Vaktsiinist põhjustatud immuunsuse ja selle mõju uurimine SARS-CoV-2 epideemiate leevendamisel Hiinas
Nov 10, 2023
Abstraktne
Taust: COVID{1}}-eelse elustiili juurde naasmiseks on peaaegu iga riik algatanud vaktsineerimisprogrammi, et leevendada tõsist haiguskoormust ja kontrollida levikut. Siiski on näha, kas karja immuunsus on nende programmide käeulatuses.
Meetodid: töötasime välja SARS-CoV-2 leviku kambrimudeli Hiina jaoks, mille populatsiooni eelnev immuunsus loomuliku infektsiooni vastu on madal. Testiti kahte vaktsineerimisprogrammi ja anti mudelipõhised hinnangud elanikkonna immuunsustaseme kohta.
cistanche tubulosa - parandab immuunsüsteemi
Tulemused: Leidsime, et tõenäoliselt ei saavutata Delta variandi puhul karja immuunsust, arvestades Hiinas 2021. aastal kasutatud vaktsiinide suhteliselt madalat efektiivsust ja eelneva loomuliku immuunsuse puudumist. Arvasime, et eeldades, et vaktsiini efektiivsus infektsiooni vastu on 90%, eeldaks vaktsiinist põhjustatud karja immuunsus 93% või rohkem Hiina elanikkonnast. Kuid isegi siis, kui vaktsiinist põhjustatud karja immuunsust ei saavutata, võivad vaktsineerimisprogrammid vähendada SARS-CoV-2 nakkusi 50–62% vaktsiinimudeli puhul, kui kasutatakse kõik või mitte midagi ja algab epideemia. avatakse 1. detsembril 2021.
Järeldused: Tuleb teha jõupingutusi, et suurendada elanikkonna kindlustunnet ja valmisolekut end vaktsineerida ning töötada välja väga tõhusad vaktsiinid laiale vanusevahemikule.
cistanche tubulosa - parandab immuunsüsteemi
Märksõnad: COVID-19, karja immuunsus, vaktsineerimisprogramm, Delta variant, SLIR-mudel
Taust
Uue koroonaviirushaiguse 2{{50}19 (COVID-19) esimene laine Hiinas vaibus kiiresti pärast rangete ohjeldusmeetmete ja reisipiirangute rakendamist alates 2. märtsist0 20 [1–4]. 12. novembri 2021 seisuga on COVID{7}} pandeemia põhjustanud üle 251 miljoni teatatud juhtumi ja 5 miljoni surmajuhtumi üle maailma [5]. Pandeemia pole veel kaugeltki lõppenud, sest raske ägeda respiratoorse sündroomi koroonaviirus 2 (SARS-CoV{13}}) on läbi teinud mõned olulised mutatsioonid ja mitmed variandid on muutunud laialt levinud tänu suurenenud ülekanduvusele ja/või immuunsüsteemi põgenemisomadustele, nt variandid Alpha [6–12], Beeta [13, 14], Gamma [13, 15] ja Delta [16–18]. Kogu maailmas viitab Delta variantide juhtumite kiire kasv selgele konkurentsieelisele võrreldes alfa, beeta ja gammaga [16]; Alates 2021. aasta juulist on enam kui 90% ülemaailmsete gripiandmete jagamise (GISAID) algatuste igapäevastest järjestustest omistatavad Delta variandile [19]. Vaatamata suurematele epideemiatele on Hiinas esinenud mitmeid väiksemaid kohalikke puhanguid, mille on põhjustanud Delta variandi imporditud juhtumid, sealhulgas puhangud Guangzhous, Nanjingis ja Zhengzhou linnas [20–22]. Nakkuse leviku tõkestamiseks peab suurel osal maailmast olema immuunsus SARS-CoV-2, eriti Delta variandi suhtes. Tõhusad vaktsiinid COVID{30}} vastu on kõige elujõulisem võimalus SARS-CoV-2 leviku tõkestamiseks kogu maailmas. Vaktsineerimisprogrammide tõhusus sõltub mitmest võtmetegurist, sealhulgas vaktsiinide pakkumisest, valmisolekust vaktsiini saada, vaktsiini efektiivsusest ja vanuserühmadest, kellele vaktsineerimine on suunatud. Kuid praegused vaktsineerimisprogrammid põhinevad kõik SARS-CoV-2 algse liini vastu välja töötatud vaktsiinidel ja tõhusus Delta variandi vastu näib olevat vähenenud [23]. Hiinas, kus elab umbes 1,4 miljardit inimest (~18% maailma elanikkonnast), on 12. novembri 2021 seisuga manustatud 2,37 miljardit annust [24]; 76,5% kogu elanikkonnast on vaktsineeritud kahe doosiga, mis vastab 82,4% sihtpopulatsioonist (st 3-aastased ja vanemad isikud). Siiski tuleb veel näha, kas vaktsiiniga hõlmatus võib ulatuda piisava tasemeni, et saavutada karja immuunsus. Sama küsimuse ees seisavad riigid üle maailma. Klassikaline karja immuunsustase on määratletud kui 1-1/R0, kus R0 on põhiline paljunemisarv – keskmine nakatumiste arv, mille on tekitanud tüüpiline nakkav isend täielikult vastuvõtlikus populatsioonis [25]. Tõhusa VE vaktsiini puhul, mis annab eluaegse kaitse, on ülekande peatamiseks vajalik karja immuunsuse tase (1-1/R0)/VE. See hinnang on aga keeruka nähtuse liialt lihtsustamine, kuna see eirab tegeliku inimpopulatsiooni heterogeensust (nt sotsiaalsed segunemismustrid, vanusespetsiifiline vastuvõtlikkus infektsioonidele) [25, 26] ja ka vaktsineerimise (nt eluaegne immuunsus , steriliseeriv vaktsiin). Selle piirangu ületamiseks integreerime siia Hiina elanikkonna spetsiifilise kontaktiuuringu [27] ja ametliku demograafilise statistika, et töötada välja vanusepõhiselt struktureeritud stohhastiline mudel SARS-CoV-2 ülekandumise simuleerimiseks (lisafail 1: joonis S1). Seejärel kasutame seda mudelit, et hinnata, kas karja immuunsus on saavutatav Delta variandi vastu või mitte massilise vaktsineerimisega.
cistanche tubulosa - parandab immuunsüsteemi
Cistanche Enhance Immunity toodete vaatamiseks klõpsake siin
【Küsi lisa】 E-post:cindy.xue@wecistanche.com / Whats App: 0086 18599088692 / Wechat: 18599088692
meetodid
SARS-CoV-2 leviku ja vaktsineerimise mudel
Koostasime SARS-CoV-2 ülekandumise ja vaktsineerimise kambrimudeli, mis põhineb vanusestruktuuriga stohhastilise vastuvõtliku-latentse-nakkus-eemaldatud (SLIR) skeemil, võttes arvesse heterogeenseid kokkupuutemustreid vanuse järgi [27] ja heterogeenset vastuvõtlikkust. nakkusele vanuse järgi, nagu on hinnatud kontaktide jälgimise andmete põhjal Hiinas Hunani provintsis [28]. Mudelis on populatsioon jagatud nelja epidemioloogilisse kategooriasse: vastuvõtlik, varjatud, nakkav ja eemaldatud, kihistunud 16 vanuserühma järgi. Vastuvõtlikud isikud võivad nakatuda pärast kokkupuudet nakkusohtliku isikuga vastavalt vanusele iseloomulikule nakkusjõule. Kontaktide tekkimise kiiruse määravad iga vanuserühma segunemismustrid. Varjatud perioodiks ja keskmiseks genereerimisajaks määrati vastavalt 4,4 [28–30] ja 7 [31] päeva. Vastavalt SARS-CoV-2 Delta variandi hinnangutele [1–4, 6–12, 16–18] arvestame põhisigimisarvuks (R0) 6.0 . Simulatsioone alustatakse 40 nakkusohtliku isikuga [32], mis vastab esmalt Pekingis 11. juunil 2020 kohaliku haiguspuhangu käigus avastatud juhtude arvule. Leiame, et 2-annuseline vaktsiin on vaktsineerimiseks sobilik ainult vastuvõtlikud isikud ( tuletame meelde, et loomulik immuunsus on Hiinas 2021. aasta novembri seisuga nullilähedane [33]) ja et vaktsiinist põhjustatud immuunsuse kestus kestab kauem kui selles uuringus käsitletud ajahorisont (st 1 aasta). Üksikasjad mudeli ja parameetrite kohta on esitatud lisafailis 1: Sec. 1 ja Tab. S1.
Algstsenaarium
Põhistsenaariumina võtsime arvesse järgmisi eeldusi.
i) Epideemiline külvamine: epideemia käivitas 1. detsembril 2021 eeldatavasti 40 SARS-CoV-2 nakkusohtlikku isikut [32].
ii) Vaktsineerimisstrateegia: vaktsiine on Hiinas kasutusele võetud alates 30. novembrist 2020 [24], mis on varaseim valitsuse teatatud kuupäev, ning neid on alates novembri algusest laiendatud 3+-aastastele isikutele. katsetas kahte erinevat vaktsineerimisstrateegiat:
a) 1. strateegia – vaktsiinide juhuslik jagamine isikutele vanuses 12+ aastat, seejärel laiendatakse seda alates 1. novembrist 2021 isikutele vanuses 3+ aastat;
b) 2. strateegia – vaktsiinide juhuslik jagamine isikutele, kelle vanus on 3+ aastat pärast vaktsineerimisprogrammi algust, nimelt 30. novembril 2020.
Arvasime, et murdosa elanikkonnast (umbes 2% — lisafail 1: tabel S2) ei ole vaktsiini saamiseks sobilikud, kuna alates 2021. aasta novembrist on Hiinas vaktsineerimiskampaaniast välja jäetud rasedad naised ning allergiliste või muude haigusseisunditega isikud. [34–40] (üksikasju vt lisafail 1: ptk 2).
iii) Vaktsiini mahutavus: kasutasime Hiinas kuni 2. novembrini 2021 manustatud päevaste annuste ajaloolisi andmeid (lisafail 1: joonis S2), seejärel prognoosisime tulevase päevase võimsuse 2. oktoobrist kuni 2. oktoobrini manustatud päevaste annuste põhjal. 2. november 2021 [24]. Seega hindasime alates 3. novembrist 2021 ja pärast seda Hiina elanikkonna jaoks 2,30 miljonit ööpäevast vaktsiiniannust (üksikasjad on esitatud lisafailis 1: jaotis 3).
iv) Vaktsiini efektiivsus: vaktsiini skeem nõuab kahte annust {{0}}-päevase intervalliga. 18–59-aastaste inimeste nakkusvastane VE saavutab maksimumväärtuse 14 päeva pärast 2 annuse vaktsineerimist ja Delta variandi puhul on see hinnanguliselt 54,3% [41–43]. See hinnang põhineb efektiivsusel, mida mõõdetakse esialgsete põlvkondade suhtes ja neutraliseerivate antikehade arvu vähenemisel, mida Delta variandi puhul kliinilistes uuringutes hinnati (üksikasju vt lisafail 1: Tab. S1). Suhteline VE infektsiooni vastu 0–13 päeva jooksul pärast teist annust võrreldes maksimaalse kaitsega on Delta variandi puhul 83,8% [44]. 18–59-aastaste inimeste surmavastane VE on Delta variandi puhul 93% [45–47]. Uurisime kõrgemaid VE väärtusi infektsiooni vastu [48] ja testisime tundlikkuse analüüsina kaheannuselist skeemi 14-päevase intervalliga (lisafail 1: tabel S1). Lisaks ei pruugi COVID-19 vaktsiinid olla nakatumise ärahoidmisel vanuserühmades võrdselt tõhusad. Selle eelduse mõju mõistmiseks testisime ka suhtelist VE-d 50% ja 75% 3–17-aastaste ja 60+-aastaste inimeste puhul, võrreldes VE-ga 18–59-aastastel inimestel.
v) Vaktsiini toime: vaktsiini efektiivsuse modelleerimiseks kaalusime kahte mehhanismi: "kõik või mitte midagi" vaktsiin (alganalüüs), mille puhul vaktsiin pakub täielikku kaitset osale VE vaktsineeritud isikutest ja mitte mingit kaitset ülejäänud isikutele. 1-VE vaktsineeritud isikud. Teine võimalus, mida kaalusime, on "lekkiv" vaktsiin, mille puhul kõigil vaktsineeritud isikutel on teatav kaitsetase VE-le vastava infektsiooni eest [49].
vi) Esialgne immuunsus: 2021. aasta novembri seisuga puudub Hiinas praktiliselt igasugune immuunsus looduslike nakkuste vastu [33]. Tulemuste üldistavuse huvides teistele laialt levinud levikuga riikidele uurisime stsenaariumi, kus 30% elanikkonnast on algselt nakkuse suhtes immuunsed ja immuunsete indiviidide osakaal vanuserühmade lõikes on võrdeline populatsiooni suurusega.
vii) Vastuvõtlikkus infektsioonidele vanuse järgi: alla 15-aastastel lastel on hinnanguliselt väiksem vastuvõtlikkus SARS-CoV-2 infektsioonile kui täiskasvanutel (st isikud vanuses 15–64 aastat), samas kui isikutel vanuses { {5}} aastat on kõige vastuvõtlikumad infektsioonidele [28].
viii) Immuunsuse kestus: laseme ülekandemudelil töötada 1 aasta, eeldades eluaegset kaitset loodusliku nakkuse või vaktsineerimise eest.
ix) Haiguskoormus: esialgsete põlvkondade nakatumise suremuse suhtarv avaldub 0–19-aastastel isikutel {{0}},0923% -ni, üle 80-aastaste inimeste puhul tõuseb see 6,7959% -ni [50, 51]. Delta variandiga seotud surmarisk võrreldes algse liiniga on 2,37 [52].
Samuti viiakse läbi põhjalikud tundlikkusanalüüsid, et hinnata lähteeelduste mõju meie tulemustele (lisafail 1: tabel S1).
cistanche tubulosa - parandab immuunsüsteemi
Alternatiivsed vaktsineerimise stsenaariumid
Testisime kolme alternatiivset stsenaariumi, et uurida vaktsineerimisest põhjustatud karjaimmuunsuse potentsiaali, kus (i) epideemia algus lükkub edasi 1. detsembrist 2021 kuni 1. jaanuarini 2022 ja 1. veebruarini 2022 ; ii) sigimisnumbri väärtus täielikult vastuvõtlikus populatsioonis ja teatud mittefarmatseutiliste sekkumiste (NPI-de) tasemel, mida tähistatakse kui RNPI-d 0, varieerub vahemikus 1,1–6; iii) I ja ii stsenaariumi kombinatsioonid. Stsenaariumi (ii) puhul ei modelleerinud me selgesõnaliselt üksikuid mittetulundusühinguid, nagu juhtumi isoleerimine, kontaktide jälgimine, maskide kandmine, sotsiaalne distantseerumine ja parem hügieen. Selle asemel peeti nende meetmete sünergilist mõju sigimise arvu vähenemiseks.
Andmete analüüs
Iga stsenaariumi jaoks viidi läbi 100 stohhastilist simulatsiooni ning seejärel hinnati keskmine ja 95% usaldusvahemik (95% CI).
Efektiivse paljunemisarvu Re hindamiseks kasutasime järgmise põlvkonna maatriksi (NGM) [53] meetodit. Karja immuunsust peetakse saavutatavaks, kui Re<1. Details are reported in Additional file 1: Sec. 4 and 5.
Tulemused
Algstsenaarium
Simuleerides edasi 1 aastat kestnud epideemiat ja eeldades, et vaktsiini suhtes kõhklemist ei esine, viiks vaktsineerimise jätkamine lõpliku katvuseni 90,7% sihtpopulatsioonist, mis vastab 88,6% strateegia 1 kogupopulatsioonist (joonis 1a). Strateegia 2 puhul on hinnanguline kogurahvastiku katvus 88,7% (joonis 1b). Ühegi stsenaariumi korral ei ulatu keskmine päevane esinemissagedus kunagi 250-ni üle 10,{13}} elaniku (joonis 1c, d). Arvasime, et efektiivne paljunemisarv nakkuse külvamise ajal (Re) on ikka veel tunduvalt kõrgem epideemia künnisest, nimelt 4,03 (95% CI 3,19–4,70) ja 3,18 (95% CI 3,15–3,24) strateegia 1 ja 2 puhul. , vastavalt (joonis 1e, f). Need hinnangud viitavad sellele, et vaktsineerimisstrateegiast olenemata ei piisa 1. detsembril 2021 vaktsiiniga hõlmatusest edasikandumise vältimiseks. Arvatakse, et ta ületab epideemia künnise (st 1) vastavalt 31. jaanuaril ja 5. veebruaril 2022 strateegia 1 ja 2 puhul immuunsete isikute kuhjumise tõttu nii jätkuvate vaktsineerimispüüdluste kui ka looduslike infektsioonide tõttu (joonis 1g, h). Infektsioonihoogude hinnanguline sagedus (mis hõlmab kõiki SARS-CoV-2 nakkusi, sõltumata sellest, kas isikul tekivad sümptomid või mitte) on 45,2% (95% CI 37,2–48,5%) ja 45,7% (95% CI 40,6–40,6). 48,8%) strateegiate 1 ja 2 puhul (joon. 1g, h). Pange tähele, et vaktsiini suhtes immuunsete isikute osakaal peatub suurenemas, samal ajal kui looduslikult immuunsete isikute osakaal kasvab endiselt. Tegelikult, kui kõik isikud on kas vaktsineeritud või nakatunud, lakkab vaktsiinimmuunsete isikute osakaal kasvamast. Kuid sellises olukorras võivad kaitsmata/osaliselt kaitstud vaktsineeritud isikud siiski nakatuda, mis toob kaasa looduslikult immuunsete isikute osakaalu suurenemise.
Joonis 1 Vaktsiiniga hõlmatuse, päevase esinemissageduse, efektiivse sigivuse ja immuunsete isikute osakaalu aegrida. 1. strateegia vanusespetsiifiline vaktsiiniga hõlmatus aja jooksul. Punktiirjooned vastavad epideemia algusele. Lisatud tabelis on näidatud vanusepõhine katvus kahel peamisel ajahetkel (epideemia algus (st 1. detsember 2021) ja aeg, mil katvus püsib konstantsena (st 11. märts)). Joon vastab keskmisele väärtusele, samas kui varjutatud ala tähistab 95% CI. b Nagu a, kuid strateegia 2 jaoks. c Igapäevane esinemissagedus 10,{10}} 1. strateegia puhul (keskmine ja 95% CI). d Nagu c, kuid strateegia 2 jaoks. e Efektiivne paljunemisarv Re aja jooksul (keskmine ja 95% CI) 1. strateegia puhul. Halliga varjutatud ala näitab epideemia künnist Re =1. Varjutatud ala ümber olevad numbrid näitavad, millal Re ületab selle läve (st 31. jaanuar) strateegia 1 puhul. f Nagu e, kuid strateegia 2 puhul. g Immuunsete isikute osatähtsus loodusliku infektsiooni või vaktsineerimise tõttu aja jooksul strateegias 1. h Nagu g, kuid strateegia 2 jaoks
Kuigi vaktsiinist põhjustatud immuunsus ei ole viiruse leviku tõkestamiseks piisav, on kõik vaadeldud stsenaariumid seotud COVID{1}} koormuse olulise leevendamisega. Meie hinnangul väheneb kahe vaktsineerimisstrateegia nakkusrünnakute määr enam kui 50% võrreldes võrdlusstsenaariumiga ilma sekkumiseta (joonis 2a, b). Mõlemad strateegiad vähendavad surmajuhtumite arvu enam kui 90% (joonis 2c, d). Need tulemused põhinesid "kõik või mitte midagi" vaktsiini eeldusel. Et testida meie leidude kindlust sellele eeldusele, testisime "lekkivat" vaktsiini. Sel juhul hindasime infektsioonirünnakute määra madalamaks (12% võrreldes ligikaudu 50%); siiski hindasime sarnast surmade arvu vähenemist (umbes 85% võrreldes ligikaudu 90%), joonised 2e–h. Saadud tulemused näitavad, et karja immuunsust ei ole võimalik saavutada 1. detsembriks 2021, olenemata vastuvõetud vaktsineerimisstrateegiast, kui R0 on seatud väärtusele 5 või 7 (lisafail 1: joonis S3), kui algset seemnete arvu muudetakse vahemikus 10 kuni 100 (lisafail 1: joonis S4) ja kui eeldatakse, et vanuse järgi on võrdne vastuvõtlikkus nakkusele (lisafail 1: joonis S5). Sama järelduse saame, kui kaalusime 3 vanuserühmaga tagasihoidlikumat mudelit (lisafail 1: joonis S6). Lõpuks viisime läbi ka kontrafaktuaalse analüüsi, kus eeldame, et osa elanikkonnast oli immuunsed juba enne vaktsineerimiskampaania algust (sarnaselt lääneriikide olukorrale). Selle eelduse kohaselt leidsime, et 30% esialgne immuunsuse osakaal ei põhjustaks Re'i epideemialäve allapoole jäämist kahe strateegia puhul enne 1. detsembrit 2021 (lisafail 1: joonis S7). Vaktsineerimisprotsessi reguleerivate parameetrite osas leidsime, et kõige suurem mõju on vaktsiini efektiivsusel 14 päeva pärast teist annust, millele järgneb 3–17-aastaste isikute vaktsiini efektiivsus ja 60+ võrreldes 18–59-aastaste inimestega. aastat (lisafail 1: joon. S8 ja S9). Teisest küljest on vaktsiini suhtelisel efektiivsusel 0–13 päeva jooksul pärast teist annust ning esimese ja teise annuse vahelisel ajavahemikul mõõdukam mõju analüüsitud vaktsineerimisstrateegiate üldisele efektiivsusele (lisafail 1: joonis S10 ja S11).
Joonis 2 COVID-i haiguskoormus-19 põhistsenaariumis. Nakatuste kumulatiivne arv 1{{10}},000 isiku kohta pärast 1 simuleeritud aastat võrdlusstsenaariumi ja kahe vaktsineerimisstrateegiaga, kasutades "kõik või mitte midagi" vaktsiinimudelit (keskmine ja 95% CI). b Infektsioonide vähenemine (keskmine ja 95% usaldusvahemik) võrreldes võrdlusstsenaariumiga erinevates vanuserühmades ja kogu elanikkonnas. Vähenemise 95% CI võib ületada nulli, kuna võrdlusstsenaariumi ja vaktsineerimise stsenaariumi vaheline koormus on mõnes simulatsioonis ligikaudu sama. Seega kärpisime kogu käsikirjas 95% CI alumist piiri 0-ks. c, d nagu a, b, aga surma puhul. e–h nagu a–d puhul, aga "lekkiva" vaktsiinimudeli puhul
1. stsenaarium: epideemia alguse edasilükkamine
Seni esitatud järeldused viitavad sellele, et karja immuunsust Delta variandi vastu ei saa luua vaktsineerimisega 1. detsembriks 2021. Järgmiseks testisime, mil määral tuleb uue epideemialaine algust edasi lükata (nt järgides rangeid piiranguid rahvusvahelised reisid), et võimaldada populatsioonis immuunsuse kujunemist, mis võib jõuda karja immuunsuse tasemeni. Vastavalt baasstsenaariumis kasutatud igapäevasele vaktsineerimisvõimsusele (põhineb igapäevase vaktsineerimisvõimsuse andmete ajalool kuni 2. novembrini 2021) hindasime, et Re jääb mõlema kahe strateegia puhul epideemiakünnisest kõrgemale isegi siis, kui epideemia külvamine on lükatakse edasi 1. veebruarini 2022 (joonis 3a), samas kui nakkuste vähenemine suureneb strateegiate 1–2 puhul vastavalt 56,8% ja 57,4%. Oluline on rõhutada, et meie Re hinnangute ebakindluse allikaks on saapa rihmaga kontaktmaatriks vanuse järgi ja nakkustundlikkuse tagumine jaotus vanuse järgi. See selgitab, miks 1. strateegia Re hinnanguline usaldusvahemik on laiem kui 2. strateegia puhul (mis on joonisel 3a väiksem kui punkti suurus). Tegelikult on 2. strateegia puhul vaktsineerimine vanuse järgi põhimõtteliselt ühtlane ja seega on vanusest sõltuvate parameetrite ebakindlus tühine. Vastupidi, strateegia 1 puhul vaktsineeritakse noori elanikkonda hilisemas etapis, mis tähendab, et vanusest sõltuvate parameetrite ebakindlus peegeldab suuremat ebakindlust Re suhtes. Samuti teatasime epideemia alguse edasilükkamise mõjust vaktsiiniga hõlmatusele ja igapäevasele esinemissagedusele lisafailis 1: joonis S12.
Joonis 3 Epideemia alguse edasilükkamise ja mittetulundusühingute kasutuselevõtu mõju. Efektiivne paljunemisarv Re (keskmine ja 95% CI) vaktsiiniga hõlmatuse funktsioonina nakkuse külvamise ajal. Värvid viitavad epideemia alguse edasilükkamise stsenaariumile teisele kuupäevale. Halliga varjutatud ala näitab Re Less kui 1 või sellega võrdne. b Nakkuste kumulatiivne arv 10,000 inimese kohta pärast 1 simuleeritud aastat võrdlusstsenaariumi ja kahe vaktsineerimisstrateegia jaoks (keskmine ja 95% CI). c Infektsioonide vähenemine (keskmine ja 95% CI) võrreldes võrdlusstsenaariumiga. d Nagu a, kuid netoreproduktsiooninumbri Rt (keskmine ja 95% CI) puhul, võttes kasutusele erineva intensiivsusega mittetulundusühingud. e Nagu b, kuid erineva intensiivsusega mittetulunduslike institutsioonide kasutuselevõtu stsenaariumi jaoks. f Nagu c, kuid erineva intensiivsusega mittetulunduslike institutsioonide kasutuselevõtu stsenaariumi jaoks
2. stsenaarium: mittetulundusühingute kasutuselevõtt uue haiguspuhangu korral
Seni esitatud tulemused viitavad sellele, et karja immuunsus Delta variandi vastu ei ole ühelgi ajahetkel saavutatav. Epideemiapuhangule reageerimiseks mittetulundusühingute kasutuselevõtt võib vähendada viiruse leviku potentsiaali. Seega tasub uurida vaktsineerimisprogrammide sünergilist mõju koos erineva intensiivsusega NPI-dega. Oluline on märkida, et me ei modelleeri selgelt iga üksikut meedet, et piirata levikut (nt juhtumi isoleerimine, kontaktide jälgimine, maskide kandmine, sotsiaalne distantseerumine, parem hügieen). Need meetmed on vaikimisi kooskõlastatud strateegiatena, mille tulemuseks on sigimise arvu vähenemine. Uurisime RNPI-sid {{0}} vahemikus 1,1–6.0, mis vastavad sekkumiste erinevatele intensiivsustele. Väärtused vahemikus 1 kuni 2 on näidatud põhitekstis, suuremad väärtused aga lisafailis 1: Joon. S13. Samuti teatasime uue haiguspuhangu korral mittetulundusühingute kasutuselevõtu mõjust igapäevasele esinemissagedusele lisafailis 1: joonis S14. Keskmist netoreproduktsiooninumbrit (määratletud kui paljunemisnumbrit, mis arvestab nii immuunsust kui ka sekkumisi) 1., 2. detsembril 021 saab strateegia 1 puhul vähendada alla 1 ainult siis, kui RNPI-d 0 Väiksem kui või võrdne 1,5-ga, samas kui strateegia 2 puhul võivad RNPI-d 0 olla kuni 1,8 (joonis 3d). Edaspidi vaktsineerides ja simuleerides 1-aastast epideemiat, saab tänu vaktsineerimise ja NPI-de sünergilisele mõjule vähendada olulisi nakkusi (ligi 100%) (joonis 3e, f). Pange tähele, et nakkuste vähenemine on ilmselgelt väiksem kui 100% RNPI-de puhul 0 Vähem kui 1,3 või sellega võrdne, kuna kumulatiivsete nakkuste arv on võrdlusstsenaariumis äärmiselt madal.
3. stsenaarium: epideemia alguse edasilükkamine ja mittetulundusühingute kasutuselevõtt
Vaktsineerimisest põhjustatud karja immuunsuse potentsiaali edasiseks parandamiseks ja COVID{1}} koormuse vähendamiseks katsetasime siin kahe ülalmainitud stsenaariumi kombinatsiooni: epideemia alguse edasilükkamine ja vastusena erineva intensiivsusega mittetulundusainete kasutuselevõtt. uuele puhangule. Kui epideemia peaks algama 2. 021.–2. veebruar022, võivad strateegiad 1 ja 2 olla edukad leviku blokeerimisel ainult siis, kui võetakse kasutusele mõõdukad NPI-d (RNPI-d 0 vahemikus 1,5–2,0) (joonis fig. . 4). Infektsioonide vähenemise tulemused kahe strateegia võrdlusstsenaariumiga võrreldes on näidatud lisafailis 1: joonis S15. Vanusele suunatud vaktsineerimisstrateegiate tõhusus sõltub elanikkonna vanuselise segunemise mustritest [54]. Meie leidude kindluse testimiseks katsetasime Hiina jaoks alternatiivset kontaktmaatriksit [55] ja leidsime järjekindlad tulemused (lisafail 1: joonis S16 ja S17).
Karja immuunsuslävi
Siiani ei ole karja immuunsus ühegi vaktsineerimisstrateegia jaoks saavutatav, arvestades analüüsitud vaktsiini suhteliselt madalat efektiivsust (54,3%) Delta nakkuse ärahoidmisel. Seega uurisime karja immuunsuse potentsiaali kahe vaktsineerimisstrateegia puhul, mille efektiivsus oli suurem (95%) (lisafail 1: joonis S18). Arvasime, et Re võib kahe strateegia puhul langeda alla 1.{6}} (lisafail 1: joonis S18a). Nende kahe strateegia kohaselt on karjade hinnangulised immuunsusläved vastavalt 91,3% ja 84,5%, mis viitab sellele, et efektiivse sigimise arvu viimiseks alla epideemialäve vajalik immuunsustase on madalam, kui vaktsineerimist laiendatakse 3+-aastastele isikutele. varakult. Samuti hindasime nakkuse rünnakute määra erinevate vaktsineerimiskatete korral eeldusel, et vaktsineerimine peatub epideemia alguse ajal. See puhthüpoteetiline stsenaarium näitab, et kui prioriteediks on 12+ aastased isikud (1. strateegia), vaatamata suhteliselt kõrgele hinnangulisele paljunemisarvule, kui vaktsiiniga hõlmatus on 80% (3,2), on hinnanguline nakatumissagedus suhteliselt madal (10,0%) (lisafail 1: joon. S18b). Arvestades vanusepõhist vaktsineerimisprogrammi ja loomuliku immuunsuse puudumist, on vastuvõtlik populatsioon koondunud enamasti noortesse. Nooremate vanuserühmade suur kontaktide arv koos ülejäänud elanikkonna kõrge vaktsineerimisega toob kaasa üsna kõrge sigimise arvu, kuid samal ajal on nakkused keskendunud vaid väikesele elanikkonnarühmale ( noored isikud) ja seega jääb üldine nakkusrünnakute määr üsna madalaks. Samuti uurisime, kas karja immuunsus on saavutatav või mitte ja milline on karja immuunsuse lävi, hinnates Re-d eeldusel, et kõik isikud on vaktsineerimiskõlblikud ja on vaktsineerinud 2 annust enne epideemia algust. Arvasime vaktsiini efektiivsust vahemikus 60–100% ja uurisime vaktsineerimise ulatuse erinevaid stsenaariume. Meie tulemused näitavad, et vaktsiini puhul, mille efektiivsus on alla 85%, on karja immuunsus saavutamatu isegi äärmuslikel juhtudel, kui vaktsiiniga hõlmatus on 100% (joonis 5). Vaktsiinist põhjustatud karjaimmuunsus võib olla saavutatav ainult kõrgema VE ja katvuse korral. Näiteks vaktsiini puhul, mille tõhusus on Delta variandi nakkuse vastu 90%, oleks karja immuunsuse saavutamiseks vaja vaktsineerida rohkem kui 93% elanikkonnast (joonis 5). NPI-de olemasolul võib netoreproduktsiooni arvu vähendada vaktsiini efektiivsuse ja katvuse madalamate väärtuste ühikust allapoole (lisafail 1: joonis S19).
Joonis 4 Epideemia alguse edasilükkamise ja mittetulundusühingute kasutuselevõtu mõju netoreproduktiivarvule. a Netoreproduktsiooniarv Rt funktsioonina RNPI-dest 0 ja strateegia 1 epideemia alguskuupäevast. Must paks joon näitab Rt =1. b Nagu a, kuid strateegia 2 jaoks
Arutelu
Meie uuringus hinnati SARS-CoV-2 Delta variandi vastu karja immuunsuse saavutamise teostatavust vaktsineerimise teel, võttes arvesse populatsiooni vanuselise struktuuri heterogeensust, vanusespetsiifilisi kokkupuutemustreid, vaktsiini efektiivsust ja SARS-CoV bioloogilisi omadusi.{4 }}, sealhulgas põhiline paljunemisnumber, vastuvõtlikkus nakkusele vanuse järgi ja sündmuseni kuluvad olulised perioodid (nt latentne periood, generatsiooniaeg). Meie leiud näitavad, et tõenäoliselt ei saavutata karja immuunsust Delta variandi vastu, arvestades praeguste vaktsiinide suhteliselt madalat efektiivsust (mis on välja töötatud algse SARS-CoV-2 liini vastu), ka eelneva loomuliku immuunsuse olemasolul kuni 30%. Isegi kui arvestada suurema efektiivsusega vaktsiine, näitavad meie tulemused, et vaktsineerimisprogrammi niipea laiendamine väikelastele mängib võtmerolli karja immuunsuse saavutamise potentsiaali suurendamisel ja nakkusrünnakute arvu vähendamisel. Kui arvestada 90%-list kaitset Delta variandi vastu (mis ületab praeguste vaktsiinide oma), eeldaks karja immuunsus 93% kogu populatsioonist vaktsineerimist. Mittetulundusvahendite kasutuselevõtt võib takistada suure epideemialaine levikut ka siis, kui karja immuunsustaset ei saavutata, kuid sellise võimalusega kaasnevad ilmselgelt sotsiaalsed ja majanduslikud kulud. Lisaks leevendaksid mõlemad selles uuringus käsitletud strateegiad valdavat enamikku nakkustest. Meie uuringus uuriti, kas ja millal on Hiinas võimalik saavutada vaktsineerimisest põhjustatud karja immuunsus. Hüpoteesil, et tsirkuleeriv tüvi on Delta variandiga sama ülekantav ja vaktsineerimiskampaania ei aeglustu vaktsiini kõhkluse tõttu, jääb karja immuunsus kättesaamatuks ka äärmisel juhul, kui vaktsiiniga hõlmatus on 100%. Sellegipoolest on oluline märkida, et vaktsineerimisprogrammi tõhusust mõjutavad nii elanikkonnas kogunenud loomulik immuunsus (2021. aasta novembri seisuga on Hiinas nullilähedane) kui ka rahvastiku vanuseline struktuur. Tegelikult võib kõrgema loomuliku immuunsuse taseme ja väiksema laste osakaaluga populatsioonides karja immuunsus olla saavutatav.
Meie leiud osutasid mittetulundusühingute ja/või ettevaatusabinõude võtmise tähtsusele, kuni saavutatakse karja immuunsus või epideemiakoorem muutub juhitavaks. Need meetmed võivad aidata nakkuse levikut edasi lükata (nt ranged piirikontrollimeetmed) või kui epideemia peaks arenema, leevendada selle koormust (nt sotsiaalne distantseerumine, kontaktide jälgimine, testimine, maskide kandmine, hügieenitavad, kontaktide piiramine) . Siiski on endiselt küsimusi selle kohta, milliseid mittetulundusühinguid tuleb rakendada, nende intensiivsust ja ajastust. Nende küsimuste lahendamiseks on vaja tulevasi uuringuid.
cistanche tubulosa - parandab immuunsüsteemi
Vaktsineerimiskampaania edukuse määramisel mängib võtmerolli valmisolek elanikkonda vaktsineerida. Varasemate COVID{{0}} vaktsiini kõhkluste uuringute kohaselt oli vaktsiinide aktsepteerimine Hiinas hinnanguliselt 60,4–91,3% 18-aastaste ja vanemate elanikkonna seas [56–59] ja võib-olla isegi madalam. vanemad täiskasvanud [59]. Sarnased hinnangud saadi mitme teise riigi kohta, sealhulgas Ühendkuningriigis (71,5%) [60] ja USAs (75,4%) [60]. Arvestades seda vaktsiini kõhkluse taset, võib kõrge katvuse saavutamine jääda tabamatuks eesmärgiks. Jõupingutused elanikkonna enesekindluse ja vaktsineerimisvalmiduse suurendamiseks on seega ülimalt olulised, et võimaldada naasta COVID{16}}-eelse elustiili juurde. Meie uuring näitab, et ülekantavama Delta variandi levik on oluliselt tõstnud karja immuunsusläve tasemeni, mis ei pruugi olla võimalik üheski populatsioonis, nii et leevendusstrateegiad muutuvad veelgi asjakohasemaks. Varasemates uuringutes on hinnatud karja immuunsusläve kas loomuliku nakkuse või vaktsineerimise kaudu, eeldades, et populatsioon on homogeenselt segunenud [61–63], kuid kontaktstruktuuri heterogeensus, populatsiooni vanuseline struktuur, vastuvõtlikkus nakkustele vanuse järgi ja järjestus vaktsineeritud isikud on kõik karja immuunsuse taset kujundavad võtmetegurid [25]. Et uurida mudelis sisalduvate heterogeensuste mõju saadud tulemustele, katsetasime alternatiivset mudelit, mis põhines täielikult homogeensel populatsioonil, jättes seega tähelepanuta kontaktstruktuuri, populatsiooni vanuselise struktuuri, vastuvõtlikkuse nakkustele vanuse järgi ja järjestuse vaktsineeritakse isikuid, mis on põhianalüüsis arvesse võetud (lisafail 1: joonis S20). Arvestades R0=6.0 ja vaktsiini efektiivsust nakkuse vastu=95%, hindasime teoreetilise karja immuunsusläve (st ei arvestanud immuunsuse vähenemist ja uue variandi tekkimist koos immuunsuse põgenemisega) 87,7% homogeense mudeli puhul, võrreldes 91,3% ja 84,5% vaktsineerimisstrateegiate 1 ja 2 heterogeense mudeli puhul. Meie väljatöötatud mudel põhineb Shanghai elanikkonna hinnangulistel sotsiaalsetel segunemismudelitel [27] ja Hiina spetsiifilistel andmetel COVID{35}} epidemioloogia (rahvastiku immuunsus jne) kohta. Sellegipoolest on kasutusele võetud modelleerimisraamistik paindlik ja seda saab kohandada teiste riikide jaoks. Testisime stsenaariumi, mis sarnanes kuidagi USA olukorraga, kus kaalusime loomulikku immuunsust [64] ja vaktsiini BNT162b2/Pfizer kasutuselevõttu, mille efektiivsus Delta variandi vastu oli hinnanguliselt 79% [48]. Samuti arvasime selle stsenaariumi korral, et karja immuunsust ei pruugita saavutada (lisafail 1: joonis S21). Veelgi enam, vaktsineerimise kõhklus võib ohustada vaktsineerimispüüdlusi USA-s ja teistes lääneriikides.
Selles uuringus on modelleerimisharjutustega seotud piirangud. Esiteks tuletati epidemioloogiliste vaatluste põhjal otse mõõtmise asemel Delta variandi infektsioonide vastane VE. Lisaks ei ole Hiinas kasutatavate vaktsiinide puhul hinnatud laste VE-d; seetõttu oleme immunogeensusuuringute põhjal eeldanud sama VE-d nagu täiskasvanutel [65]. Arvestades välitõendite puudumist, oleme läbi viinud tundlikkusanalüüsi, mille puhul eeldatakse, et laste puhul on vaktsiini efektiivsus madalam. Uuringu üldised järeldused ei muutu. Siiski võivad täiendavad andmed vanusepõhise vaktsiini efektiivsuse kohta aidata saadud hinnanguid täpsustada. Teiseks eeldasime, et infektsioonist või vaktsineerimisest põhjustatud immuunsus kestab kauem kui simulatsioonides arvestatud ajahorisont (st 1 aasta). Laboratoorsed uuringud ja väliuuringud näitavad, et kaitse kestab mitu kuud [66]. Vaatamata nendele esialgsetele tõenditele on immuunsuse kestus endiselt ülimalt oluline uurimisvaldkond ja see on olemuslikult seotud viiruse evolutsiooniga. Samuti on võimalik, et nõrgenev immuunsus pakub jätkuvalt kaitset raskete haiguste eest, kuid ainult osaliselt nakkuse või edasikandumise eest, mis mõjutab karja immuunsusläve. Üldiselt määravad immuunsuse kestus ja kvaliteet COVID-19 puhangute sageduse kogu maailmas [67, 68]. Lisaks võib revaktsineerimine olla tõhus viis vaktsiini efektiivsuse parandamiseks [69–71]. Näiteks Tšiili aruandes revaktsineerimise efektiivsuse kohta [69–71] suureneb CoronaVaci vaktsiini tõhusus infektsioonide vastu pärast korduva süstimist 50,18-lt 70,89%-le. Revaktsineerimisega seotud vaktsineerimise tõhususe suurenemine võib kaasa aidata elanikkonna immuunsuse suurenemisele ja väärib edasist uurimist.
Kolmandaks viitasime algstsenaariumis inaktiveeritud SARS-CoV-2 vaktsiinile (BBIBP-CorV), mille tõhusus Delta variandi infektsiooni vastu oli 54,3%. Mitmed teised vaktsiinid (sh CoronaVac, WBIP-CorV, Ad{6}}nCoV ja ZF2001) on aga litsentsitud ja neid on Hiinas kasutatud. Tundlikkuse analüüsides muutsime vaktsiini efektiivsust kuni 79%. Peamine järeldus karjaimmuunsuse potentsiaalist ja vajadusest laiendada vaktsineerimiskampaaniat varakult lastele ning kasutada tõhusamaid vaktsiine on muutmata.
Järeldus
Kokkuvõtteks võib öelda, et praeguste tõendite põhjal on vaktsiinist põhjustatud karjaimmuunsuse saavutamine vähese/puuduva loomuliku immuunsusega populatsioonis keeruline. 2021. aasta novembri alguses tehti oluline samm 3+-aastastele isikutele mõeldud vaktsiini lubamisega. Vaktsiini kõhkluse minimeerimine kõigis vanuserühmades on veel üks oluline samm elanikkonna immuunsuse taseme tõstmisel. Need koos ülitõhusate vaktsiinide või kordusvaktsineerimisega on veelgi olulisemad, arvestades SARS-CoV-2 uute variantide võimalikku esilekerkimist, mis on paremini ülekantavad või immuunsüsteemist eemaletõukav. Oluline on see, et isegi kui karja immuunsuse saavutamine on ebatõenäoline immuunsuse nõrgenemise ja uute variantide ilmnemise tõttu, vähendab vaktsineerimine COVID{5}}-koormust järsult.
Viited
1. Wu JT, Leung K, Leung GM. Hiinast Wuhanist alguse saanud 2019-nCoV puhangu võimaliku siseriikliku ja rahvusvahelise leviku üleandmine ja prognoosimine: modelleeriv uuring. Lancet. 2020;395(10225):689–97. https:// doi.org/10.1016/S0140-6736(20)30260-9.
2. Pan A, Liu L, Wang C, Guo H, Hao X, Wang Q jt. Rahvatervise sekkumiste seos Wuhani COVID{1}} puhangu epidemioloogiaga. Hiina. JAMA. 2020;323(19):1915–23. https://doi.org/10.1001/jama.{9}}.6130.
3. Li Q, Guan X, Wu P, Wang X, Zhou L, Tong Y jt. Uue koroonaviirusega nakatunud kopsupõletiku varajane leviku dünaamika Hiinas Wuhanis. N Engl J Med. 2020;382(13):1199–207. https://doi.org/10.1056/NEJMoa2001316.
4. Chinazzi M, Davis JT, Ajelli M, Gioannini C, Litvinova M, Merler S jt. Reisipiirangute mõju 2019. aasta uudse koroonaviiruse (COVID-19) puhangu levikule. Teadus. 2020;368(6489):395–400. https://doi.org/1 0.1126/science.aba9757.
5. Maailma Terviseorganisatsioon. WHO koroonaviiruse (COVID-19) juhtpaneel. 2021. https://covid19.who.int/. Vaadatud 12. novembril 2021.
6. Washington NL, Gangavarapu K, Zeller M, Bolze A, Cirulli ET, Schiabor Barrett KM jt. SARS-CoV-2 B.1.1.7 tekkimine ja kiire levik Ameerika Ühendriikides. Kamber. 2021;184(10):2587–94.e2587. https://doi.org/10.1016/j. rakk.2021.03.052.
7. Gaymard A, Bosetti P, Feri A, Destras G, Enouf V, Andronico A jt. SARS-CoV-2 Lineage 20I/501Y.V1 (B.1.1.7, probleemne variant 202012/01) leviku ja võimaliku laienemise varajane hindamine Prantsusmaal, jaanuar kuni märts 2021. Euro Surveill. 2021;26(9):2100133. https://doi.org/10.2807/1560-7917. ES.2021.26.9.2100133.
8. Davies NG, Abbott S, Barnard RC, Jarvis CI, Kucharski AJ, Munday JD jt. SARS-CoV-2 liini B.1.1.7 hinnanguline edasikanduvus ja mõju Inglismaal. Teadus. 2021;372(6538):eabg3055. https://doi.org/10.1126/ science.abg3055.
9. Leung K, Shum MH, Leung GM, Lam TT, Wu JT. SARS-CoV-2 mutantsete tüvede N501Y varajane ülekanduvuse hindamine Ühendkuningriigis, oktoober–november 2020. Euro Surveill. 2021;26(1). https://doi. org/10.2807/1560-7917.ES.2020.26.1.2002106.
10. Zhao S, Lou J, Cao L, Zheng H, Chong MKC, Chen Z jt. Ühendkuningriigis SARS-CoV-2 N501Y asendamisega seotud ülekandeeelise kvantifitseerimine: varajane andmepõhine analüüs. J Travel Med. 2021;28(2). https://doi. org/10.1093/jtm/taab011.
11. Graham MS, Sudre CH, May A, Antonelli M, Murray B, Varsavsky T jt. SARS-CoV-2 variandiga B.1.1.7 seotud muutused sümptomatoloogias, uuesti nakatumises ja edasikanduvuses: ökoloogiline uuring. Lanceti rahvatervis. 2021;6(5):e335–45. https://doi.org/10.1016/S2468-2667(21)00055-4.
12. Volz E, Mishra S, Chand M, Barrett JC, Johnson R, Geidelberg L jt. SARS-CoV-2 liini B.1.1.7 edasikanduvuse hindamine Inglismaal. Loodus. 2021;593(7858):266–9. https://doi.org/10.1038/s41586-021-03470-x.
13. Hoffmann M, Arora P, Groß R, Seidel A, Hörnich BF, Hahn AS jt. SARS CoV-2 variandid B.1.351 ja P.1 pääsevad neutraliseerivate antikehade eest. Kamber. 2021;184(9):2384–93.e2312. https://doi.org/10.1016/j.cell.2021.03.036.
14. Wibmer CK, Ayres F, Hermanus T, Madzivhandila M, Kgagudi P, Oosthuysen B jt. SARS-CoV-2 501Y.V2 pääseb Lõuna-Aafrika COVID-19 doonoriplasma neutraliseerimisest. Nat Med. 2021;27(4):622–5. https://doi.org/10.1038/s41 591-021-01285-x.
15. Faria NR, Mellan TA, Whittaker C, Claro IM, DdS C, Mishra S jt. P.1 SARS-CoV-2 liini genoomika ja epidemioloogia Manauses, Brasiilias. Teadus. 2021:eabh2644. https://doi.org/10.1126/science.abh2644.
16. Campbell F, Archer B, Laurenson-Schafer H, Jinnai Y, Konings F, Batra N jt. 2021. aasta juuni seisuga on murettekitavate SARS-CoV{3}} variantide suurenenud ülekanduvus ja ülemaailmne levik. Euro Surveill. 2021;26(24). https://doi.org/10.2807/1 560-7917.Es.2021.26.24.2100509.
17. Challen R, Dyson L, Overton CE, Guzman-Rincon LM, Hill EM, Stage HB jt. SARS-CoV-2 uudsete variantide varased epidemioloogilised tunnused: B.1.617.2 rajamine Inglismaal. medRxiv. 2021;2021(21258365):2006– 5. https://doi.org/10.1101/2021.06.05.21258365.
18. Dagpunar J. Vahehinnangud COVID-i -19 B.1.617.2 murettekitava variandi suurenenud edasikanduvuse, kasvukiiruse ja paljunemisarvu kohta Ühendkuningriigis. medRxiv. 2021;2021(21258293):2006–3. https://doi.org/1 0.1101/2021.06.03.21258293.
19. Puhang.info. Murearuannete variant. https://outbreak.info/situation reports. Kasutatud 10. augustil 2021.
20. Hiina haiguste tõrje ja ennetamise keskus. Uue koroonaviirushaiguse levik 2019. http://2019ncov.chinacdc.cn/2019-nCoV/. Kasutatud 12. novembril 2021.
21. Zhang M, Xiao J, Deng A, Zhang Y, Zhuang Y, Hu T jt. COVID-19 delta variandi B.1.617.2 puhangu ülekandedünaamika – Guangdongi provints, Hiina, mai–juuni 2021. Hiina CDC nädalakiri. 2021; 3(27):584–6. https://doi.org/10.46234/ccdcw2021.148.
22. Wang YP, Chen RC, Hu FY, Lan Y, Yang ZW, Zhan C jt. Hiinas Guangzhous tekkiva SARS-CoV-2 Delta lenduvate orgaaniliste ühendite levik, viiruse kineetika ja kliinilised omadused. Kliiniline meditsiin. 2021;40. https://doi.org/10.1016/j. eklinm.2021.101129.
23. Lopez Bernal J, Andrews N, Gower C, Gallagher E, Simmons R, Thelwall S jt. Covid-19 vaktsiinide tõhusus B.1.617.2 (Delta) variandi vastu. N Engl J Med. 2021. https://doi.org/10.1056/NEJMoa2108891.
24. Hiina Rahvavabariigi riiklik tervisekomisjon. Värskendus COVID-19 vaktsiini manustamise annuste kohta. http://www.nhc.gov.cn/xcs/ yqjzqk/list_gzbd.shtml. Kasutatud 12. novembril 2021.
25. Britton T, Ball F, Trapman P. Matemaatiline mudel näitab populatsiooni heterogeensuse mõju karja immuunsusele SARS-CoV -2 suhtes. Teadus. 2020; 369 (6505): 846–9. https://doi.org/10.1126/science.abc6810.
26. mai RM, Anderson RM. Ruumiline heterogeensus ja immuniseerimisprogrammide ülesehitus. Matemaatika Biosci. 1984;72(1):83–111. https://doi.org/10.{7}}/0025-5564(84)90063-4.
27. Zhang J, Klepac P, Read JM, Rosello A, Wang X, Lai S jt. Inimeste sotsiaalsete kontaktide ja loomadega kokkupuute mustrid Hiinas Shanghais. Sci Rep. 2019;9(1):15141. https://doi.org/10.1038/s41598-019-51609-8.
28. Hu S, Wang W, Wang Y, Litvinova M, Luo K, Ren L jt. Nakkuslikkus, vastuvõtlikkus ja riskitegurid, mis on seotud SARS-CoV-2 levikuga intensiivse kontaktijälgimise käigus Hiinas Hunanis. Nat Commun. 2021;12(1): 1533. https://doi.org/10.1038/s41467-021-21710-6.
29. Xin H, Li Y, Wu P, Li Z, Lau EHY, Qin Y jt. 2019. aasta koroonaviiruse haiguse (COVID-19) varjatud perioodi hindamine. Clin Infect Dis. 2021. https://doi.org/1 0.1093/cid/ciab746.
30. Zhao S, Tang B, Musa SS, Ma S, Zhang J, Zeng M jt. Genereerimisintervalli hindamine ja COVID{1}} varjatud perioodi järeldamine kontaktide jälgimise andmetest. Epideemiad. 2021;36:100482. https://doi.org/10.1016/j. epideem.2021.100482.
31. Sun K, Wang W, Gao L, Wang Y, Luo K, Ren L jt. SARS-CoV-2 ülekande heterogeensused, kineetika ja juhitavus. Teadus. 2021; 371(6526). https://doi.org/10.1126/science.abe2424.
32. Pang XH, Ren LL, Wu SS, Ma WT, Yang J, Di L jt. Külma ahela toidusaaste on COVID{2}} taastekke võimalik põhjus Pekingis. Natl Sci Rev. 2020;7(12):1861–4. https://doi.org/10.1093/nsr/nwaa264.
33. Chen X, Chen Z, Azman AS, Deng X, Sun R, Zhao Z jt. Seroloogilised tõendid inimese nakatumise kohta SARS-CoV-ga-2: süstemaatiline ülevaade ja metaanalüüs. Lancet Glob Health. 2021;9(5):e598–609. https://doi.org/10.{10}}/S2214-109X(21)00026-7.
34. Riigi Statistikaamet. Hiina rahvastiku- ja tööhõivestatistika aastaraamat 2019. https://navi.cnki.net/knavi/yearbooks/YZGRL/detail. Kasutatud 8. märtsil 2021.
35. ÜRO. World Population Prospects 2019. https://population.un.org/ wpp/Download/Standard/Population/. Kasutatud 8. märtsil 2021.
36. Wang HH, Wang JJ, Wong SY, Wong MC, Li FJ, Wang PX jt. Multimorbiidsuse epidemioloogia Hiinas ja mõju tervishoiusüsteemile: läbilõikeuuring 162 464 Lõuna-Hiina kogukonna leibkonna elaniku seas. BMC Med. 2014;12(1):188. https:// doi.org/10.1186/s{10}}.
37. Maailma Terviseorganisatsioon. WHO SAGE väärtustab COVID{1}} vaktsineerimise määramise ja tähtsuse järjekorda seadmise raamistikku. https://www.who.int/publications/i/item/who-sage-values-framework-for-the-allocation-and-prioritization of-covid{11}}vaktsineerimine. Kasutatud 8. märtsil 2021.
38. Maailma Terviseorganisatsioon. Ajutised soovitused vaktsiini Pfizer–BioNTech COVID-19 (BNT162b2) kasutamiseks hädaolukorra kasutusloendis. https://www.who.int/publications/i/item/WHO-2019-nCoV-vaccines-SAGE_ soovitus-BNT162b2-2021.1. Kasutatud 8. märtsil 2021.
39. Maailma Terviseorganisatsioon. Pfizer BioNTech COVID-19 vaktsiin: mida peate teadma. https://www.who.int/news-room/feature-stories/detail/who-can-take the-pfizer-biontech-covid-19%2D%2Dvaccine. Kasutatud 8. märtsil 2021.
40. Maailma Terviseorganisatsioon. Vahepealsed soovitused COVID-i vastase ChAdOx1-S [rekombinantse] vaktsiini-19 kasutamiseks (AstraZeneca COVID-19 vaktsiin AZD1222, SII Covishield, SK Bioscience). https://www.who.int/publications/i/item/WHO-2019-nCoV-vaccines-SAGE_recommendation-A ZD1222-2021.1. Kasutatud 8. märtsil 2021.
41. Chen X, Chen Z, Azman AS, Sun R, Lu W, Zheng N jt. Loodusliku infektsiooni või vaktsineerimisega indutseeritud SARS-CoV-2 variantide vastaste antikehade neutraliseerimine: süstemaatiline ülevaade ja koondatud metaanalüüs. Clin Infect Dis. 2021. https://doi.org/10.1093/cid/ciab646.
42. Al Kaabi N, Zhang Y, Xia S, Yang Y, Al Qahtani MM, Abdulrazzaq N jt. Kahe inaktiveeritud SARS-CoV-2 vaktsiini mõju sümptomaatilisele COVID-19 infektsioonile täiskasvanutel: randomiseeritud kliiniline uuring. JAMA. 2021;326(1):35–45. https://doi.org/10.1001/jama.2021.8565.
43. Khoury DS, Cromer D, Reynaldi A, Schlub TE, Wheatley AK, Juno JA jt. Neutraliseerivate antikehade tasemed ennustavad tugevalt immuunkaitset sümptomaatilise SARS-CoV-2 nakkuse eest. Nat Med. 2021;27(7):1205–11. https://doi.org/10.1038/s{10}}.
44. Palacios R, Batista AP, Albuquerque CSN, Patiño EG, JdP S, MTRP C jt. COVID-19 inaktiveeritud vaktsiini tõhusus ja ohutus tervishoiutöötajatel Brasiilias: PROFISCOV-uuring. SSRN. 2021. https://doi.org/1 0.2139/ssrn.3822780.
45. Li XN, Huang Y, Wang W, Jing QL, Zhang CH, Qin PZ jt. Inaktiveeritud SARS-CoV-2 vaktsiinide tõhusus Delta variandi nakkuse vastu Guangzhous: testnegatiivne haigusjuhtude kontroll reaalses maailmas. Nakatavad esilekerkivad mikroobid. 2021;10(1):1751–9. https://doi.org/10.1080/22221751.2021.1969291.
46. Ma K, Yi Y, Li Y, Sun L, Deng A, Hu T jt. Inaktiveeritud COVID-19 vaktsiinide tõhusus COVID-19 kopsupõletiku ja B.1.617.2 (Delta) variandi põhjustatud raskete haiguste vastu: tõendid Hiinas Guangdongis puhkenud haiguspuhangust. SSRN. 2021. https://doi.org/10.2139/ssrn.3895639.
47. Hu Z, Tao B, Li Z, Song Y, Yi C, Li J jt. Mitteaktiivsete COVID-19 vaktsiinide tõhusus Hiinas Jiangsus asuvate B.1.617.2 (Delta) variandiga nakatunud patsientide raskete haiguste vastu. medRxiv. 2021;2021(21263010):2009–2. https://doi.org/10.{12}}/2021.09.02.21263010.
48. Sheikh A, McMenamin J, Taylor B, Robertson C. SARS-CoV-2 Delta VOC Šotimaal: demograafia, haiglasse sattumise oht ja vaktsiini tõhusus. Lancet. 2021;397(10293):2461–2. https://doi.org/10.1016/S014 0-6736(21)01358-1.
49. Halloran ME, Longini IM, Struchiner CJ. Toimeviisid ja ajas muutuv VES. In: Vaktsiiniuuringute kavandamine ja analüüs. New York, NY: Springer New York; 2010. Lk. 131–51.
50. Yang J, Chen X, Deng X, Chen Z, Gong H, Yan H jt. COVID-19 esimese pandeemialaine haiguskoormus ja kliiniline raskusaste Wuhanis Hiinas. Nat Commun. 2020;11(1):5411. https://doi.org/10.1038/s41467-020-19238-2.
51. Poletti P, Tirani M, Cereda D, Trentini F, Guzzetta G, Sabatino G jt. Vanuse seos sümptomite ja kriitilise haiguse tekke tõenäosusega nende lähikontaktsete seas, kes puutuvad kokku SARS CoV-2 kinnitatud nakkusega Itaalias. JAMA Netw avatud. 2021;4(3):e211085. https://doi. org/10.1001/jamanetworkopen.2021.1085.
52. Fisman DN, Tuite AR. Uute SARS-CoV-2 variantide virulentsuse järkjärguline suurenemine Ontarios, Kanadas. medRxiv. 2021;2021(21260050):2007–5. https:// doi.org/10.1101/2021.07.05.21260050.
53. Diekmann O, Heesterbeek JA, Metz JA. Põhilise paljunemissuhte R0 määratlusest ja arvutamisest heterogeensete populatsioonide nakkushaiguste mudelites. J Math Biol. 1990;28(4):365–82. https://doi.org/10.1007/BF00178324.
54. Yang J, Marziano V, Deng X, Guzzetta G, Zhang J, Trentini F jt. Vaatamata vaktsineerimisele vajab Hiina mittefarmatseutilisi sekkumisi, et hoida ära COVID-19 ulatuslikke puhanguid 2021. aastal. Nat Hum Behav. 2021;5(8):1009–20. https://doi.org/10.1038/s41562-021-01155-z.
55. Mistry D, Litvinova M, Pastore YPA, Chinazzi M, Fumanelli L, Gomes MFC jt. Inimeste kõrge eraldusvõimega segunemismustrite järeldamine haiguste modelleerimiseks. Nat Commun. 2021;12(1):323. https://doi.org/10.1038/s41467-020-20544-a.
56. Wang J, Jing R, Lai X, Zhang H, Lyu Y, Knoll MD jt. COVID-19 vaktsineerimise aktsepteerimine COVID-19 pandeemia ajal Hiinas. Vaktsiinid (Basel). 2020;8(3). https://doi.org/10.3390/vaccines8030482.
57. Chen M, Li Y, Chen J, Wen Z, Feng F, Zou H jt. Veebiküsitlus Hiina täiskasvanute suhtumise ja valmisoleku kohta COVID-19 vaktsineerimiseks. Hum Vaccin Immunother. 2021;17(7):1–10. https://doi.org/10.1080/2164551 5.2020.1853449.
58. Wang C, Han B, Zhao T, Liu H, Liu B, Chen L jt. Vaktsineerimisvalmidus, vaktsiini kõhklus ja hinnanguline katvus COVID{1}} vaktsineerimise esimeses voorus Hiinas: riiklik läbilõikeuuring. Vaktsiin. 2021; 39(21): 2833–42. https://doi.org/10.1016/j.vaccine.2021.04.020.
59. Gan L, Chen Y, Hu P, Wu D, Zhu Y, Tan J jt. Valmisolek SARS CoV-2 vaktsineerimiseks ja sellega seotud tegurid Hiina täiskasvanute seas: läbilõikeuuring. Int J Environ Res Rahvatervis. 2021;18(4). https://doi.org/1 0.3390/ijerph18041993.
60. Lazarus JV, Ratzan SC, Palayew A, Gostin LO, Larson HJ, Rabin K jt. Ülemaailmne uuring COVID-19 vaktsiini võimaliku aktsepteerimise kohta. Nat Med. 2021;27(2):225–8. https://doi.org/10.1038/s41591-020-1124-9.
61. Hodgson D, Flasche S, Jit M, Kucharski AJ, rühm CC-W. Nakkushaiguste matemaatilise modelleerimise keskus C-WG. Vaktsineerimisest põhjustatud karjaimmuunsus SARS-CoV-2 B.1.1.7 variandi vastu. Euro Surveill. 2021;26(20). https://doi.org/10.2807/1560-7917.ES.2021.26.20.2100428.
62. Kwok KO, Lai F, Wei WI, Wong SYS, Tang JWT. Karja immuunsus – COVID-19 epideemiate peatamiseks vajaliku taseme hindamine mõjutatud riikides. J Info. 2020;80(6):e32–3. https://doi.org/10.1016/j.jinf.2020.03.027.
63. Omer SB, Yildirim I, Forman HP. Karja immuunsus ja mõju SARS CoV-2 tõrjele. JAMA. 2020;324(20):2095–6. https://doi.org/10.1001/jama.{9}}.20892.
64. Haiguste tõrje ja ennetamise keskused. Üleriigiline kaubandusliku labori seroprevalentsi uuring. https://covid.cdc.gov/covid-data-tracker/ #national-lab. Kasutatud 8. augustil 2021.
65. Zhang Y, Zeng G, Pan H, Li C, Hu Y, Chu K jt. Inaktiveeritud SARS-CoV-2 vaktsiini ohutus, talutavus ja immunogeensus tervetel täiskasvanutel vanuses 18-59 aastat: randomiseeritud topeltpime platseebokontrollitud 1./2. faasi kliiniline uuring. Lancet Infect Dis. 2021;21(2):181–92. https://doi.org/10.1016/ S1473-3099(20)30843-4.
66. Wang Z, Muecksch F, Schaefer-Babajew D, Finkin S, Viant C, Gaebler C jt. Looduslikult tõhustatud neutraliseeriv ulatus SARS-CoV-2 vastu üks aasta pärast nakatumist. Loodus. 2021;595(7867):426–31. https://doi.org/10.1038/s{11}}.
67. Lavine JS, Bjornstad ON, Antia R. Immunoloogilised omadused reguleerivad COVID-19 üleminekut endeemilisusele. Teadus. 2021;371(6530):741. https:// doi.org/10.1126/science.abe6522.
68. Saad-Roy CM, Wagner CE, Baker RE, Morris SE, Farrar J, Graham AL jt. Immuunsuse elulugu, vaktsineerimine ja SARS-CoV-2 dünaamika järgmise 5 aasta jooksul. Teadus. 2020;370(6518):811–8. https://doi.org/10.1126/ science.abd7343.
69. Barda N, Dagan N, Cohen C, Hernan MA, Lipsitch M, Kohane IS jt. BNT162b2 mRNA COVID-19 vaktsiini kolmanda annuse efektiivsus raskete tagajärgede ärahoidmisel Iisraelis: vaatlusuuring. Lancet. 2021; 398(10316):2093–100. https://doi.org/10.1016/S0140-6736(21)02249-2.
70. Saciuk Y, Kertes J, Shamir Stein N, Ekka ZA. BNT162b2 mRNA vaktsiini kolmanda annuse efektiivsus. J Infect Dis. 2021;225(1):30–3. https://doi.org/10.{9}}/infdis/jiab556.
71. Rafael Araos AJ, vCovid-tervishoiuministeerium. COVID-19 vaktsiini tõhususe hindamine Tšiilis. https://cdn.who.int/media/docs/default-source/blue print/chile_rafael-araos_who-vr-call_25oct2021.pdf?sfvrsn =7a7ca72a_7. Kasutatud 10. oktoobril 2021.