Hiina uuring avastas metananotroofse biosünteesi jaoks vajaliku MbnBC holoensüümi kristallstruktuuri ja katalüütilise mehhanismi

Lisateabe saamiseks tehke järgmist.Joanna.jia@wecistanche.com

Metanobaktiinid (Mbns) on vaske siduvate peptiidide perekond, mis on seotud vase omastamisega metanantroofide poolt ja on potentsiaalsed terapeutilised ained haiguste raviks, mida iseloomustab vaske häiritud kogunemine. Mbnnid tekivad MbnA lähteaine peptiidi muutmisel tsüsteiinijääkidele, mis on katalüüsitud mbnB, rauast sõltuvatest ensüümidest ja MbnC-st koosnevate põhiliste biosünteetiliste masinatega. MbnBC holoensüümi katalüüsi mehhanistlikud detailid on siiski ebaselged.

herba epimedium sagittatum

2. veebruaril 2022 avaldati Cheng Wei Sichuani ülikooli meeskonnas Cell Researchis uurimus "Metanobaktiini biosünteesiks vajaliku MbnBC holoensüümi kristallstruktuur ja katalüütiline mehhanism", mis näitas MbnABC komplekse kahest erinevast liigist. Substraadi kristallstruktuur näitas, et substraadi MbnA juhtiv peptiid seondub MbnC-ga MbnBC holoensüümi värbamiseks, samas kui MbnA tuumeptiid asub MbnB-MbnC interaktsiooni tekitatud katalüütilises õõnsuses ja omab ainulaadset triironiklastrit.

bioflavonoidide tabletid

Substraadi sulfhüdrrüüli kinnitamine triironikeskusesse võimaldab dioksügeenist sõltuvat reaktsiooni oksasolooni-tioamiidi paigaldamiseks. MbnABC kompleksi struktuurianalüüs ja MbnB variantide funktsionaalsed uuringud tuvastasid konserveeritud katalüütilise aspartaadi jäägi, nagu on vajalik MbnBC vahendatud MbnA modifitseerimiseks. Kokkuvõtteks võib öelda, et see uuring näitab mbnBC komplekside sarnaseid struktuure ja funktsioone erinevatest liikidest, näidates MbnBC holoensüümi evolutsiooniliselt konserveerunud katalüütilist mehhanismi.

Metallid, nagu vask, on olulised füsioloogilise homöostaasi säilitamiseks kõigis organismides ja on eriti seotud mõnede oluliste bakteriaalsete valkude katalüüsiga. Kuigi vask on vajalik teatud valkude aktiivsuseks, kasutatakse seda ka antimikroobse ainena erinevates tööstus- ja meditsiinivaldkondades. Vastuseks võib baktereid detoksifitseerida vase kelaativate ühendite, näiteks Chalkophore'i abil. Chalkophore molekulid meenutavad raua siduvaid kandjaid, mis on seotud bakterite ainevahetuse ja detoksifitseerimisega. Eelkõige on neid kliinilistes uuringutes uuritud wilsoni tõve võimalike ravimeetoditena, geneetilise häirena, mis põhjustab vase liigset kogunemist elunditesse (maks ja aju).

Metanoksiinid (Mbns) on Chalkophore, mis esineb ainult metanofides. Mitmed Mbnid on iseloomustatud ja leitud ribosomaalselt sünteesitud ja translatsioonijärgselt modifitseeritud peptiidid (RiPP). Mbn molekulid on biosünteesitud geneetiliselt kodeeritud lähteainete polüpeptiididest (MbnAs), mis sisaldavad juhtivat peptiid (LP) biosünteetiliste masinate ja tuumpeptiidi (CP) äratundmiseks, mis muutub küpseks tooteks pärast MbnA modifitseerimist ja LP lõhenemist. Methylosinus trichosporium (Mt) OB3b-s avastati hiljuti MbnBC kompleksiga seotud biosünteetiline tuumikmasin.

hesperidiin kasutabEdendabEnsüümidjaAntioksüdante

Praeguseks on Mbn biosünteesi jaoks iseloomustatud viit geenikodeerivat klastrit (I–V). Teadaolevates Mbn operonites järgnevad mbnA-le alati MbnB ja MBNC geenid, mis vastutavad MbnA modifikatsiooni eest. prognoositakse, et mbnB kodeerib triosefosfaadi isomeraasi (TIM) ja kuvab MbnA-modifitseeriva aktiivsuse ainult mbnC-ga keerulisel ajal. MbnBC masinate korraldus ja katalüütilised mehhanismid on siiski teadmata.

Siin määrati uuringus kindlaks Rugamonas rubra (Rr) ATCC 43154 (RrMbnBC, esindab III rühma esindav RrMbnABC) ja Vibrio caribbenthicus (Vc) BAA-2122 (VcMbnBC, VcMbnBC, mis esindab VcMbnBC) komplekside kristallstruktuure. RrMbnABC ja VcMbnABC struktuurid on konserveeritud ja sisaldavad ainulaadset triironiklastrit, mis on seotud substraadi MbnA tsüsteiinijääkidega. Selle uuringu tulemused selgitavad mehhanismi, mille abil MbnBC holoensüüm katalüüsib Mbni tootmist.

Cistanche tubuosasoodustab ensüüme ja antioksüdante, klõpsake siin, et rohkem teada saada