Taust.Ägeneerukahjustus(AKI) on dekompenseeritud tsirroosi sagedane komplikatsioon koos suurenenud suremusega. Traditsioonilised biomarkerid, nagu seerumi kreatiniin, ei ole tundlikud vigastuste tuvastamiseks ilma funktsionaalsete muutusteta. Me oletame, et uriini eksosoomid võivad sisaldada markereid, mis eristavad haiguse tüüpi.neerukahjustustsirroosiga patsientidel.

meetodid.See on prospektiivne, ühekeskuseline ja vaatlusuuring täiskasvanud tsirroosiga patsientidel. Patsiendirühmadesse kuulusid terved normaalsed kontrollid, kompenseeritud tsirroos normaalseganeerufunktsioon, dekompenseeritud tsirroos normaalseganeerufunktsioonja dekompenseeritud tsirroos koos AKI-ga. Andmed ekstraheeriti elektroonilisest tervisekaardist, sealhulgas maksahaiguse etioloogia, MELD skoor, dekompensatsiooni ajalugu, Child-Turcotte-Pugh skoor, AKI ajalugu ja kokkupuude ravimitega. Uriiniproovid koguti nõusoleku andmise ajal. Analüüsiti uriini eksosoomi valgusisaldust ja proteoomilised andmed kinnitati immunoblotanalüüsiga. Statistiline analüüs hõlmas osalist vähimruutude diskrimineerivat analüüsi koos muutuva tähtsusega projektsiooni tuvastamisel.

Tulemused.Registreeriti 18 tsirroosiga isikut ja meie biorepositooriumist ekstraheeriti kuus tervet kontrollisikut. Eraldati uriini eksosoomid ja tuvastati 1572 valku. Maltaas-glükoamülaas oli parim eristav valk, mida kinnitas Western blotting.

Järeldused. Tsirroosi ja AKI-ga patsientidel on uriini eksosoomides neeruharja piiride disahharidaasi (MGAM) ülesreguleerimine, mis võib eristada selle tüüpi.neerukahjustustsirroosi korral; selle kliiniline tähtsus nõuab aga täiendavat kinnitamist.

Lisateabe saamiseks võtke ühendust:joanna.jia@wecistanche.com

Äge neerukahjustuspoolt ravitaksecistanche

1. Sissejuhatus

Ägeneerukahjustus(AKI) esineb ligikaudu 20 protsendil tsirroosiga hospitaliseeritud patsientidest [1, 2]. AKI on haiglaravil viibivatel tsirroosiga patsientidel sageli progresseeruv, raske ja sõltumatu negatiivne suremuse ennustaja [3]. *AKI kõige levinum põhjus tsirroosi korral on hemodünaamiline, mis moodustab 70 protsenti juhtudest. Äge tubulaarnekroos (ATN) moodustab 30 protsenti juhtudest ja postrenaalsed põhjused on haruldased, moodustades vähem kui 1 protsendi juhtudest. Hepatorenaalne sündroom (HRS) on hemodünaamiline, ilma et oleks võimalik tuvastadaneerukahjustusvõi haigus ja seda esineb ligikaudu 20 protsendil tsirroosiga patsientidest [4, 5].

Seerumi kreatiniinisisaldus (Scr) on hindamiseks kõige laialdasemalt kasutatav biomarkerneerufunktsioonja tuvastadaneerukahjustus. Hindawi Critical Care Research and Practice Volume 2019 jaoks on SCR aga tsirroosiga patsientidel suboptimaalne, mitmel põhjusel, sealhulgas maksa tootmise vähenemine, lihaste kurnatus koos vähenenud varudega, suurenenud jaotusruumala ja valgu-kalorite alatoitumus. Keskmised Scr väärtused on tsirroosiga patsientidel madalamad kui üldpopulatsioonis, mille tulemuseks on AKI diagnoosimine hilinenud, tuginedes AKI praegusele määratlusele [6]. Lisaks on Scr biomarkerneerufunktsioonja see ei ole tundlik vigastuse marker. AKI tuvastamise parandamiseks ja AKI etioloogia eristamiseks on ilmnenud uudsed neerukahjustuse biomarkerid.Neerukahjustusbiomarkerid, sealhulgasneerukahjustusmolekul -1 (KIM-1), neutrofiilide želatinaasiga seotud lipokaliin (NGAL), interleukiin-18, maksa rasvhappeid siduv valk (L-FABP), insuliinitaoline kasvufaktorit siduv valk -7 (IGFBP-7) ​​ja metalloproteinaasi koe inhibiitori-2 (TIMP-2) tase võib olla kõrgem enne Scr-i suurenemist, mis suurendabneerukahjustusilma funktsionaalsete muutusteta [7]. Uuringud on näidanud, et need biomarkerid võivad eristada AKI etioloogiat [8, 9]. Täiustatud biomarkerid AKI tuvastamiseks ja eristamiseks esindavad tsirroosiga patsientide olulisi rahuldamata kliinilisi vajadusi.

Eksosoomid on nanovesiikulid, mis vabanevad elusrakkudest rakkudevahelise suhtluse mehhanismina [10]. *Eksosoomide valgusisaldus on patoloogilistes või stressitingimustes märkimisväärselt muutunud [11–13]. Aastalneerud,eksosoomid viiakse uriini kõigist rakutüüpidest [14, 15] ja uriini eksosoome võib potentsiaalselt pidada katsealuse biokeemiliseks tunnuseks. Kuna uriini eksosoome rutiinselt ei analüüsita, võivad need anda täiendavat tundmatut teavet AKI valgu biomarkerite kohta tsirroosiga patsientidel.

Selle uuringu eesmärk oli hinnata uriini eksosoomi proteoomikat tsirroosi ja AKI-ga patsientidel võrreldes tervete isikutega. Hüpoteesime, et uriini eksosoomi valgusisaldus erineb kompenseeritud või dekompenseeritud tsirroosiga patsientidel, kellel on AKI, võrreldes tavaliste tervete kontrollsubjektidega. Lisaks oletasime, et erinev uriini eksosomaalse valgu sisaldus annab ülevaate selle mehhanismidestneerukahjustustsirroosi korral.

2. Materjalid ja meetodid

See on prospektiivne, ühekeskuseline ja vaatlusuuring täiskasvanud tsirroosiga patsientidel. Kõik uuringus osalenud patsiendid värvati UC San Diego tervishoiusüsteemist ajavahemikul 1. juulist 2013 kuni 1. juunini 2014 ja andsid teadliku nõusoleku. Patsiendid olid kaasatud, kui neil oli diagnoositud tsirroos ja nad suutsid anda uriiniproovi. Tsirroos määrati maksa biopsia, ristlõike kujutise või kliiniliselt (hepatoloogi määratud dekompensatsioonijuhtumi tuvastamise kaudu). Andmed saadi elektroonilistest tervisekaartidest, sealhulgas demograafia, antropomeetria, elutähtsad näitajad, kaasnevad meditsiinilised probleemid, tsirroosi etioloogia, tsirroosi tüsistused (astsiit, veenilaiendid, maksa entsefalopaatia ja hepatotsellulaarne kartsinoom), AKI või hepatotsellulaarne kartsinoom anamneesis.krooniline neeruhaigusja kokkupuude ravimitega 30 päeva jooksul pärast registreerimist. Sellesse uuringusse võisid kaasata ainult need patsiendid, kellel olid täielikud kliinilised andmed ja laboratoorsed testid 30 päeva jooksul pärast registreerimist. Patsiendid liigitati järgmistesse rühmadesse:

(1) Rühm 0: normaalsed terved kontrollid

(2) 1. rühm: kompenseeritud tsirroos (Child-Turcotte-Pugh klass A, MELD 10) ilma AKI anamneesita ja normaalneneerufunktsioon

(3) 2. rühm: dekompenseeritud tsirroos (Child-Turcotte-Pugh klass B või C), millel puudub AKI anamneesis ja normaalneneerufunktsioon

(4) 3. rühm: dekompenseeritud tsirroos (Child-Turcotte-Pugh klass B või C) ja AKI

Tavalineneerufunktsioondefineeriti kui hinnanguline GFR > 60 ml/min/1,73 m2 (MDRD valem), albuminuuria ja AKI anamneesita. AKI määrati AKIN-i kriteeriumide järgi: Scr tõus 0,3 mg/dl 48 tunni jooksul või Scr tõus 50 protsenti algtasemest [16]. AKI-ga patsiendid värvati statsionaarse hepatoloogiateenistuse vastuvõttude ja konsultatsioonide ajal, kui neil oli AKI episoodi ajal võetud vere- ja uriiniproovid. Neljas tervete kontrollide rühm ekstraheeriti tervest normaalsest biorepositooriumist UCSD O'Brieni AKI uurimiskeskuses UC San Diego meditsiinikoolis. * on töö kiitis heaks San Diego California ülikooli institutsionaalne ülevaatenõukogu.

2.1. Uriiniproovide võtmine ja töötlemine eksosoomide isoleerimiseks.

Uriini tsentrifuugiti kiirusel 3000 × g 30 minutit. Supernatandi pH reguleeriti 7-ni, jagati alikvootidena ja külmutati temperatuuril –80 °C. Eksosoomid valmistati polüetüleenglükooli (PEG-i) indutseeritud sadestamisega [17]. * PEG-iga segatud uriiniproove hoiti toatemperatuuril 2 tundi ja tsentrifuugiti 10 000 × g juures 30 minutit. * Pellet resuspendeeriti 10 mM Tris-s koos 1 mM EDTA-Na soolaga. *seda sammu korrati lisandite eemaldamiseks kaks korda. Enne geelisisese trüpsiniseerimist viidi läbi eksosoomivalkude ühemõõtmeline SDS-PAGE, et vältida segadust [18].

2.2. Proteoomiline analüüs.

Geel lõigati mõõtmeteks 1 mm × 1 mm ja värvimist eemaldati 3 korda, kasutades 15 minuti jooksul 100 µL 100 mM ammooniumvesinikkarbonaati, millele järgnes 15 minuti jooksul 100 µL atsetonitriili (ACN) [19 ]. *Supernatant lüofiliseeriti ja saadud pellet redutseeriti 200 µl 100 mM ammooniumvesinikkarbonaadi -10 mM DTT-ga ja inkubeeriti 56 kraadi juures 30 minutit. Pärast vedeliku eemaldamist lisati geelitükid 200 µL 100 mM ammooniumvesinikkarbonaadi-55 mM jodoatseetamiidile. *is inkubeeriti toatemperatuuril 20 minutit pimedas. *Supernatant eemaldati ja pesti 15 minutit 100 mM ammooniumvesinikkarbonaadiga. *et, geelitükkide dehüdreerimiseks lisati 100 µl ACN ja lahus lüofiliseeriti. Seejärel lisati jääkülma trüpsiini (0,01 µg/µL) 50 mM ammooniumvesinikkarbonaadi lahuses, et katta geelitükid seedimisprotsessi jaoks, ja pandi 30 minutiks jääle. Kui rehüdratsioon oli lõppenud, lisati liia asendamiseks värsket 50 mM ammooniumvesinikkarbonaati. trüpsiini ja jäetakse ööseks 37 kraadi juurde. Peptiidid ekstraheeriti kaks korda, lisades 50 µl 0,2-protsendilist sipelghapet ja 5-protsendilist ACN-i, ning segati vorteksiga 30 minutit toatemperatuuril. Pärast supernatandi eemaldamist lisati proovile 50 µl 50% ACN-0,2% sipelghapet ja segati uuesti 30 minutit toatemperatuuril. *is supernatant eemaldati ja kombineeriti esimese ekstraheerimise eelmise supernatandiga. Proove analüüsiti, kasutades Eksigent nano-LC-Ultra® 2D koos cHiPLC-nano flex süsteemiga (Eksigent, AB SCIEX Dublin, CA, USA) lõks-elueerimisrežiimis koos tandemmassispektroskoopiaga, kasutades QExactive massispektromeetrit (Thermo Fisher). Scientific, San Jose´, CA, USA) elektropihustusionisatsiooniga [17].

2.3. Andmehaldus.

Analüüsis kasutati otsingumootorit SEQUEST (tarkvara Thermo Scientific Proteome Discoverer, versioon 1.4). * Meie eksperimentaalsete MS/MS spektrite võrdlemiseks kasutati riikliku biotehnoloogia teabekeskuse (NCBI) Homo sapiens'i trüptiliste peptiidide järjestuste valgu andmebaasi. Peptiidjärjestuste ja nendega seotud valkude tuvastamiseks kasutasime varem avaldatud kriteeriume [17]. Statistilise olulisuse hindamiseks kasutati eraldi siht- ja peibutusotsingut ning klassikaliste skooril põhinevate valede avastamise määrade (FDR) arvutamist. Lõpuks filtreerisime SEQUESTväljundandmed, et määrata valkudele lõplik skoor. Korrelatsiooniskoori (Xcorr) miinimumväärtused 1,5, 2.0, 2,25 ja 2,5 valiti vastavalt ühe-, kahe-, kolme- ja kvadrupoollaenguga ioonide jaoks. Kõrge ranguse tagamiseks kasutati varem avaldatud parameetreid [20] ja valepositiivsete peptiidide suhe oli alla 3 protsendi.

2.4. Statistiline analüüs.

Polüpeptiidide suhtelise arvukuse arvutamiseks kasutati normaliseeritud spektraalset arvukuse faktorit (NSAF) [21]. Enne statistilist analüüsi viidi läbi peptiidide loenduse logi transformatsioon ja skaleerimine. MetaboAnalyst 2.0 veebiportaali kasutati Studenti t-testi, osalise vähimruutude diskrimineeriva analüüsi (PLS-DA) ja muutuva tähtsuse projektsioonis (VIP) läbiviimiseks a priori p < 0.="" 05="" [22].="" *individuaalse="" valgu="" ja="" kogukontsentratsiooni="" suhet="" hinnati="" iga="" rühma="" paaris="" studenti="" t-testi="" abil.="" diskrimineerivate="" valkude="" tuvastamiseks="" kasutati="" pls-da="" ja="" vip="" [23].="" valisime="" western="" blot="" analüüsi="" abil="" valideerimiseks="" valgud,="" mille="" valede="" avastamise="" määr="" (fdr)="" oli="" väiksem="" kui="" 10="" protsenti="" või="" sellega="">

2.5. Lääne immunoblotanalüüs ja kvantifitseerimine.

MGAM-i vastane antikeha osteti ettevõttelt Proteintech Group, Inc. (Chicago, IL, USA) ja seda kasutati 100 ug valgu eraldamiseks iga subjekti uriini eksosoomidest. Pärast eraldamist kanti valgud nitrotselluloospaberile, blokeeriti, inkubeeriti primaarse antikehaga üleöö enne Tris-puhverdatud soolalahusega pesemist, inkubeeriti 1 tund HRP-sekundaarse antikeha konjugaadiga ja visualiseeriti arendamisega, nagu on kirjeldatud meie labori eelmistes publikatsioonides. 24, 25]. ImageJ tarkvara (NIH) kasutati lääne immunoblotribade [24] kvantifitseerimiseks ja joonistati (GraphPad Prism, San Diego, CA, USA).

3. Tulemused

3.1. Tsirroosi kliinilised omadused ja terved kontrollialused.

Igas rühmas analüüsiti kuut täielike kliiniliste andmetega patsienti ja võrreldi kuue terve kontrolliga. Maksahaiguse demograafia ja etioloogia on kokku võetud tabelis 1. Nagu uuringu ülesehituse kohaselt eeldati, varieerusid Child Turcotte-Pugh ja MELD skoorid patsiendirühmade vahel oluliselt.

3.2. Tsirroosiga patsientide ja tervete kontrollide uriini eksosoomide proteoomilised analüüsid.

Kokku tuvastati kõigis 4 rühmas 1572 ainulaadset valku. Seal oli 36 0 valku, mis olid kõigile rühmadele ühised. Leidsime 83 ainulaadset eksosomaalset valku rühma 0 (kontrollid), 250 rühma 1 jaoks, 84 rühma 2 jaoks ja 212 rühma 3 jaoks (joonis 1). Lisaks teostasime valkudel mitme muutujaga PLS-DA, mis näitas selget eraldumist tervete kontrollrühmade ja tsirroosiga patsientide erinevate alarühmade vahel, nagu on näidatud joonisel 2. Kompenseeritud ja dekompenseeritud tsirroosiga isikud ilmaneerukahjustus(rühmad 1 ja 2) näitasid märkimisväärset kattumist, samas kui AKI-ga tsirroosiga patsiendid (3. rühm) näitasid selget eraldumist teistest tsirroosiga isikutest ja tervetest kontrollisikutest. Valkude eraldi ANOVA nelja rühma vahel näitas, et 126 valku olid oluliselt muutunud (p < 0,05),="" millest="" 13="" saavutasid="" valede="" avastamise="" määra="" (fdr)=""><10% (table="" 2).="" maltase-glucoamylase="" (mgam)="" was="" the="" top="" discriminant="" protein="" with="" a="" vip="" score="" of="" 4.35="" for="" the="" entire="" study="">

3.3. Maltaas-glükoamülaasi valgu sisaldus suureneb dekompenseeritud tsirroosilise uriini eksosoomides.

Proteoomilised andmed näitasid MGAM-i kõrgemat kontsentratsiooni dekompenseeritud tsirroosiga patsientide uriini eksosoomides, koos ja ilmaneerukahjustus(rühmad 2 ja 3). See oli kõigi nelja rühma seas kõige eristavam valk VIP-skooriga 4,35 (joonis 3). Nende eksosoomide kinnitav Western blot analüüs näitas tuvastatavat valku ainult tsirroosiga patsientidel.neerukahjustus(3. rühm) (joonis 4).

4. Arutelu

Tegime AKI-ga kompenseeritud tsirroosiga, dekompenseeritud tsirroosiga ja dekompenseeritud tsirroosiga patsientide uriini eksosoomisisalduse proteoomilise analüüsi ning võrdlesime neid tervete kontrollidega. Tsirroosiga patsientide uriini eksosoomide proteoomiline analüüs tuvastas mitu potentsiaalselt olulist biomarkerit.neerukahjustus, eriti MGAM, bifunktsionaalne ensüüm. Me leidsime MGAM-i kõrgeimad kontsentratsioonid tsirroosi ja AKI-ga patsientide uriini eksosoomides. Lisaks suurenes MGAM tsirroosiga patsientidel, kuid mitte nii palju kui AKI-ga patsientidel. Terves kontrollrühmas MGAM puudus, rõhutades selle potentsiaalset rolli kriitilise haiguse biomarkerina.

Sellel uuringul on veel mitmeid olulisi leide. Esiteks, meile teadaolevalt on see esimene aruanne uriini eksosoomivalgu sisalduse kirjeldava analüüsi kohta hästi iseloomustatud tsirroosiga patsientidel. Teiseks on see esimene uuring, milles teatati tubulaarse epiteeli disahharidaasi suurenemisesttsirrootiline-neerukahjustusparadigma. Uriini eksosoomi proteoomilised andmed neljast erinevast rühmast näitasid, et MGAM-i ülesreguleerimine tsirroosi AKI rühmas on tugev ja järjepidev. Maltaas on peamine disahharidaas neeruharjade membraanides [26, 27], kuid selle ensüümi täpne funktsioon ei ole selgelt välja selgitatud; Siiski on oletatud seotud disahharidaaside, sahharaasi-isomaltaasi ja trehalaasi võimalikku rolli suhkru transpordis [28]. Kümnel imetajaliigil on neeruharja piirilt leitud MGAM-iga seotud disahhariide [27]. Farquhar ja tema kolleegid on näidanud, et proksimaalse keerdunud tuubuli mikrovillides esineb maltaas, mis võib-olla toimib glükoosi reabsorptsioonis ja transpordis; ja see neeldumisvõime väheneb nefroni kaugemate osade suunas [29]. Näidati, et MGAM esineb eksosoomides ja mikroosakestes mittealkohoolse steatohepatiidi (NASH) hiiremudelis [30], mis on tavaline tsirroosi põhjus. Kuna tsirroosiga patsientidel on mitu haigusseisundit, mis aitavad kaasa Scr vähenemisele, on AKI tuvastamine problemaatiline. Lisaks on vigastuse etioloogia sageli teadmata ning hepatorenaalse sündroomi ja teiste AKI etioloogiate eristamine on keeruline. Lisaks on AKI-ga dekompenseeritud tsirroosi patofüsioloogia ebaselge, kuna see võib ägeda ja kroonilise maksapuudulikkuse korral kajastada hemodünaamilisi muutusi või põletikulisi vahendajaid [31]. Arutlesime, et tsirroosi ja portaalhüpertensiooniga kaasnevad struktuursed ja funktsionaalsed muutusedneerufunktsioonerineva raskusastmega vastavalt tsirroosi raskusastmele. Need erinevused kompenseeritud ja dekompenseeritud maksahaiguse vahelneerukahjustussaab mõista, uurides järgnevaid tooteidneerud, nagu uriin. Arvestades uriini eksosoomi nefronirakkude oleku-spetsiifilist lasti, oletasime, et uriini eksosoomianalüüs sisaldab võtmeteavet, mis on oluline AKI diferentseerumise jaoks tsirroosi korral. See aruanne on esimene samm selle hüpoteesi kontrollimise suunas.

Sellel uuringuplaanil oli mitmeid piiranguid. Esiteks on analüüsitavate subjektide arv rühma kohta väike. Suurem valimi suurus võis nende andmete tugevust veelgi suurendada ja täiendavad valgud võivad olla jõudnud vastuvõetava FDR-i läveni.<10%. however,="" despite="" this="" small="" sample,="" these="" data="" demonstrating="" mgam="" as="" a="" unique="" exosomal="" protein="" in="" cirrhotic="" patients="" with="" aki="" is="" robust.="" second,="" we="" used="" 1d="" gel="" electrophoresis="" to="" resolve="" the="" exosome="" proteins="" prior="" to="" lc/ms-ms="" analysis="" that="" resulted="" in="" the="" identification="" of="" 1572="" proteins="" overall.="" if="" we="" had="" conducted="" direct="" exosome="" protein="" trypsinization="" instead="" of="" following="" this="" method,="" perhaps="" the="" number="" of="" identified="" proteins="" might="" have="" increased.="" in="" our="" experience,="" exosomes="" are="" packaged="" with="" nonfull="" length="" peptides="" from="" proteolytic="" action="" as="" well="" as="" endogenous="" peptides="" and="" may="" have="" con-founded="" the="" analysis.="" by="" following="" the="" gel="" electrophoresis="" method,="" we="" ensured="" that="" we="" only="" compared="" full-length="" protein="" differences="" between="">

Kokkuvõttes oleme proteoomiliste meetoditega iseloomustanud uriini eksosoomivalkude erinevusi tervetel kontrollidel ning kompenseeritud ja dekompenseeritud tsirroosiga isikutel AKI-ga ja ilma. Knepperi rühma töö näitab, et paljud olulised neeruvalgud (nt akvaporiinid, polütsüstiinid ja podotsiin) erituvad uriini eksosoomidesse [32, 33]. Meie praegune aruanne lisab MGAM-i sellesse funktsionaalselt oluliste neeruvalkude rühma, mis on tuvastatud uriini eksosoomides. Meie leiud viitavad sellele, et MGAM võib tsirroosiga patsientidel eristada proksimaalset tubulaarset vigastust teist tüüpi AKI-st. Tulevastes uuringutes tuleb siiski kindlaks teha MGAM-i ülesreguleerimise kliiniline tähtsus AKI-ga tsirroosiga patsientidel.

Andmete kättesaadavus

Selle uuringu tulemuste toetamiseks kasutatavaid kliinilisi ja proteoomilisi andmeid piirab UCSD institutsionaalne ülevaatenõukogu, et kaitsta patsiendi privaatsust.*Andmed on kättesaadavad dr Linda Awdishu (lawdishu@ucsd.edu) teadlastele, kes vastavad nõuetele. konfidentsiaalsetele andmetele juurdepääsu kriteeriumid.

Huvide konfliktid

Autorid kinnitavad, et neil ei ole huvide konflikti.

Tänuavaldused

Uurimist toetatakse NIH NIDDK UAB/UCSD O'Brieni keskuse toetuse DK0793337 kaudu.

Autor

Linda Awdishu,^1,2 Shirley Tsunoda,¹ Michelle Pearlman,³ Chanthel Kokoy-Mondragon,²Majid Ghassemian,⁴Robert K. Naviaux,⁵Heather M. Patton,³Ravindra L. Mehta,²Bhavya Vijay,⁶ja Satish P.Ramachandra Rao ^2,6,7

1UC San Diego Skaggsi farmaatsia ja farmaatsiateaduste kool, San Diego, USA

2Biomarkerite labor, O'Brieni keskusÄge neerukahjustusTeadusuuringud, nefroloogia-hüpertensioon, UC San Diego, meditsiiniosakond, San Diego, USA

3UC San Diego, meditsiiniosakond, gastroenteroloogia osakond, San Diego, USA

4UC San Diego, keemia ja biokeemia osakond, biomolekulaar- ja proteoomika spektromeetriakeskus, San Diego, USA

5UC San Diego, meditsiini, pediaatria ja patoloogia osakonnad, San Diego, USA

6I-AIM biomarkerite labor, Re Transdistsiplinaarsete terviseteaduste ja -tehnoloogia (TDU) ülikool, Bangalore, India

7UC San Diego, meditsiiniosakond, nakkushaiguste osakond, San Diego, USA

Kirjavahetus tuleks adresseerida Satish P. Ramachandra Raole; Saabunud 30. oktoober 2018; muudetud 31. detsembril 2018; Vastu võetud 19. veebruaril 2019; Avaldatud 16. aprill 2019 Akadeemiline toimetaja: Antonio Artigas

Autoriõigus © 2019 Linda Awdishu et al. See on avatud juurdepääsuga artikkel, mida levitatakse all,mis lubab piiramatut kasutamist, levitamist ja reprodutseerimist mis tahes kandjatel tingimusel, et originaalteosele viidatakse õigesti.

Viited

[1] F. Fabrizi ja P. Messa, "Neerupuudulikkuse ravi väljakutsed enne maksa siirdamist",Kliinikud sisse Maks Haigus, vol. 21, nr. 2, lk 303–319, 2017.

[2] P. Tandon, MT James, JG Abraldes, CJ Karvellas, F. Ye ja N. Pannu, "Uute definitsioonide asjakohasus ägeda haiguse esinemissageduse ja prognoosi suhtesneerukahjustustsirroosiga haiglaravil olevatel patsientidel: retrospektiivne populatsioonipõhine kohortuuring.PLoS One, vol. 11, nr. 8, artikli ID e0160394, 2016.

[3] JM Belcher, G. Garcia-Tsao, AJ Sanyal jt, "AKI seos suremuse ja tüsistustega haiglaravil tsirroosiga patsientidel"Hepatoloogia, vol. 57, nr. 2, lk 753–762, 2013.

[4] G. Garcia-Tsao, CR Parikh ja A. Viola, "Äge neerukahjustustsirroosiga"Hepatoloogia, vol. 48, nr. 6, lk 2064–2077, 2008.

[5] R. Moreau ja D. Lebrec, "Äge neerupuudulikkus tsirroosiga patsientidel: perspektiivid MELD-i ajastul"Hepatoloogia, vol. 37, nr. 2, lk 233–243, 2003.

[6] F. Wong, JG O'Leary, KR Reddy jt, "New consensus definition ofäge neerukahjustusennustab täpselt 30-päevast suremust infektsiooniga tsirroosiga patsientidel,"Gastroenteroloogia, vol. 145, nr. 6, lk 1280.e1–1288.e1, 2013.

[7] PT Murray, RL Mehta, A. Shaw jt, "Biomarkerite potentsiaalne kasutamineäge neerukahjustus: aruanne ja soovituste kokkuvõte 10. ägeda dialüüsi kvaliteedialgatuse konsensuskonverentsist.NeerRahvusvaheline, vol. 85, nr. 3, lk 513–521, 2014.

[8] WK Han, V. Bailly, R. Abichandani, R. Thadhani ja JV Bonventre, "Neeruvigastusmolekul -1 (KIM-1): uudne biomarker inimese neeru proksimaalse tuubuli vigastuse jaoks.Neer Rahvusvaheline, vol. 62, nr. 1, lk 237–244, 2002.

[9] SG Coca, GN Nadkarni, AX Garg jt, "Esimene postoperatiivne urineerimineneerukahjustusbiomarkerid ja seos AKI kestusega TRIBE-AKI kohordis.PLoS One, vol. 11, nr. 8, artikli ID e0161098, 2016.

[10] C. Looze, D. Yui, L. Leung jt, "Inimese plasma eksosoomide proteoomne profileerimine tuvastab PPAR-ic eksosoomiga seotud valguna"Biokeemiliste ja biofüüsikaliste uuringute kommunikatsioonid, vol. 378, nr. 3, lk 433–438, 2009.

[11] J. Conde-Vancells, E. Rodriguez-Suarez, N. Embade jt, "Hepatotsüütide poolt sekreteeritud eksosoomide iseloomustus ja terviklik proteoomiprofiil".Proteome Researchi ajakiri, vol. 7, nr. 12, lk 5157–5166, 2008.

[12] GI Lancaster ja MA Febbraio, "HSP70 eksosoomidest sõltuv kaubitsemine",Bioloogilise keemia ajakiri, vol. 280, nr. 24, lk 23349–23355, 2005.

[13] GI Lancaster ja MA Febbraio, "Stressist põhjustatud rakulise HSP72 vabanemise mehhanismid: mõju treeningust põhjustatud rakuvälise HSP72 suurenemisele"Harjutus immunoloogiaÜlevaade, vol. 11, lk 46–52, 2005.

[14] JPJJ Hegmans, PJ Gerber ja BN Lambrecht, "Exosomes"Funktsionaalne proteoomika, vol. 484, lk 97–109, Humana Press, New York City, NY, USA, 2008.

[15] R. Zhan, X. Leng, X. Liu jt, "Kuumašoki valk 70 eritub endoteelirakkudest mitteklassikalise raja kaudu, mis hõlmab eksosoome."Biokeemiliste ja biofüüsikaliste uuringute kommunikatsioonid, vol. 387, nr. 2, lk 229–233, 2009.

[16] RL Mehta, JA Kellum, SV Shah jt, "Äge neerukahjustusvõrgustik: aruanne ägeda neerukahjustuse tulemuste parandamise algatusest.Kriitiline Hoolitsemine, vol. 11, nr. 2, lk. R31, 2007.

[17] SP Ramachandra Rao, MA Matthias, C. Kokoy-Mon-dragonet al., "Uriini eksosoomide proteoomiline analüüs näitab neerutuubulite reaktsiooni leptospiraalsele kolonisatsioonile eksperimentaalselt nakatunud rottidel."PLoS tähelepanuta jäetud troopilised haigused, vol. 9, nr. 3, artikkel e0003640, 2015.

[18] HC Christianson, KJ Svensson, TH van Kuppevelt, J.-P. Li ja M. Belting: "Vähirakkude eksosoomid sõltuvad nende sisestamisel rakupinna heparaansulfaadi proteoglükaanidest

ja funktsionaalne tegevus,"Menetlused kohta a Rahvuslik Teaduste Akadeemia, vol. 110, nr. 43, lk 17380–17385, 2013.

[19] A. Ševtšenko, M. Wilm, O. Vorm ja M. Mann, "Valkude massispektromeetriline järjestus hõbedaga värvitud polüakrüülamiidgeelidest"Analüütiline keemia, vol. 68, nr. 5, lk 850–858, 1996.

[20] F. Brambilla, F. Lavatelli, D. Di Silvestre jt, "Inimese rasvkoe Shotgun-valgu profiil ja selle muutused seoses süsteemsete amüloidoosidega".Proteome Researchi ajakiri, vol. 12, nr. 12, lk 5642–5655, 2013.

[21] AC Paoletti, TJ Parmely, C. Tomomori-Sato jt, "Erinevate imetajate vahendajate komplekside kvantitatiivne proteoomiline analüüs, kasutades normaliseeritud spektraalseid arvukuse tegureid"Proceedings of the National Academy of Sciences, vol. 103, nr. 50, lk 18928–18933, 2006.

[22] J. Xia, R. Mandal, IV Sinelnikov, D. Broadhurst ja

DS Wishart, "MetaboAnalyst 2.{1}}Põhjalik server metaboolsete andmete analüüsiks,"Nukleiinhapete uurimine, vol. 40, nr. W1, lk W127–W133, 2012.

[23] J. Xia, N. Psychogios, N. Young ja DS Wishart, "MetaboAnalyst: a web server for metabolomic data analysis and interpretation"Nukleiinhapete uurimine, vol. 37, nr. S2, lk W652–W660, 2009.

[24] SPR Rao, R. Wassell, MA Shaw ja K. Sharma, "Inimese mesangiaalrakkude subproteoomide profileerimine näitab kalmoduliini rolli glükoosi omastamisel."Ameerika ajakirikohtaFüsioloogia-neeru Füsioloogia, vol. 292, nr. 4, lk F1182–F1189, 2007.

[25] SP Ramachandra Rao, Y. Zhu, T. Ravasi jt, "Pirfenidoon on renoprotektiivnediabeetiline neeruhaigus," Journal of the American Society of Nephrology, kd 20, nr 8, lk 1765–1775, 2009.

[26] U. Reiss ja B. Sacktor, "Neerpintsli äärismembraani maltaas: puhastamine ja omadused," Archives of Biochemistry and Biophysics, kd. 209, nr 2, lk 342–348, 1981.

[27] B. Sacktor, Trehalaas ja glükoosi transport imetajatesneerudja soolestikku," Proceedings of the National Academy of Sciences, kd 60, nr 3, lk 1007–1014, 1968.

[28] SJ Berger ja B. Sacktor, "Küülikute pintslipiiride isoleerimine ja biokeemiline iseloomustusneerud," Rakubioloogia ajakiri, vol. 47, nr. 3, lk 637–645, 1970.

[29] D. Kerjaschki, L. Noronha-Blob, B. Sacktor ja

MG Farquhar, "Iseloomuliku glükoproteiini koostise mikrodomeenidneerudproksimaalse tuubuli harja ääris,"Rakubioloogia ajakiri, vol. 98, nr. 4, lk 1505–1513, 1984.

[30] D. Povero, A. Eguchi, H. Li jt, "Spetsiifiliste proteoomide ja maksa mikroRNA-dega tsirkuleerivad ekstratsellulaarsed vesiikulid on potentsiaalsed biomarkerid maksakahjustuse korral eksperimentaalse rasvmaksahaiguse korral."PLoS One, vol. 9, nr. 12, artikli ID e113651, 2014.

[31] R. Hernaez, E. Sola, R. Moreau ja P. Gine, "Äge krooniline maksapuudulikkus: uuendus"Soolestik, vol. 66, nr. 3, lk 541–553, 2017.

[32] T. Pisitkun, R.-F. Shen ja MA Knepper, "Inimese uriini eksosoomide identifitseerimine ja proteoomiline profileerimine"Proceedings of the National Academy of Sciences, vol. 101, nr. 36, lk 13368–13373, 2004.

[33] PA Gonzales, T. Pisitkun, JD Hoffert jt, "Large-scale proteomics and phosphoproteomics of urinary exosomes"Ajakiri kohta a Ameerika Ühiskond kohta Nefroloogia, vol. 20, nr. 2, lk 363–379, 2009.