Olid Kokku viljapea Reaktsioonivõime(Summa albaania RBD,S1 ja S2 kõigis Ig klassides), Ig klassi spike reaktsioonivõime (S1, RBD ja S2 summa ühe isotüübi puhul) ja antigeennspeciÜhendusc Reaktsioonivõime (Summa albaania kõik Ig Klassid sestÜksAntigeeni).Meobserved a Tõeliselt Hea korrelatsioon Kogu  Mitmekesine viljapea testitud parameetrid (joonis.2d). Märkimisväärne erand oli klassikalineal EÜ50Väärtused,kumb Näitas Ei et nõrk korrelatsioonKogu kõikParametersSealhulgasKaubanduslikkatse.Huvitav,AUCVäärtused,kumb in Kontrasti et EÜ50On a Komposiit meede kontsentratsioonist ja signaal tugevus,teostatud hästi.Albaania pange tähele, et meTäheldatud Väga muutuja  SARS-CoV-2antikehade annus-vastusKõverad,Jõuda in meie kohort isik platood üle a4-LogiVahemik(Täiendava Fig.7). Neid platoosid austatakse AUC lugemine ja seda salvestab ka põhiline MFMina-FOE ABCORA Näit juures1/100Plasma Lahjendamine,Aga On ei Con-

EC50 määramistes kõrvale jäetud.  Tõepoolest, põhilised rahaloomeasutusteVAENLANENäitas a suur korrelatsioon kvantitatiivsete ettelugemistega testitud variables Sealhulgas  Kvantitatiivne Kaubanduslik Roche Elecsys S test.

Nende tulemuste põhjal järeldame, etdet  MFI-VAENLANENäit Üksnes juures 1/100Plasma Lahjendamine Pakub a VägaRelminaVõimalik hinnang sest  S1ja RBD antikeha sisu in Plasma mida saab kasutada kvantifitseerimise puhverserverina, ilma et oleks vaja tiitri samplEs.Me Seetõttu tööle võetud  alus MFI-VAENLANE in  next samm et DeÜhendusNe Neutralisatsiooni ennustajad.

Neutraliseerimistegevus Wuhan-Hu-Hu-le- 1 in   SARS-CoV-2 positiivsed isikud (N = 467), kes kasutavad establitShed SARS-CoV-

2pseudoviirus Neutralisatsiooni katse5,22,33 selgus, et suur hulk 50%neutraliseerimine tiitrid(NT50)  (post Positiivne RT-PCR Fig. 3a(N = 369), sümptomite ilmnemine,y  Fig.  8a(N = 333)),in liin koos eelmineÜhendusndings5,8.Varajane in Nakkus(sees30Päevad albaania Positiivne RT-PCR)Neutralisatsiooni tiitrid OlidsigniÜhenduscantly Kõrgem(p <>) ja korreleerub paremini siduva Parameetrid.Nagu oodatud, näitasid IgG vastused oga antigeenideleKõrgeimkorrelatsioonkoosNeutralisatsiooniaktiivsus(Fig.3b, Täiendava Viigimarjad. 8,9). Järgmisena rühmitasime patsiendid vastavaltpopulatsioonintokõrge(NT50 > 250,N=332) ja ei või madalneutraliseerijad(NT50 < 250,="" n="">39 (Joonis.4a) ja võrreldiennustus võime albaania Kuus erinev classiÜhenduscation Mudelid et MäärataÜksikisikute Põhineb on Oma ABCORA 2.0 siduvad mustrid nendele GroUps.Muutumatu logistiline Regressiooni(ULR)Mudelid kaasa arvatud ainult Üks muutuja:kas  tähendama albaania MFI-VAENLANE S1taasaktiveerimine(ULR-S1) või MFI-FOE RBD taasaktiveerimise keskmine (ULR- RBD). Mitme muutujaga logistiline regressioon (MLR) sisaldas mõlemat S1 and RBD tähendama taasaktiveerimine. Täiendavaid Mudelid lisatud kõik12 antigeenide taasaktiveerimine mõõdetuna ABCORA-s ja comprisedarandommetsLäheneminejaKaks  MLR  StrateegiadPõhinebonpõhimõte Komponent analüüs(PKL, 2ja4 fiesimene Telgede).MudelidOlidVõrreldesPõhinebAUC-l ja BIC-l (Bayesian)informatsioon  kriteerium40)ristkinnitamise teel (joonis.4b, c).  Kõikmudelid perMoodustatud Samamoodi,koos  muutumatu Mudel Põhineb on  tähendama albaania S1 taasaktiveerimine (ULR-S1), mis annab parima BIC väärtuse. VastuvõtjaTegutsevadKõver(ROC)ULR-S1 põhjal tehtud analüüsNäitasa  HeaVõimsuseneutraliseerimise staatuse ennustamiselSaades AUC0.90 (N = 467, joonis.4d). Erinevate katkestuste uurimine kuni balance Tundlikkus ja speciÜhenduslinn Hoida mõlemad Eespool80%,meValisetmäärata proovid kõrge neutraliseerijate rühmale, kui selle Prognoositud tõenäosus oli üle 70%. See vastabn83%speciÜhenduslinninÕigestiMääramineneutraliseerijad ja 80%tundlikkus neutraliseerijate määramisel (joonis.4d, e). Increas'ilee kasulikkus albaania  ULR-S1 ennustusmudel kliinilise diagnostika jaoks, me välja töötatud modifitseeritud neutraliseerimise ennustusmudel ULR-S1-SOC-l põhinev on  SOC Väärtused Teatatud sest ABCORA2.0.Juures70%Ennustatud Tõenäosus,ULR-S1-SOC pakub neutraliseerimise eel-diktsioon si-smilarTundlikkus(81%)jaspeciÜhenduslinn(81%)pooltuurides, kas kombineeritud S1 SOC väärtus (S1 SOC val summaues for  IgG,IgA,ja  Igm)OnallpoolvõiEespool9.7   (Fig.4f). Vastavalt vastab S1 SOC väärtus üle 17,3 totundlikkusalbaania67%ja speciÜhenduslinn94%.Albaania märkus, omavahel seotud seosedvahel Neutralisatsiooni ja S1Tasemed olid võrdselt ilmsed, kuimesondeerituda  MadalamLõigata-mahaalbaaniaNeutralisatsiooni(NT50<>) (Täiendav joonis.  10, lisatabel 9). Seetõttu oleme Sõlmida et  alus SOC Näit in ABCORA 2.0 suudab pakkudaa Usaldusväärne ennustus albaania kõrge Neutralisatsiooni aktiivsus.

Fig. 4Ennustavad Neutralisatsiooni Võimsuse nagu a funktsioon albaania siduv aktiivsus.a SARS-CoV-2Positiivne Rahastajad(N= 467)Olid kihistunud into kõrge neutraliseerijad(NT50>250,N= 332;sinine)ja Ei/madal neutraliseerijad(NT50< 250,="">N= 135;hall),Põhineb on Oma Neutralisatsiooni aktiivsus vastu Wuhan-Hu-1.b,c Võrdlus albaania  ennustus võime albaania Kuus erinev liigitus Mudelid kasutades100rist-Valideerimine Komplekti(Jagatud nagu80%sest Koolitus ja20%kinnitamiseks). b Võrdlus albaania Mudelid pooltpindala all  Kõver(AUC).Iga Dot Vastab et Üks rist-Valideerimine komplekt.c Bayesi informatsioon kriteerium(BIC)albaania  viis mudelit, mis põhinevad logistilisel regressioonil. Erinevad mudelid on muutumatud logistilised regressioonid (ULR). ULR-RBD: MFI-FOE RBD keskmine.ULR-S1: MFI-FOE S1 keskmine. Mitme muutujaga logistiline regressioon (MLR). MLR-S1, RBD: S1 reaktsioonivõime keskmine ja RBD reaktsioonivõime keskmine. MLR-PCA2 jaMLR-PKL4:MLR albaania2 ja4esimene telg albaania PKL analüüs,vastavalt.PKL Tehti Põhineb on kõik12SARS-CoV-2antikeha taasaktiveerimine Mõõdetud poolt ABCORA2.0.  Juhuslik mets (RF) kaasa arvatudDing kõik antikeha taasaktiveerimine Mõõdetud poolt ABCORA2.0.Boxplots esindama  järgmine:Keskpärane koos  Lähis liin,Ülemine jaMadalam kvartiilid koos  karp Piirid,1,5x interkvartiilsed vahemikud vurrudega ja võõrväärtused punktidega. d ULR-S1 hinnanguline ROC kõver, mis põhineb täielikul andmekogumil (N = 467).e Mõõdetud NT50väärtus versus Tõenäosus albaania NT50 > 250nagu Ennustatud poolt ULR-S1in Viisjuhuslikult valitud Valideerimine Komplekti(iga sümbol vastab et a Valideerimine komplekt). Lillakas värvi Sümbolid Näitavad a Kõrgem kui0.70Tõenäosus albaania  Vastavates Proovi et olema neutraliseerimine juures NT50 > 250ja On Seetõttu tähistatud nagu kõrge neutraliseerijad.Hall Näitab Proovid koos Ennustatud Neutralisatsiooni NT50< 250,="">Seetõttu Salastatud nagu Ei/madalad neutraliseerijad.f Neutralisatsiooni ennustus Põhineb on a Muudetud ULR-S1Mudel Kasutades  Diagnostika Näit SOC Selle asemel albaania MFI-VAENLANE Väärtused nagu Sisend.Mõõdetud NT50väärtus versusSumma albaania S1SOC väärtused (IgG, IgA, IgM) on kujutatud. Kriipsjooned vastavad horisontaalselt NT50 = 250-le ja S1 SOC-de summale= 9,7Vertikaalselt. SummaalbaaniaS1SOKid= 9,7Vastab et  Künnised Kujutatud sest ULR-S1in(d,e). hall Varjutatud pindala Vastab et tõelised positiivsed küljed(Üksikisikute koos NT50 > 250Ennustatud nagu kõrge neutraliseerijad).