Randomiseeritud topeltpime ristuuring, et uurida resistentse tärkliseprebiootikumi mõju kroonilise neeruhaiguse korral (ReSPECKD), 2. osa
May 26, 2023
Ohutusjärelevalve komitee
Selle uuringu sekkumised on madala riskiga ja need on lisaks tavapärasele hooldusele, mida osalejad saavad kogu katseperioodi jooksul ja pärast uuringu lõppu; seetõttu ei moodustata andmete ja ohutuse järelevalve nõukogu (DSMB). Siiski toimub katse keskpunktis, kui kõik osalejad on oma esimese raviperioodi lõpetanud, väline ülevaade osaleja kliinilisest keemiast ja kõigist uuringu kõrvalnähtudest. Selle ülevaate viib läbi väljaspool Manitobat pärit nefroloog. Selles ülevaates jälgitakse tõendeid ravi kahjustamise kohta, otsitakse kliinilise keemia suundumusi ja/või raviga seotud ootamatute/ootamatute sündmuste sagenemist ning võetakse asjakohased meetmed. Need toimingud võivad hõlmata protokolli muudatuste väljapakkumist. Sõltuvalt läbivaatuse tulemustest võivad need hõlmata uuringu varajast peatamist ravi selge kahju tõttu.
Asjakohaste uuringute kohaselt on tsistanche traditsiooniline Hiina ravimtaim, mida on sajandeid kasutatud erinevate haiguste raviks. Teaduslikult on tõestatud, et sellel on põletikuvastased, vananemisvastased ja antioksüdantsed omadused. Uuringud on näidanud, et tsistanche on kasulik neeruhaigusega patsientidele. Tistanche toimeained vähendavad teadaolevalt põletikku, parandavad neerufunktsiooni ja taastavad kahjustatud neerurakke. Seega võib cistanche integreerimine neeruhaiguste raviplaani pakkuda patsientidele oma seisundi juhtimisel suurt kasu. Cistanche aitab vähendada proteinuuriat, alandab BUN-i ja kreatiniini taset ning vähendab edasise neerukahjustuse riski. Lisaks aitab tsistanche vähendada kolesterooli ja triglütseriidide taset, mis võib olla ohtlik neeruhaigusega patsientidele.

Klõpsake valikul rou cong rong eelised
【Lisateabe saamiseks: david.deng@wecistanche.com / WhatApp:86 13632399501】
Statistiline analüüs
Mikrobioomiandmete bioinformaatika ja statistilised analüüsid viiakse läbi Microbiome Insightsi ja CHI platvormi Data Science abiga; seda ajakohastatakse soovituste ja tehnoloogiliste edusammude põhjal praegusest kuni proovide töötlemiseni. Üldiselt kasutatakse kattuvate paarisotsaga Illumina fast failide liitmiseks FLASH assembleri [22] vaikesätteid. UPARSE algoritmi [23] kasutatakse (a) lugemite kvaliteedi filtreerimiseks, mis põhineb maksimaalsel eeldataval veaväärtusel=1.0, (b) unikaalsete järjestuste tuvastamiseks, (c) arvukuse sorteerimiseks ja üksiktoonide eemaldamine, (d) lugemiste rühmitamine operatiivseteks taksonoomilisteks üksusteks (OTU) 97-protsendilise identsuse läve alusel, (e) de novo ja viitepõhine kimääride kontroll (GOLD andmebaasi [22] alusel) ja (f) OTU tabel. Taksonoomiline klassifikatsioon viiakse seejärel läbi UCLUST [24] QIIME [26] juurutusega ja joondatakse PyNAST-i algoritmi [25] abil Greengenesi andmebaasiga. Fülogeneetilised puud ehitati FastTree'ga [27], et mikroobikooslusi veelgi võrrelda. Enne järgnevate analüüside tegemist filtreeritakse saadud OTU tabel, et eemaldada kõik madala järjestussügavusega proovid. Ühenduse rikkuse ja mitmekesisuse indeksid arvutatakse seejärel QIIME abil proovi kohta kindlal ühtlasel sügavusel. Fülogeneetilised (kaalutud UniFraci kaugused) ja arvukusepõhised (Bray-Curtise erinevused) mitmekesisuse mõõdikud arvutatakse pärast lõpliku OTU tabeli normaliseerimist, kasutades kumulatiivse summa skaleerimise (CSS) teisendust [28]. Saadud kaugusmaatriksitele rakendatakse põhikoordinaatide analüüsi (PCoA), et luua kahemõõtmelised graafikud, kasutades tarkvara PRIMER-6 vaikeseadeid (PRIMER-E Ltd, Plymouth). Proovide rühmitusmustrite seostamiseks igas nišis olevate OTU-de osakaaluga tehakse järelevalveta rühmitusanalüüs (tuum-OTU-d on määratletud kui need, mis esinevad vähemalt 75 protsendis iga niši proovidest). Valitud OTU-de suhteline arvukus normaliseeritakse proovide lõikes. Bray-Curtise erinevused arvutatakse paketi R "vegan" [29] abil ja saadud maatriks allutatakse järelevalveta hierarhilisele klastrile, kasutades paketti R "dendextend" [30] ja visualiseeritakse üle arvukuse maatriksi soojuskaart, kasutades R paketti "complex-heatmap" [31]. SAS-i UNIVARIATE protseduuri kasutatakse mitmekesisuse mõõtmise jääkide normaalsuse testimiseks. Mittetavaliselt jaotunud andmed teisendatakse kas logaritmi või Box-Coxi võimsusega ja seejärel tehakse dispersioonanalüüsi (ANOVA) test, kasutades SAS-i MIXED protseduuri. Kõiki rühmade paaripõhiseid võrdlusi testitakse Tukey üliõpilaste vahemiku reguleerimise abil. Permutatsioonilist mitme muutujaga dispersioonanalüüsi (PERMANOVA; rakendatakse Primer6 tarkvaras) kasutatakse oluliste erinevuste tuvastamiseks mikroobikoosluste mitmekesisuse mõõdikute vahel. Valitud OTU-de suhtelist arvukust testitakse statistiliselt oluliste seoste suhtes saadaolevate metaandmetega, kasutades mitmemõõtmelist analüüsi koos lineaarse modelleerimisega (MaAsLin) [32], võttes arvesse kõiki võimalikke segajaid (koosmuutujaid), mida võib seostada mikrobioomi profiiliga (st soo, vanus, KMI) ja osalejad (käsitletakse juhusliku tegurina). Olulisi seoseid käsitletakse allpool väärtusläve 0,1. Mikrobioomi funktsionaalsuse muutuste hindamiseks kasutatakse korrelatsioonivõrgustiku analüüsi (CoNet, [33]), et uurida mikroobide koosesinemise / vastastikuse välistamise seoseid ja tuvastada jaoturi OTU-d, mis näitavad kõige rohkem positiivseid/negatiivseid korrelatsioone teistega. OTUd ravitingimustes.
Ravi mõju lineaarsetele tulemustele iga perioodi lõpus analüüsitakse SAS MIXED (SAS 9.4) protseduuriga. Järjestus ja sugu kaasatakse mudelisse fikseeritud teguritena ning osalejad korduvate teguritena. Andmete jaotuse normaalsus määratakse Shapiro-Wilki testi abil ja mittenormaalsed muutujad teisendatakse enne analüüsi. Demograafilised andmed esitatakse kui keskmine ± standardhälve. Kui pole teisiti täpsustatud, esitatakse tulemused kui vähimruutude keskmine ± keskmise standardviga (SEM). Kõigi analüüside statistiline olulisus seatakse väärtusele p < 0,05. CHI andmeteaduse platvorm pakub lisaks projekti biostatistika toele andmehalduse tuge.
Randomiseerimine, pimestamine ja koodimurdmine
Sobilikud patsiendid (n=36) läbivad algtaseme hindamise ja jagatakse juhuslikult kahte rühma, millest igaüks koosneb 18 osalejast. Juhusliku valiku viib läbi Manitoba ülikooli George ja Fay Yee tervishoiu innovatsioonikeskuse (CHI) biostatistika platvormi sõltumatu teadlane. Juhuslikuks muutmiseks kasutatakse R statistilises programmeerimiskeeles (versioon 3.5.3) kirjutatud koodi. Ravi määratakse suhtega 1: 1. Kokku valmistatakse 48 randomiseerimiskaarti, üks komplekt 24 kummagi soo kohta. Randomiseerimise ajakava kantakse üle läbipaistmatute pitseeritud ümbrike komplektidesse. Pärast osaleja baaskülastust avavad uuringupersonal kinnise ümbriku, mis sisaldab osaleja eraldist. Sekkumiste järjekord on pime nii uurijatele kui ka osalejatele. Ravi viiakse läbi suletud kotikestes; väline osapool pimestab kotikese sisu, antakse A- või B-märgisega uuringupersonalile ja väljastatakse osalejatele vastavalt nende raviperioodile. Ravi ei vabastata enne analüüside lõppu, välja arvatud juhul, kui see on vajalik kliinilise uuringu ajal esinevate kõrvalnähtude tõttu. Samuti vaatab osaleja kliiniliste andmete keskpunktis läbi sõltumatu nefroloog, kes ei ole pimedaks tehtud (vt jaotist "Kvalifitseeritud uurija kohustused").
Proovi suuruse arvutamine
Selles uuringus osaleva 30-liikmelise lõpliku proovi suurus suudab tuvastada 17,5 μmol/L p-kresoolsulfaadi töötluse erinevuse ehk umbes 15 protsenti muutust võimsusega 0,88 (alfa {{6} },05, kahepoolne), arvestades, et inimese sees on korrelatsioon 0,79 [23] ja p-kresoolsulfaadi üldsisalduse hinnanguline standardhälve on 45 μmol/L [9]. Ureemiliste lahustunud ainete 30-protsendilist või suuremat langust peetakse kliiniliselt oluliseks, mis õigustab täiendavaid uuringuid selle prebiootilise sekkumise uurimiseks kroonilise neeruhaiguse korral ja oleme kindlad, et suudame sellise muutuse tuvastada, kui see peaks toimuma. Väljalangemisest tingitud jõukaotuse arvessevõtmiseks värbame 36 osalejat.
Analüüsi kaasamine
Esmane analüüs viiakse läbi kõigi osalejate (ravikavatsus) analüüsikomplekti abil. Esmast analüüsi korratakse Täitjate analüüsikomplektis. Demograafilisi andmeid ja kõiki muid algtaseme mõõtmisi analüüsitakse nii kõigi osalejate kui ka lõpetajate komplektis.
Lõpetajate analüüsikomplekt: kõik katse läbinud osalejad.
Kõikide osalejate analüüsikomplekt: kõik randomiseeritud osalejad.
Osalejate prooviravi katkestamine/eemaldamine
Igal osalejal on õigus igal ajal katsest loobuda. Osalejad võivad katses osalemise igal ajal katkestada ja neil palutakse võtta ühendust uurimisrühma liikmega, et teavitada neid oma otsusest. Lisaks võivad uurijad igal ajal osaleja uuringust välja jätta, kui uurijad peavad seda vajalikuks mis tahes põhjusel, sealhulgas rasedus, sobimatus (kas tuleneb uuringu käigus või on sõeluuringul tagasiulatuvalt tähelepanuta jäetud), oluline kõrvalekalle protokollist, oluline mittevastavus. protokolli järgimine, haiguse progresseerumine, mille tulemuseks on suutmatus jätkata protokolli järgimist, nõusoleku tagasivõtmine ja järelkontrolli kaotamine.

Tagasivõtmine ei too kaasa selle osaleja andmete analüüsist väljajätmist. Kuna esmane analüüs põhineb kavatsusel ravida, tehakse ka ainult täielik analüüs.
Kui osaleja tühistatakse prooviperioodi esimese 4 nädala jooksul, asendatakse ta. Asendusosaleja tagasivõtmisel hilisemat asendamist ei toimu.
Taganemise põhjus märgitakse CRF-i, kui see on esitatud.
Töötasu
Osalejatele makstakse 200 dollarit iga läbitud perioodi eest või proportsionaalselt jaotatud väärtust, kui nad proovist loobuvad. Iga osaleja saaks kogu prooviperioodi läbimisel kokku 400 dollarit.
Osalejate nimesid ja aadresse kasutatakse tšekkide koostamiseks, trükkimiseks, postitamiseks ja finantsarvestuse pidamiseks või töötasu tšekkideks. Tasu tšeki kättesaamisel antakse osalejale ettemaksu postikulu ja ümbrik koos allkirja nõudega. Osalejatel palutakse vorm CDIC-le tagastada. Seda kirjet säilitatakse maksimaalselt 7 aastat.
Arutelu
CKD-d on seostatud muutustega soolestiku mikroobide ökoloogias ehk düsbioosiga, mis võib kaasa aidata haiguse progresseerumisele. Kroonilise neeruhaigusega inimestel ja loomadel on soolestiku keskkonnas sügavad muutused, sealhulgas muutused mikroobide koostises, suurenenud väljaheidete pH ja suurenenud soolestiku mikroobidest pärinevate metaboliitide tase veres. Hiljutised uuringud on keskendunud toitumisviisidele, et soolestiku mikroobikoosluste koostist soodsalt muuta kroonilise neeruhaiguse ravimeetodina. Resistentne tärklis (RS), prebiootikum, mis soodustab soolestiku bakterite, nagu bifidobakterid ja laktobatsillid, vohamist, suurendab metaboliitide, sealhulgas lühikese ahelaga rasvhapete tootmist, millel on mitmeid tervist edendavaid eeliseid. Loommudelite ja kroonilise neeruhaigusega isikutega tehtud uuringud näitavad, et RS-i lisamine vähendab ureemilise retentsiooni lahustunud ainete, sealhulgas indoksüüülsulfaadi ja p-kresoolsulfaadi kontsentratsiooni. On näidatud, et kääritatav kiudainerikas amüloosisisaldusega 2. tüüpi maisiresistentne tärklis (HAMRS2) muudab kroonilise neeruhaigusega rotimudelites soolestiku keskkonda, mille tulemuseks on märkimisväärselt paranenud neerufunktsioon. On näidatud, et RPS, mis on R2-resistentne tärklis, suurendab süsivesikuid lagundavaid baktereid, nagu Bifidobacteria, ja vähendab proteolüütilise aktiivsusega baktereid, nagu E. coli [14, 17, 18]. Samuti on näidatud, et RPS vähendab soolestiku mikrobioomist pärinevate ureemiliste toksiinide kontsentratsiooni sigadel [19]. Kuigi resistentse tärklisega seotud loom- ja inimuuringud on näidanud võimet muuta soolestiku mikrobiotot ja vähendada ureemiliste toksiinide arvu, on kroonilise neeruhaigusega patsientidega tehtud uuringuid piiratud [14].
Ühes uuringus, mis viidi läbi juba dialüüsi saavate kroonilise neeruhaigusega inimestega, täheldati ureemiliste toksiinide sisalduse vähenemist pärast 6-nädalast kõrge amüloosisisaldusega maisitärklise tarbimist [20]. Kõrge amüloosisisaldusega maisitärklis on kuivmassist ~ 60 protsenti resistentne tärklis, samas kui selles ettepanekus kasutatav RPS on ~ 70 protsenti resistentne tärklis ja ~ 10 protsenti muud toidukiud [17]. Siin viime läbi 2- perioodi randomiseeritud topeltpimeda ristuuringu, et uurida, kas RPS-i tarbimine täiendava ravina vastavalt praegustele kroonilise neeruhaiguse ravi standarditele vähendab ureemilisi toksiine ja sümptomeid, muutes soolestiku mikrobiootat patsientidel, kellel on CKD.
Selle uuringu tulemused täiendavad tõendeid RPS-i efektiivsuse kohta kroonilise neeruhaigusega patsientidel ja on aluseks suuremale mitmekeskuselisele randomiseeritud kontrollitud uuringule, milles testitakse RPS-i mõju kroonilise neeruhaiguse progresseerumise edasilükkamisele ja dialüüsi alustamisele.
Andmehaldus
Lähteandmed
Algdokumendid on koht, kus andmed esmakordselt salvestatakse ja millest saadakse osalejate CRF-andmed. CRF-i kirjeid käsitletakse lähteandmetena, kui CRF-i asukoht on algse salvestuse koht (nt puudub muu kirjalik või elektrooniline andmesalvestis). Kõiki dokumente säilitatakse turvaliselt ja konfidentsiaalsetes tingimustes. Kõigil uuringupõhistel dokumentidel, välja arvatud allkirjastatud nõusolekuvormid, põhiloend ja tasuvormid, viidatakse osalejale katses osaleja koodi, mitte nime järgi.
Juurdepääs andmetele
Otsene juurdepääs antakse sponsori, vastuvõtva asutuse ja reguleerivate asutuste volitatud esindajatele, et võimaldada katsetega seotud jälgimist, auditeid ja inspekteerimisi.
Andmete salvestamine ja arvestuse pidamine
Kõik katseandmed sisestatakse paberkandjal CRF-ist või kogutakse Manitoba ülikooli REDCapi platvormi kaudu ja muud algdokumendid sisestatakse sellesse REDCapi andmebaasi. Osalejad identifitseeritakse selles REDCapi andmebaasis ainulaadse katsespetsiifilise numbri ja/või koodiga. Osaleja nime ja muud isikut tuvastavat teavet ei lisata REDCapi andmebaasi, välja arvatud allkirjastatud teadliku nõusoleku vorm, töötasu vorm ja õppetöö põhinimekiri. Osaleja kodu- ja e-posti aadressid ning telefoninumbrid kogutakse ja seotakse uuringu ID ja osaleja nimega füüsilises/elektroonilises õppetöö põhiloendis, mida kasutatakse katsetegevuse koordineerimiseks, nagu õppematerjalide kojutoomine, töötasu tšekid ja suhtlus osalejatega kohtuprotsessi ajal. See põhiloend salvestatakse CDIC-i lukustatud kappi või CDIC-i parooliga kaitstud jagatud draivi/arvutisse. Osalejate nimed ja aadressid jagatakse kohaletoimetamise ajal kohaletoimetajatele või kulleritele, samuti kasutatakse neid tasutšekkide postitamiseks osalejatele, kes isiklikult järgi ei tule.
Katseandmeid, ilma osalejate isikuandmeid tuvastamata, salvestatakse Manitoba ülikooli turvalises uurimiskeskkonnas REDCapi abil. REDCapi rakendab kohapeal Manitoba ülikooli George & Fay Yee tervishoiu innovatsioonikeskuse Data Science platvorm. Virtuaalsed õppekülastused viiakse läbi Manitoba ülikooli Microsoft Teamsi platvormi kaudu, mis on väliselt hostitud pilvepõhine teenus. Elektroonilised andmed koos osaleja isikuandmetega, nagu nimi ja kontaktandmed, kaitstakse parooliga ja salvestatakse CDIC-i arvutis Exceli faili. Allkirjastatud nõusolekuvormide elektroonilised kirjed salvestatakse REDCapis, samuti CDIC-i parooliga kaitstud turvalises arvutis/jagatud draivis või lukustatud kapis. Paberkandjal allkirjastatud nõusolekuvorme hoitakse CDIC-s lukustatud kapis. Ülejäänud uuringupäevikud korraldatakse tugevasse sideainesse ja neid hoitakse CDIC-s. CDIC on turvatud 24 tundi ööpäevas ja sellele on juurdepääs piiratud.
Kõiki katseuuringute andmeid säilitatakse 25 aastat. Paberkandjal CRF-e ja lähteandmeid hoitakse lukustatud säilituskonteineris, välja arvatud CDIC-is mis tahes isikut tuvastav teave. Paberfailid hävitatakse CDIC-is konfidentsiaalsete dokumentide hävitamise meetodil.

Elektroonilised andmed deidentifitseeritakse ja neid säilitatakse 10 aastat pärast uuringu lõppu. Elektroonilisi andmeid võib avaldamise eesmärgil jagada ka identifitseerimata kujul akadeemiliste ajakirjadega. Andmeid võib säilitada akadeemiline ajakiri või muud avatud juurdepääsuga hoidlad avatud juurdepääsu poliitika alusel, sel juhul võivad teised teadlased neid edasiseks andmeanalüüsi ja uurimistöö eesmärgil kasutada. Paberfailid hävitatakse konfidentsiaalse dokumendi hävitamise meetodil.
Kohtumenetluse lõpetamise kriteeriumid
Uuringut jätkatakse seni, kuni kõik värvatud osalejad on jõudnud oma järelkontrolli lõpuni ning andmed on kogutud, töödeldud ja puhastatud. Ennetähtaegset lõpetamist ei ole plaanis.
Puuduvate, kasutamata ja võltsandmete arvestamise kord
Puuduvate väärtuste arv ja osakaal dokumenteeritakse kliinilise uuringu aruandes. Puuduvaid väärtusi ei imputeerita, kui pole märgitud teisiti. Analüüsid välistavad andmed osalejatelt, kellel puuduvad analüüsi jaoks vajalikud muutujad.
Kui täheldatakse, et andmed on ebatavalised viisil, mida ei saa seletada või ekslikuks pidada, võidakse analüüse korrata pärast asjaomase kirje väljajätmist. Need täiendavad analüüsid esitatakse tundlikkusanalüüsidena.
Esialgsest statistilisest plaanist kõrvalekaldumise(te)st teatamise kord
Kõik kliiniliste uuringute andmebaasis dokumenteeritud protokolli kõrvalekalded esitatakse tabelina (vajaduse korral) ja loetletakse kliinilise uuringu aruandes.
Kõrvaltoimete registreerimine
Arvestades sekkumise olemust, on väga ebatõenäoline, et uuringuga seostuvad kõrvalnähud. Kuid kõik uuringu ajal ilmnenud kõrvaltoimed, mida uurijad on täheldanud või millest osaleja on teatanud, salvestatakse CRF-i, olenemata sellest, kas need on seotud uuringusse sekkumisega või mitte.
Salvestatakse järgmine teave: kirjeldus, algus- ja lõppkuupäev, raskusaste ja katsesekkumisega seotuse hinnang. Vajadusel tuleks esitada järelteave. Kui teatatakse mis tahes kõrvaltoimest, pakutakse patsientidele vastuvõttu järgmisel võimalikul kliinikuvisiidil või 1 nädala jooksul, olenevalt sellest, kumb on varasem, ning jälgimist jätkatakse kliinikus, kuni kõrvaltoime on lahenenud.
Sündmuste tõsidust hinnatakse järgmisel skaalal: 1=kerge, 2=keskmine ja 3=raske.
Kvalifitseeritud uurija hinnangul katsesekkumisega seotuks peetavaid kõrvaltoimeid jälgitakse kuni lahenemiseni või sündmust peetakse stabiilseks. Kui kõrvaltoimed põhjustavad uuringust loobumise, jälgitakse kõrvaltoimete taandumiseni ka patsiente, kes eemaldatakse ravi kõrvaltoime tõttu.
Ohutusaruandlus
Uurimisrühm teatab kõrvaltoimetest Health Canadale ja asjaomaste osakonna/asutuste juhtidele ning Manitoba ülikooli REB-le, kasutades asjakohaseid aruandevorme.
Kvaliteedi tagamise protseduurid
Katse viiakse läbi praegu heakskiidetud protokolli, GCP, asjakohaste eeskirjade ja standardsete tööprotseduuride alusel.
Regulaarset seiret võib läbi viia vastavalt GCP-le. Andmeid võidakse hinnata protokollile vastavuse ja algdokumentide õigsuse suhtes. Järgides kirjalikke standardseid tööprotseduure, kontrollivad monitorid, et kliiniline uuring viiakse läbi ja andmed genereeritakse, dokumenteeritakse ja esitatakse vastavalt protokollile, GCP-le ja kohaldatavatele regulatiivsetele nõuetele.
Lühendid
AE: kõrvaltoime; AR: kõrvaltoime; PI: juhtivteadur; CRA: kliinilise uurimistöö kaastöötaja; CRF: juhtumiaruande vorm; GCP: hea kliiniline tava; CT: kliinilised uuringud; ICF: teadliku nõusoleku vorm; REB: Teaduseetika Nõukogu; SAE: tõsine kõrvaltoime; SOP: standardne tööprotseduur
Tänuavaldused
Soovime tunnustada ja tänada Michelle DiNellat, Sarah Curtist ja CDIC töötajaid selle uuringu ettevalmistamise toetamise eest.
Helsingi deklaratsioon
Uurija/QI tagab, et see uuring viiakse läbi Helsingi deklaratsiooni põhimõtete kohaselt. NB. 2008. aasta Helsingi deklaratsioon sisaldab üksikasjalikku teavet selle kohta, mis peab protokollis sisalduma: rahastamine, sponsorlus, seotus ja võimalikud huvide konfliktid, osalemise stiimulid, kahju hüvitamine ning juurdepääs uimastitele ja hooldusele pärast katsetamist.
Aruandlus
Uurija/QI esitab kord aastas kogu kliinilise uuringu vältel Manitoba ülikooli terviseuuringute eetikanõukogule iga-aastase eduaruande. Lisaks esitatakse Manitoba ülikooli terviseuuringute eetikanõukogule ja Health Canadale teade prooviperioodi lõpust.
Osalejate konfidentsiaalsus
Proovitöötajad tagavad osalejate anonüümsuse säilimise. Osalejad identifitseeritakse ainult osaleja ID-numbri järgi kõikidel katsedokumentidel ja kõigis elektroonilistes andmebaasides, välja arvatud teadliku nõusoleku vorm, põhinimekiri ja tasu vorm. Kõiki dokumente hoitakse turvaliselt ja neile pääsevad juurde ainult proovitöötajad ja volitatud töötajad. Katse järgib Manitoba isiku terviseteabe seadust (PHIA) või teabevabaduse ja eraelu puutumatuse kaitse seadust (FIPPA).
Prooviperiood
See prooviperiood algab värbamisega 2021. aasta septembris ja kestab umbes 2022. aasta märtsini. Praegune protokolli number ja kuupäev on versioon 3, 13. juuni 2021.

Koordineeriva keskuse koosseis, rollid ja kohustused
Järelevalve eest vastutavad PI (dr. Mackay) ja kaas-uurijad (dr. Tangri ja Mollard). Doktorant ja teadustöö koordinaator töötavad koos uuringu igapäevasel läbiviimisel, sealhulgas värbamise, sõelumise, ajakava, osalejate külastuste, andmete kogumise ja andmete sisestamise kallal. Ph.D. üliõpilane annab aru otse PI-le (dr. Mackay) ja uurimistöö koordinaator on igapäevaselt ühenduses neid jälgiva kaasuurijaga (dr. Mollard). Andmete analüüsimise eest vastutab andmeanalüütik Dr. Mackay ja Tangri. Projekti arutatakse CDIC üldise uurimisrühmaga kliinilise rühma koosolekul iga kahe nädala järel ja iga kahe nädala tagant toimuvatel kohtumistel projekti uurimisrühmaga, et arutada konkreetseid projekti üksikasju.
Autorite kaastööd
MS abistas käsikirja koostamisel ning teistelt autoritelt tagasiside ja muudatuste koostamisel. KK abistas käsikirja retsenseerimisel. HW otsis eetilist heakskiitu ja aitas kaasa käsikirjale. RM, NT ja DM koostasid uuringuprotokolli ja osalejate valikukriteeriumid, otsisid rahastamist ja eetilist heakskiitu, abistasid käsikirjade muutmisel ja vaatasid käsikirja üle. Kõik autorid panustasid, lugesid, tegid kriitilisi parandusi ja kinnitasid lõpliku käsikirja enne esitamist.
Rahastamine
Seda uuringut rahastavad Weston Family Microbiome Initiative ja Seven Oaksi haigla krooniliste haiguste innovatsioonikeskus. Selles katses kasutatud ravitooteid pakub MSPrebiotic Inc. tasuta. Rahastajad ei osale proovitöö kavandamises, läbiviimises, andmete analüüsis ega avaldamises. Katse sponsor on Manitoba ülikool, mille kontaktisik on Dylan MacKay.
Andmete ja materjalide kättesaadavus
Sellest uuringust tulenevad väljaanded järgivad ICMJE autorsuse soovitusi. Selle uuringu tulemused avaldatakse eelretsenseeritavas väljaandes ja neid võidakse tutvustada konverentsidel. Selle uuringu kokkuvõtlikud tulemused laaditakse üles uuringu ClinicalTrials.gov registrisse. Deidentifitseeritud andmed tehakse mõistliku taotluse korral kättesaadavaks teistele teadlastele teadmiste sünteesiks.
Deklaratsioonid
Eetiline kinnitus ja nõusolek osaleda
Kanadas Manitobas Winnipegis asuv Bannatyne Campuse biomeditsiiniuuringute eetikanõukogu (BREB) kiitis selle uuringuprotokolli heaks (HS23161 (B2019:089). Kõik selle uuringu protokolli muudatused on läbi vaadanud ja heaks kiitnud M BREBi U. ning muudatused protokolli värskendatakse saidil ClinicalTrials.gov. Health Canada on väljastanud selle uuringu autoriseerimise teatise (faili nr 250522). Osalejad peavad enne uuringuspetsiifiliste protseduuride läbiviimist isiklikult allkirjastama teadliku nõusoleku vormi viimase heakskiidetud versiooni ja kuupäeva See uuring on registreeritud saidil ClinicalTrials.gov (NCT04961164).
Nõusolek avaldamiseks
Kõik osalejad annavad nõusoleku avaldada või esitada uuringu käigus kogutud teavet viisil, kus nende isikuandmeid, nagu nimi, aadress ja telefoninumber, ei avaldata.
Konkureerivad huvid
Kõik teised autorid kinnitavad, et neil puuduvad konkureerivad huvid.
Autori üksikasjad
1 Krooniliste haiguste innovatsioonikeskus, Seven Oaksi üldhaigla, Winnipeg, MB, Kanada. 2 Inimese toitumisteaduste osakond, Manitoba ülikool, Winnipeg, MB, Kanada. 3 Manitoba ülikooli kogukonna terviseteaduste osakond, Winnipeg, MB, Kanada. 4 Max Rady Meditsiinikolledž, Manitoba Ülikool, Winnipeg, MB, Kanada.
Viited
1. Arora P, Vasa P, Brenner D, Iglar K, McFarlane P, Morrison H jt. Kroonilise neeruhaiguse levimuse hinnangud Kanadas: riiklikult esindusliku uuringu tulemused. CMAJ. 2013;185(9):E417–23.
2. Ng JK, Li PK. Kroonilise neeruhaiguse epideemia: kuidas sellega toime tulla? Nefroloogia (Carlton). 2018; 23 (lisa 4): 116–20. PMID: 30298662.
3. Fujii H, Kono K, Nishi S. Kroonilise neeruhaiguse koronaararterite haiguse tunnused. Clin Exp Nephrol. 2019;23(6):725–32.
4. Collister D, Ferguson T, Komenda P, Tangri N. Kroonilise neeruhaiguse progresseerumise mustrid, riskifaktorid ja prognoosimine: narratiivne ülevaade. Semin Nephrol. 2016;36(4):273–82. PMID: 27475658.
5. Beaudry A, Ferguson TW, Rigatto C, Tangri N, Dumanski S, Komenda P. Cost of dialysis therapy by modality in Manitoba. Ameerika nefroloogiaühingu kliiniline ajakiri. 2018;13(8):1197–203. PMID: 30021819.
6. Aronov PA, Luo FJG, Plummer NS, Quan Z, Holmes S, Hostetter TH jt. Käärsoole panus ureemilistesse lahustunud ainetesse. J Am Soc Nephrol. 2011;22(9):1769–76. PMID: 21784895.
7. Ramezani A, Massy ZA, Meijers B, Evenepoel P, Vanholder R, Raj DS. Soolestiku mikrobiomi roll ureemias: potentsiaalne terapeutiline sihtmärk. American Journal of Kidney Diseases. 2016;67(3):483–98. PMID: 26590448.
8. Simonsen E, Komenda P, Lerner B, Askin N, Bohm C, Shaw J jt. Ureemilise sügeluse ravi: süstemaatiline ülevaade. Olen J Kidney Dis. 2017; 70(5):638–55. PMID: 28720208.
9. Meijers BK, et al. P-kresool ja kardiovaskulaarne risk kerge kuni mõõduka neeruhaiguse korral. Clin J Am Soc Nephrol. 2010;5(7):1182–9. PMID: 20430946.
10. Gao H, Liu S. Ureemilise toksiini indoksülsulfaadi roll südame-veresoonkonna haiguste progresseerumisel. Elu teadused. 2017;185:23–9. PMID: 28754616.
11. Lisowska-Myjak B. Ureemilised toksiinid ja nende mõju mitmele elundisüsteemile. Nephron Clini praktika. 2014;128(3-4):303–11. PMID: 25531673.
12. Schulman G, Berl T, Beck GJ, Remuzzi G, Ritz E, Arita K jt. AST-120 randomiseeritud platseebokontrollitud EPPIC uuringud kroonilise neeruhaiguse korral. J Am Soc Nephrol. 2015; 26(7):1732–46. PMID: 25349205.
13. Hung SC, Kuo KL, Wu CC, Tarng DC. Indoksüülsulfaat: uus kardiovaskulaarne riskitegur kroonilise neeruhaiguse korral. American Heart Associationi ajakiri. 2017;6(2):e005022. PMID: 28174171.
14. Snelson M, Kellow NJ, Coughlan MT. Soolestiku mikrobiota moduleerimine resistentse tärklise abil krooniliste neeruhaiguste ravina: tõendid tõhususe ja mehaaniliste teadmiste kohta. Adv Nutr. 2019;10(2):303–20. PMID: 30668615.
15. Birkett A, Muir J, Phillips J, Jones G, O'Dea K. Resistentne tärklis alandab inimestel ammoniaagi ja fenoolide kontsentratsiooni väljaheites. Olen J Clin Nutr. 1996; 63(5):766–72. PMID: 8615362.
16. Smith EA, Macfarlane GT. Inimese käärsoole bakterite loend, mis toodavad fenoolseid ja indoolseid ühendeid: pH, süsivesikute kättesaadavuse ja retentsiooniaja mõju dissimileerivale aromaatsete aminohapete metabolismile. J Appl Bacteriol. 1996;81(3):288–302. PMID: 8810056.
17. Alfa MJ, Strang D, Tappia PS, Graham M, van Domselaar G, Forbes JD jt. Randomiseeritud uuring, et teha kindlaks seedimiskindla tärklise koostise mõju soolestiku mikrobioomile vanematel ja keskealistel täiskasvanutel. Clin Nutr. 2018;37(3):797–807.
18. Baxter NT, Schmidt AW, Venkataraman A, Kim KS, Waldron C, Schmidt TM jt. Inimese soolestiku mikrobiota ja lühikese ahelaga rasvhapete dünaamika vastuseks dieedi sekkumistele kolme kääritatava kiudainega. MBio. 2019. PMID: 30696735;10(1):e02566–18.
19. Losel D, Claus R. Dieedis sisalduva resistentse kartulitärklise annusest sõltuv mõju skatooli moodustumisele soolestikus ja sigade rasvkoe akumulatsioonile. J Vet Med A Physiol Pathol Clin Med. 2005;52(5):209–12. PMID: 15943603.
20. Sirich TL, Plummer NS, Gardner CD, Hostetter TH, Meyer TW. Toidukiudude suurendamise mõju käärsoolest pärinevate lahustunud ainete plasmatasemele hemodialüüsi saavatel patsientidel. Clin J Am Soc Nephrol. 2014;9(9):1603–10. PMID: 25147155.
21. Pretorius CJ, McWhinney BC, Sipinkoski B, Johnson LA, Rossi M, Campbell KL jt. Seerumi vaba ja kogu indoksüül- ja p-kresüülsulfaadi võrdlusvahemikud ja bioloogiline varieeruvus mõõdetuna kiire UPLC fluorestsentstuvastusmeetodiga. Clin Chim Acta. 2013;419:122–6. PMID: 23428591.
22. Magoc T, Salzberg SL. FLASH: lühikeste lugemiste kiire pikkuse reguleerimine, et parandada genoomikomplekte. Bioinformaatika. 2011;27(21):2957–63. PMID: 21903629.
23. Edgar RC. UPARSE: väga täpsed OTU järjestused mikroobide amplikoni lugemisest. Nat meetodid. 2013;10(10):996–8. PMID: 23955772.
24. Edgar RC. Otsige ja rühmitage suurusjärku kiiremini kui BLAST. Bioinformaatika. 2010;26(19):2460–1. PMID: 20709691.
25. Caporaso JG, Bittinger K, Bushman FD, DeSantis TZ, Andersen GL, Knight R. PyNAST: paindlik tööriist järjestuste joondamiseks malli joondamiseks. Bioinformaatika. 2010;26(2):266–7. PMID: 19914921.
26. Caporaso JG, Kuczynski J, Stombaugh J, Bittinger K, Bushman FD, Costello EK jt. QIIME võimaldab analüüsida suure läbilaskevõimega kogukonna järjestusandmeid. Nat meetodid. 2010;7(5):335–6. PMID: 20383131.
27. Hind MN, Dehal PS, Arkin AP. FastTree 2 – ligikaudu maksimaalse tõenäosusega puud suurte joonduste jaoks. PLOS ÜKS. 2010;5(3):e9490. PMID: 20224823.
28. Paulson JN, Stine OC, Bravo HC, Pop M. Diferentsiaalne arvukuse analüüs mikroobide marker-geeniuuringute jaoks. Looduse meetodid. 2013;10(12):1200. PMID: 24076764–2.
29. Jari Oksanen FGB, Friendly M, Kindt R, Legendre P, McGlinn D, Minchin PR jt. Vegan pakett, ühenduse ökoloogia paketis; 2019.
30. Galili T. dendextend: R-pakett hierarhilise klastrite puude visualiseerimiseks, kohandamiseks ja võrdlemiseks. Bioinformaatika. 2015;31(22):3718–20. PMID: 26209431.
31. Gu Z, Eils R, Schlesner M. Komplekssed soojuskaardid näitavad mustreid ja korrelatsioone mitmemõõtmelistes genoomiandmetes. Bioinformaatika. 2016;32(18): 2847–9. PMID: 27207943.
32. Morgan XC, Tickle TL, Sokol H, Gevers D, Devaney KL, Ward DV jt. Soole mikrobiomi düsfunktsioon põletikulise soolehaiguse ja ravi korral. Genome Biol. 2012;13(9):R79. PMID: 23013615.
33. Faust K, Sathirapongsasuti JF, Izard J, Segata N, Gevers D, Raes J jt. Mikroobide koosesinemise suhted inimese mikrobioomis. PLoS Comput Biol. 2012;8(7):e1002606. PMID: 22807668
Väljaandja märkusSpringer Nature jääb avaldatud kaartide ja institutsionaalsete seoste suhtes erapooletuks.
【Lisateabe saamiseks: david.deng@wecistanche.com / WhatApp:86 13632399501】
